| Bioluminescence Resonance Energy Transfer (BRET) Assay for Determination of Molecular Interactions in Living Cells
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Author:
Date:
2017-11-20
[Abstract] The bioluminescence resonance energy transfer (BRET) assay can be used as an indicator of molecular approximation and/or interaction. A significant resonance energy transfer signal is generated when the acceptor, having the appropriate spectral overlap with the donor emission, is approximated with the donor. In the example provided, proteins tagged with bioluminescent Renilla luciferase (Rlu) as donor and yellow fluorescent protein (YFP) as acceptor were co-expressed in cells. This pair of donor and acceptor have an approximate Förster distance of 4.4 nm, providing the optimal working distance (Dacres et al., 2010). This technique can be used to explore the time-course of specific molecular interactions that occur in living cells.
[摘要] 生物发光共振能量转移（BRET）测定可以用作分子近似和/或相互作用的指标。 当具有与供体发射的适当光谱重叠的受体与供体近似时，产生显着的共振能量转移信号。 在所提供的例子中，用生物发光的海肾荧光素酶（Rlu）作为供体和作为受体的黄色荧光蛋白（YFP）标记的蛋白在细胞中共表达。 这对供体和受体具有4.4nm的近似Forster距离，提供了最佳的工作距离（Dacres et。，2010）。 这种技术可以用来探索在活细胞中发生的特定分子相互作用的时间过程。
【背景】使用生物发光供体和荧光受体的生物发光共振能量转移（BRET）研究可以监测在活细胞中实时发生的分子相互作用（例如标记的蛋白质，肽或小分子之间）。这种方法取决于供体和受体之间的空间近似，以及适当的光谱重叠以产生有意义的信号（图1）。目前提供的实例使用Rlu-标记的蛋白质作为供体和YFP-标记的蛋白质作为受体（Harikumar等人，2007）。这已被非常成功地应用于建立活细胞质膜中生理相关的蛋白质 - 蛋白质相互作用的存在。然而，重要的是包括可能导致非特异性蛋白质 - 蛋白质近似和能量转移（旁观者效应）的表达水平的对照，例如使用相似水平的已知非相关蛋白质的表达。此外，与未标记蛋白质的竞争可以帮助建立信号的相互作用的可饱和性和特异性。
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| Improved Oviduct Transfer Surgery for Genetically Modified Rat Production
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Author:
Date:
2017-08-20
[Abstract] Rat embryo transfer surgeries are becoming more common with targeted nucleases increasing the demand for rat models. This protocol details pre-surgical preparation, improved surgical techniques for placing embryos into the oviduct, and post-surgical care of rats to parturition. Direct application of mouse oviduct transfer protocols results in limited success in the rat. By combining techniques from several widely used protocols in the field, increased yield of live pups born to healthy dams is possible. This protocol is distinct from previously published protocols by the use of a modified anesthesia protocol (Smith et al., 2004), use of analgesia, the addition of peritoneal sutures (Filipiak and Saunders, 2006), incision location and number of transfers per animal (Krinke et al. ...
[摘要] 大鼠胚胎移植手术正变得越来越普遍，靶向核酸酶增加对大鼠模型的需求。 该协议详细介绍了手术前准备，将胚胎置入输卵管的改进的外科技术以及大鼠分娩后的手术后护理。 直接应用小鼠输卵管转移方案在大鼠中的成功有限。 通过组合来自现场广泛使用的几种方案的技术，可以提高健康水坝出生的活的小狗的产量。 该方案与以前公开的方案不同，通过使用改进的麻醉方案（Smith等人，2004），使用止痛剂，添加腹膜缝线（Filipiak和Saunders，2006），切割位置和每只动物的转移数 （Krinke等，2000）。
【背景】在显微注射和胚胎移植手术后可靠地生产健康小狗的能力对于模型创建至关重要，特别是创建多个创始动物的可能性增加，对观察到的表型有信心。因此，即使使用不同浓度的注射液，出生率相对于报告的比例较低，系统地对现有的小鼠胚胎移植方案进行了修改，以更好地适应大鼠。
多个出版物描述了将胚胎转移到两侧子宫的两个角的输卵管;然而，这增加了动物在麻醉下的时间长度，并且需要中线切口并穿过腹膜腔以到达侧生殖道，或者产生两个单独的切口（Krinke等人，2000）。这些选择不太理想，因为这两个选项都会增加动物的压力，从而增加妊娠中止的可能性。通过在术前和术后创建单侧切口并施用镇痛，动物的压力被最小化（Smith等人，2004）。使用异氟烷可注射麻醉剂可以最大程度地降低毒性风险（如三溴乙醇所见），IP注射损伤和重复给药，所有这些都与啮齿动物手术后的死亡率相关（Bernal ...
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| Determination of NO and CSF Levels Produced by Bacillus subtilis
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Author:
Date:
2017-07-05
[Abstract] The cell-to-cell communication and division of labour that occurs inside a beneficial biofilm produce significant differences in gene expression compared with the gene expression pattern of cells grew under planktonic conditions. In this sense, the levels of NO (nitric oxide) and CSF (Competence Sporulation Stimulating Factor) produced in Bacillus subtilis cultures have been measured only under planktonic growth conditions. We sought to determine whether NO and/or CSF production is affected in B. subtilis cells that develop as a biofilm. To measure the production levels of the two prolongevity molecules, we grew B. subtilis cells under planktonic and biofilm supporting condition.
[摘要] 与浮游生物条件下生长的细胞的基因表达模式相比，有益生物膜内发生的细胞间细胞通讯和分裂产生显着的基因表达差异。 在这个意义上，仅在浮游生长条件下测量枯草芽孢杆菌培养物中产生的NO（一氧化氮）和CSF（能力孢子刺激因子）的水平。 我们试图确定是否NO和/或CSF生产受到影响。 枯草芽孢杆菌细胞作为生物膜发展。 为了测量两种长寿命分子的生产水平，我们生长了B。 枯草芽孢杆菌细胞在浮游生物膜支持条件下。
【背景】NO是关键的信号分子，在脊椎动物的各种生物过程中发挥作用（Kerwin等人，1995）。 ℃。 elegans 不能产生自己的NO，但是能够包含由B生产的NO。 （Cabreiro and Gems，2013; Gusarov et al。，2013; Kim，2013; Clark和Hodgkin，2014）。大多数生物体在通过由基因编码的酶NO合成酶催化的反应中，通过L-精氨酸向L-瓜氨酸的有氧转化而产生NO（Sudhamsu和Crane，2009）。 电子。 （OP50，HB101）（Cabreiro和Gems，2013; Kim，2013; Clark和Hodgkin，2014），其中几种常规用于喂食蠕虫（OP50，HB101），因为缺乏有氧NO生产，不太熟练功能副本 nos （Sudhamsu and ...
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