| An Assay to Determine Phagocytosis of Apoptotic Cells by Cardiac Macrophages and Cardiac Myofibroblasts
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Author:
Date:
2017-09-20
[Abstract] In myocardial infarction (MI), a number of cardiomyocytes undergo apoptosis. These apoptotic cardiomyocytes are promptly engulfed by phagocytes. If the dead cells are not engulfed, their noxious contents are released outside, resulting in induction of inflammation. Therefore, the removal of these dead cells is necessary. However, the contribution of each phagocyte type to the removal of apoptotic cells in infarcted hearts remains unresolved. Here, we describe an in vitro protocol for a phagocytosis assay to compare the engulfment ability of cardiac macrophages and cardiac myofibroblasts.
[摘要] 在心肌梗死（MI）中，许多心肌细胞凋亡。 这些凋亡心肌细胞被吞噬细胞迅速吞噬。 如果死细胞没有被吞没，其有害物质被释放到外面，导致炎症的诱导。 因此，需要去除这些死细胞。 然而，每个吞噬细胞类型对梗塞心脏中凋亡细胞的去除的贡献仍未解决。 在这里，我们描述了吞噬作用测定的体外方案来比较心脏巨噬细胞和心脏肌成纤维细胞的吞噬能力。
【背景】长期以来一直认为，心脏巨噬细胞消除了失败的心脏中产生的凋亡细胞。 然而，我们发现负责组织纤维化的心脏肌成纤维细胞也具有在MI后吞噬凋亡细胞的能力（Nakaya等，2017）。 这一发现促使我们比较心脏巨噬细胞和心脏肌成纤维细胞的吞噬能力。 在这里，我们提供了一个详细的体外吞噬试验方案来评估吞噬吞噬的程度。
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| Efficient Generation of Multi-gene Knockout Cell Lines and Patient-derived Xenografts Using Multi-colored Lenti-CRISPR-Cas9
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Author:
Date:
2017-04-05
[Abstract] CRISPR-Cas9 based knockout strategies are increasingly used to analyze gene function. However, redundancies and overlapping functions in biological signaling pathways can call for generating multi-gene knockout cells, which remains a relatively laborious process. Here we detail the application of multi-color LentiCRISPR vectors to simultaneously generate single and multiple knockouts in human cells. We provide a complete protocol, including guide RNA design, LentiCRISPR cloning, viral production and transduction, as well as strategies for sorting and screening knockout cells. The validity of the process is demonstrated by the simultaneous deletion of up to four programmed cell death mediators in leukemic cell lines and patient-derived acute lymphoblastic leukemia xenografts, in which ...
[摘要] 基于CRISPR-Cas9的敲除策略越来越多地用于分析基因功能。然而，生物信号通路中的冗余和重叠功能可能需要产生多基因敲除细胞，这仍然是一个相对费力的过程。在这里，我们详细介绍了多色LentiCRISPR载体在人体细胞中同时产生单次和多次敲除的应用。我们提供了一个完整的方案，包括指导RNA设计，LentiCRISPR克隆，病毒生产和转导，以及排序和筛选敲除细胞的策略。该过程的有效性通过同时删除白血病细胞系中多达四个程序性细胞死亡介质和来自患者来源的急性淋巴细胞白血病异种移植物，其中单细胞克隆是不可行的。该协议允许任何具有基本细胞生物学设备的实验室，生物安全2级设备和荧光激活细胞分选功能，可在一个月内有效产生单基因和多基因敲除细胞系或原代细胞。
从对细菌基因组中被称为聚簇定期交织的短回文重复（CRISPR）的遗传元件的好奇的初步观察开始（Ishino等人，1987; Mojica等人，2000 ）和随后在哺乳动物细胞中的基因编辑（Cong等人，2013; Mali等人，2013），CRISPR-Cas9已经成为廉价和有效的基因编辑。随着从烟草植物细胞到斑马鱼和原代人类细胞（Hsu等人，2014）的细胞系统的成功应用，CRISPR-Cas9可以通过短的20个核苷酸RNA序列的设计来引导在大基因组内的靶向DNA双链断裂（DSB）（Park等人，2016）。 ...
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| Mouse Model of Reversible Intestinal Inflammation
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Author:
Date:
2017-03-20
[Abstract] Current therapies to treat inflammatory bowel disease by dampening excessive inflammatory immune responses have had limited success (Reinisch et al., 2011; Rutgeerts et al., 2005; Sandborn et al., 2012). To develop new therapeutic interventions, there is a need for better understanding of the mechanisms that are operative during mucosal healing (Pineton de Chambrun et al., 2010). To this end, a reversible model of colitis was developed in which colitis induced by adoptive transfer of naïve CD4+ CD45RBhi T cells in lymphopenic mice can be reversed through depletion of colitogenic CD4+ T cells (Brasseit et al., 2016).
[摘要] 目前通过抑制过度炎症免疫应答治疗炎症性肠病的治疗方法取得了有限的成功（Reinisch等人，2011; Rutgeerts等人，2005; Sandborn等人[ et al。，2012）。为了开发新的治疗干预措施，需要更好地了解粘膜愈合期间手术的机制（Pineton de Chambrun等，2010）。为此，开发了一种可逆模型的结肠炎，其中通过淋巴细胞小鼠中过早转移原始CD4 + / CD40RB T细胞诱导的结肠炎可以通过消除结肠发生CD4 + T细胞（Brasseit等，2016）。
背景随着发展旨在重现人类疾病的动物模型，我们对肠道炎症性肠疾病（IBD）的发病机制的理解已经大大改善（Khanna等人）。 ，2014）。尽管鉴定了广泛的免疫学目标，目前的治疗方法在治疗IBD方面取得的成功有限，而且有关知识可用于建立长期缓解和相关粘膜愈合时引起的机制（D'Haens >等，，2014）。到目前为止，一个主要的限制是缺乏动物模型，其中可以在具有既定疾病的动物中可再现地诱导缓解。在感染引起肠道炎症的模型中，促炎和抗炎机制可以同时运作，这意味着在解决炎症期间解剖不同免疫途径的作用可能是一个挑战（Endt等人。 ，2010; ...
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