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Phenylmethanesulfonyl fluoride (PMSF)

PMSF

Company: Sigma-Aldrich
Catalog#: PMSF-RO
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Tandem Purification of His6-3x FLAG Tagged Proteins for Mass Spectrometry from Arabidopsis
Author:
Date:
2016-12-05
[Abstract]  Tandem affinity purification is a powerful method to identify protein complexes that function in association with a known gene of interest. This protocol describes a methodology to capture proteins tagged with His6-3x FLAG explicitly for the purpose of on-bead digestion and identification by mass spectrometry. The high sensitivity and specificity of our methods allow for purification of proteins expressed at native levels from endogenous promoters to enable uncovering the functional roles of plant protein complexes. [摘要]  串联亲和纯化是识别与已知感兴趣基因相关联的蛋白质复合物的有力方法。 该方案描述了一种用于捕获用His6-3x FLAG标记的蛋白质的方法,用于通过质谱法进行珠粒消化和鉴定。 我们的方法的高灵敏度和特异性允许从内源启动子纯化以天然水平表达的蛋白质,以揭示植物蛋白复合物的功能作用。
【背景】蛋白质复合物作为信号平台,分子机器和构建细胞生命的支架。鉴定蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)或蛋白质复合物的组成对于提供对基因生物化学功能的了解是非常重要的。因此,需要了解发现PPI的简便方法,以了解基因型如何决定植物中的表型。
通常使用的蛋白质纯化方法包括色谱法,例如大小排阻色谱法(也称为凝胶过滤),离子交换层析和亲和层析。通常需要组合几种不同的色谱方法以达到足够的纯度以鉴定相关的复合物。最近,亲和纯化与质谱联用(AP-MS)已经成为系统地鉴定体内蛋白质 - ...

Separation of Free and Bound cAMP in Mycobacteria
Author:
Date:
2016-07-20
[Abstract]  Mycobacterial genomes encode a plethora of genes that are involved in the synthesis, utilization and degradation of cAMP. The genome of M. tuberculosis H37Rv, for example, encodes 16 adenylyl cyclases and 10 genes harbouring the cyclic nucleotide-binding (CNB) domain (Shenoy and Visweswariah, 2006). Cyclic AMP is efficiently secreted by mycobacteria, and cytosolic as well as extracellular levels of cAMP can reach hundreds of micromolar. We have recently reported that an abundantly expressed universal stress protein (USP; Rv1636 in M. tuberculosis H37Rv and MSMEG_3811 in M. smegmatis, respectively) binds cAMP (Banerjee et al., 2015). Given the number of cAMP-binding proteins present in mycobacteria, it is expected that a significant fraction of ... [摘要]  分枝杆菌基因组编码涉及cAMP的合成,利用和降解的大量基因。例如,结核分枝杆菌H37Rv的基因组编码16个腺苷酸环化酶和10个携带环核苷酸结合(CNB)结构域的基因(Shenoy和Visweswariah,2006)。循环AMP由分枝杆菌有效分泌,细胞溶质以及细胞外cAMP水平可达数百微摩尔。我们最近报道,大量表达的普遍应激蛋白(USP; Rv1636在结核分枝杆菌H37Rv和MSMEG_3811分别在耻垢分枝杆菌中)分别结合cAMP(Banerjee等,2015)。鉴于存在于分枝杆菌中的cAMP结合蛋白的数量,预期细胞内cAMP的显着部分可能与蛋白质结合。通常用于测量cAMP的方法是放射免疫测定(RIA)和ELISA。然而,这些方法包括将cAMP“结合”解离成蛋白质的样品的预先酸化,因此代表样品中存在的“总”cAMP。在本协议中,我们描述了一种将cAMP'结合'蛋白质与蛋白质“自由”分离或与蛋白质不相关的方法。这通过使细胞溶质级分或培养物上清液通过具有3kDa截止值的膜过滤来进行。只有'自由'cAMP才能通过膜。因此,滤液中的cAMP浓度代表样品中的“游离”cAMP。原始细胞溶质级分或培养上清液中的环AMP水平代表“总”cAMP浓度。从“总”中减去“自由”提供了与蛋白质结合的cAMP量。

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