| A Quantitative Heterokaryon Assay to Measure the Nucleocytoplasmic Shuttling of Proteins
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Many proteins appear exclusively nuclear at steady-state but in fact shuttle continuously back and forth between the nucleus and the cytoplasm. For example, nuclear RNA-binding proteins (RBPs) often accompany mRNAs to the cytoplasm, where they can regulate subcellular localization, translation and/or decay of their cargos before shuttling back to the nucleus. Nucleocytoplasmic shuttling must be tightly regulated, as mislocalization of several RBPs with prion-like domains such as FUS and TDP-43 causes the cytoplasmic accumulation of solid pathological aggregates that have been implicated in neurodegenerative diseases such as amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal dementia (FTD). Traditionally, interspecies heterokaryon assays have been used to determine whether a nuclear ...
[摘要] 许多蛋白质在稳态下仅出现核，但事实上在细胞核和细胞质之间连续地来回穿梭。例如，核RNA结合蛋白（RBP）通常伴随mRNA到达细胞质，在那里它们可以在穿梭回到细胞核之前调节其货物的亚细胞定位，翻译和/或腐烂。必须严格调节核质穿梭，因为几种RBP与朊病毒样结构域如FUS和TDP-43的错误定位导致固体病理性聚集体的细胞质积累，这些聚集体与肌萎缩侧索硬化症（ALS）和额颞叶痴呆等神经退行性疾病有关。 （FTD）。传统上，种间异核体分析已被用于确定感兴趣的核蛋白是否穿梭;这些分析是基于来自两个不同物种（例如，小鼠和人类）的供体和受体细胞之间的融合，可以根据不同的染色质染色模式区分，并检测蛋白质的外观。受体核。然而，异核体的鉴定需要经验并且容易出错，这使得难以获得用于定量研究的高质量数据。此外，荧光标记的RBP在供体细胞中的瞬时过表达通常导致其异常的亚细胞定位。在这里，我们提出定量测定，其中表达接近生理水平的eGFP标记的RBP的稳定供体细胞系与表达膜标记物CAAX-mCherry的受体细胞融合，允许容易地鉴定和成像大量高可信度异核体。我们的测定法可用于测量任何感兴趣的核蛋白在不同细胞类型，不同细胞条件下或突变蛋白之间的穿梭活性。
【背景】要了解蛋白质的各种功能，重要的是找出它在细胞内定位的位置。标准的微观和生物化学方法仅在其稳态浓度高于检测阈值时才揭示蛋白质的存在。他们不排除它在短暂地定位的情况下扮演其他重要角色的可能性（Gama-Carvalho和Carmo-Fonseca，2001）。例如，许多RBP在不同的细胞区室中发挥作用，它们伴随着它们的结合mRNA（通常未检测到）并连接真核基因表达的多个步骤（Müller-McNicoll和Neugebauer，2013）。 ...
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| Generation of Luciferase-expressing Tumor Cell Lines
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Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract] Murine tumor models have been critical to advances in our knowledge of tumor physiology and for the development of effective tumor therapies. Essential to these studies is the ability to both track tumor development and quantify tumor burden in vivo. For this purpose, the introduction of genes that confer tumors with bioluminescent properties has been a critical advance for oncologic studies in rodents. Methods of introducing bioluminescent genes, such as firefly luciferase, by viral transduction has allowed for the production of tumor cell lines that can be followed in vivo longitudinally over long periods of time. Here we describe methods for the production of stable luciferase expressing tumor cell lines by lentiviral transduction.
[摘要] 鼠肿瘤模型对于我们对肿瘤生理学知识和有效肿瘤治疗方法发展的进展至关重要。 这些研究的关键是能够跟踪肿瘤发展并量化体内肿瘤负荷。 为此，引入赋予肿瘤生物发光特性的基因已经成为啮齿动物肿瘤研究的重要进展。 通过病毒转导引入生物发光基因（例如萤火虫萤光素酶）的方法已经允许产生可以在体内纵向长时间地进行的肿瘤细胞系。 在这里我们描述了通过慢病毒转导产生稳定表达荧光素酶的肿瘤细胞系的方法。
【背景】体内跟踪细胞最重要的是能够通过微创方法从外部检测它们。使用来自萤火虫的荧光素酶（Photinus pyralis ）的酶促生物发光是用于体内基于图像的细胞追踪的广泛使用的方法。生物发光已被用于各种体内应用，包括报告基因表达的无创成像（Herschman，2004），研究昼夜节律（Southern and Millar，2005），成像脑卒中（Vandeputte
萤火虫荧光素酶氧化物萤光素在分子氧，镁和三磷酸腺苷存在下在560nm产生黄绿色光（Wilson和Hastings，1998; ...
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| Design of a Transcription-based Secretion Activity Reporter (TSAR) for the Type III Secretion Apparatus of Shigella flexneri and Uses Thereof
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Date:
2014-10-20
[Abstract] Many gram-negative bacterial pathogens, including Shigella flexneri, are able to translocate bacterial proteins, dubbed effectors, across the host cell plasma membrane into the host cell cytosol using a syringe-like structure, the type three secretion apparatus (T3SA). While some bacteria use their T3SA to modulate their phagosomal environment (Salmonella spp.), establish pedestal structure to form microcolonies on the plasma membrane (Enteropathogenic Escherichi coli) or lyse their entry vacuole (Shigella spp.), they all have in common a tightly regulated activity of their T3SA. However, the tracking of the activity of the T3SA in infected cells and tissue has been difficult to perform. Using the property of MxiE-dependent promoters that are ...
[摘要] 包括灵芝氏菌在内的许多革兰氏阴性细菌病原体能够使用注射器样结构将类型三分泌物穿过宿主细胞质膜转运细菌蛋白质（配体效应子）到宿主细胞胞质溶胶中装置（T3SA）。虽然一些细菌使用它们的T3SA调节它们的吞噬体环境（沙门氏菌 spp 。），建立基质结构以在质膜上形成微集落（Enteropathogenic < em="">）或溶解它们的进入泡（志贺氏菌属。），它们都具有共同的严格调节的他们的T3SA的活性。然而，T3SA在感染的细胞和组织中的活性的跟踪一直难以进行。使用在T3SA是活性时上调的MxiE依赖性启动子的性质，我们最近设计了基于转录的分泌活性报道分子（TSAR），其允许以下的S的活性。使用快速成熟的GFP内在荧光，在组织培养细胞中实时地和体内实时分析灵敏度。在这里我们描述TSAR的设计及其应用于固定和活体样品的显微镜和流式细胞仪在结肠上皮细胞模型使用TC7组织培养细胞。
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