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Micro tube 1.5ml

微管1.5ml

Company: SARSTEDT
Catalog#: 72.690.001
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Company-protocol()
Other protocol()

Tethered Chromosome Conformation Capture Sequencing in Triticeae: A Valuable Tool for Genome Assembly
Author:
Date:
2018-08-05
[Abstract]  Chromosome conformation capture sequencing (Hi-C) is a powerful method to comprehensively interrogate the three-dimensional positioning of chromatin in the nucleus. The development of Hi-C can be traced back to successive increases in the resolution and throughput of chromosome conformation capture (3C) (Dekker et al., 2002). The basic workflow of 3C consists of (i) fixation of intact chromatin, usually by formaldehyde, (ii) cutting the fixed chromatin with a restriction enzyme, (iii) religation of sticky ends under diluted conditions to favor ligations between cross-linked fragments or those between random fragments and (iv) quantifying the number of ligations events between pairs of genomic loci (de Wit and de Laat, 2012). In the original 3C protocol, ligation frequency was ... [摘要]  染色体构象捕获测序(Hi-C)是一种全面询问细胞核中染色质三维定位的有效方法。 Hi-C的发展可以追溯到染色体构象捕获的分辨率和通量的连续增加(3C)(Dekker et al。,2002)。 3C的基本工作流程包括(i)通常用甲醛固定完整的染色质,(ii)用限制酶切割固定的染色质,(iii)在稀释条件下重新连接粘性末端,以促进交联片段之间的连接或随机片段之间的那些和(iv)量化基因组基因座对之间的连接事件的数量(de Wit和de Laat,2012)。在最初的3C方案中,通过半定量PCR扩增对应于少量基因组位点(“一对一”)的选定连接接头来测量连接频率(Dekker et al。,2002 )。然后,染色体构象捕获芯片(4C)和染色体构象捕获碳复制(5C)技术扩展3C以分别以“一对多”或“多对多”方式计算结扎事件。 Hi-C(Lieberman-Aiden et al。,2009)最终将3C与下一代测序相结合(Metzker,2010)。此处,在再连接之前,用生物素标记的核苷酸类似物填充粘性末端以在后续步骤中富集具有连接连接的片段。然后对Hi-C文库进行高通量测序,并将得到的读数映射到参考基因组,允许以“多对多”方式确定接触概率,其分辨率仅受限制性位点的分布限制和阅读深度。 Hi-C的首次应用是阐明人类基因组中的全球染色质折叠原理(Lieberman-Aiden et ...

BMV Propagation, Extraction and Purification Using Chromatographic Methods
Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract]  Brome mosaic virus (BMV) is a well-known plant virus representing single-stranded RNA (ssRNA) positive-sense viruses. It has been widely used as a model in multiple studies concerning plant virus biology, epidemiology and the application of viral capsids in nanotechnology. Herein, we describe a method for BMV purification based on ion-exchange and size-exclusion chromatography. The presented method is of similar efficiency to previously described protocols relying on differential centrifugation and can easily be scaled up. The resulting BMV capsids are stable and monodisperse and can be used for further applications. [摘要]  雀麦花叶病毒(BMV)是众所周知的植物病毒,代表单链RNA(ssRNA)正义病毒。 它已被广泛用作植物病毒生物学,流行病学和病毒衣壳在纳米技术中的应用的多项研究中的模型。 在本文中,我们描述了基于离子交换和尺寸排阻色谱的BMV纯化方法。 所提出的方法与先前描述的依赖于差速离心的方案具有相似的效率,并且可以容易地按比例放大。 得到的BMV衣壳是稳定的并且是单分散的,并且可以用于进一步的应用。

【背景】纳米技术要克服的关键挑战之一是制定有效的和组织特异性的药物递送方法。植物病毒和病毒样颗粒(VLP)具有生物相容性和可生物降解性,不含对人类或动物健康有害的病原体,是合成药物载体的安全替代品,通常会激活免疫系统的不良反应或积聚在免疫系统中。身体到毒性水平。最后,病毒衣壳的生产相对便宜且快速(Ren et al。,2007; Arcangeli et al。,2014)。

Bromoviridae 家族的雀麦花叶病毒(BMV)是用作纳米颗粒载体的良好候选物,因为它显示出所有上述特征并且是研究最多的植物病毒之一(Figlerowicz,2000; Alejska et al。,2005; Urbanowicz et al。,2005; Wierzchoslawski et al。,2006; Kao vet al。 ...

An in vitro Co-culture System for the Activation of CD40 by Membrane-presented CD40 Ligand versus Soluble Agonist
Author:
Date:
2018-07-05
[Abstract]  One fundamental property of the TNR receptor (TNFR) family relates to how ‘signal quality’ (the extent of receptor ligation or cross-linking) influences the outcome of receptor ligation, for instance the induction of death in tumour cells. It is unequivocal that membrane-presented ligand (delivered to target cells via cell-surface presentation by co-culture with ligand-expressing third-party cells) induces a greater extent of carcinoma cell death in vitro in comparison to non-cross-linked agonists (agonistic antibodies and/or recombinant ligands). The CD40 receptor epitomises this fundamental property of TNF receptor-ligand interactions, as the extent of CD40 cross-linking dictates cell fate. Membrane-presented CD40 ligand (mCD40L), but not soluble agonists (e.g., ... [摘要]  TNR受体(TNFR)家族的一个基本特性涉及“信号质量”(受体连接或交联的程度)如何影响受体连接的结果,例如肿瘤细胞中的死亡诱导。毫无疑问,膜呈递配体(通过与表达配体的第三方细胞共培养通过细胞表面呈递递送至靶细胞)在体外诱导更大程度的癌细胞死亡非交联激动剂(激动性抗体和/或重组配体)。 CD40受体集中体现了TNF受体 - 配体相互作用的这种基本特性,因为CD40交联的程度决定了细胞命运。膜呈递CD40配体(mCD40L),但不是可溶性激动剂(例如,激动性抗CD40抗体),诱导高水平的促炎细胞因子分泌并导致恶性肿瘤细胞广泛死亡(细胞凋亡)但不是正常的)上皮细胞。在本文中,我们描述了通过mCD40L激活CD40并随后检测细胞凋亡的各种特征(包括细胞膜透化,DNA片段化,半胱天冬酶活化)以及细胞内细胞死亡介质检测的共培养系统(包括衔接蛋白,促凋亡激酶和活性氧,ROS)。

【背景】TNFR及其配体在调节淋巴组织以及上皮(尤其是癌)细胞中的细胞增殖或死亡中的作用已经在广泛研究中,因为它们诱导细胞死亡(主要通过细胞凋亡)的能力代表了有希望的目标。用于癌症治疗。然而,重要的是,当以可溶性对膜结合形式存在时,TNFR激动剂引发细胞死亡的能力存在明显差异。当作为单独治疗施用时,可溶性激动剂通常表现出相对低的细胞毒性效力,而膜呈递的配体似乎是优越的(Albarbar ...

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