| Fluidigm Based Single-cell Gene Expression Library Preparation from Patient-derived Small Intestinal Organoids
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Author:
Date:
2020-10-05
[Abstract] In this protocol, we describe our methods to isolate crypts from patients' biopsy samples and to culture human intestinal stem cells as it’s called “organoid.” Beyond that, we describe how to dissociate organoids cells into single cells for single-cell analysis as a further application. This protocol should provide investigators sufficient tools to generate human organoids from biopsy samples and to accomplish a stable in-vitro assay system.
[摘要] [摘要]在此协议中，我们描述了从患者的活检样本中分离隐窝并培养人类肠干细胞（称为“类器官”）的方法。除此之外，我们还介绍了如何将类器官细胞分解为单细胞以进行单细胞分析，作为进一步的应用。该方案应为研究人员提供足够的工具，以从活检样品中产生人类器官并完成稳定的体外测定系统。
[背景]肠上皮是一个多功能组织即编排动态平衡并形成物理屏障。由肠干细胞（ISC）产生的每个肠上皮细胞（IEC）每4-5天更新一次该上皮（Crosnier等，2006 ）。ISC位于隐窝的底部，并表达各种文献先前报道的特定标记（Muñoz等，2012 ；Clevers ，2013 ）。研究表明，干细胞正确更新的功能障碍与肠道疾病有关，对ISCs动态的了解可能阐明了包括炎症性肠病（IBD）在内的各种疾病的发病机制（Okamoto et al。，2016 ）。
然而，由于缺乏能概括生理性肠上皮层的有效模型，因此对肠干细胞特性的研究具有挑战性。史诗般的“类器官”的引入克服了种种障碍（Sato等人，2009和2011 ），可以从单个ISC体外建立类器官，并忠实地保留其起源组织的生理和病理特征（Middendorp等人）。 。，2014 ）。类器官已被用于各种胃肠道疾病解剖基础病理变化（Fatehullah 。等人，2016; Noben等人，2017 ...
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| In-vitro GLP-1 Release Assay Using STC-1 Cells
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Author:
Date:
2020-08-20
[Abstract] Enteroendocrine cells (EECs) are known chemosensors in the gastrointestinal (GI) epithelium. They release a diversity of gut hormones in response to various stimuli. Here, we report an in-vitro assay to measure GLP-1 release from cultured murine EEC’s under fatty acid stimulation.
[摘要] [摘要] 肠内分泌细胞（EEC）是胃肠道（GI）上皮中的已知化学传感器。它们响应各种刺激而释放多种肠激素。在这里，我们报告了一种体外测定法，以测量在脂肪酸刺激下培养的鼠EEC中GLP-1的释放。
[背景] 肠上皮是人体与环境之间最大的界面。该界面由单个上皮层组成，包含多个具有独特功能角色的不同细胞类型。与LGR5阳性上皮干细胞不同，肠内分泌细胞（EEC）沿整个胃肠道散布在整个上皮中。EEC通过产生和分泌多种激素，在对营养和其他刺激的反应中起关键作用。传统上，这些细胞是按照荷尔蒙特征来分类的（Nausheen 等人，2013； Latorre 等人，2016； Verhoeckx 等人，2015a），尽管随着单细胞RNA测序的到来，我们逐渐意识到这些细胞中的大多数分泌多种激素（Haber 等人，2017; Billing 等人，2019）。EEC的亚型L细胞由胰高血糖素样肽1和2（GLP-1和GLP-2）的产生定义，也可能分泌YY肽（PYY）和胰岛素样肽5（INSL5） 。大多数L细胞见于回肠末端和结肠，而另一些也见于十二指肠和空肠近端。L细胞表面的受体使它们能够直接感知管腔成分并产生适当的激素反应。L细胞上最显着的营养成分和食物成分受体是经典的味觉受体，游离脂肪酸受体以及蛋白质及其产物的受体（Drucker 和Nauck ，2006年；Furness ...
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| Generation of T cells from Human and Nonhuman Primate Pluripotent Stem Cells
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Author:
Date:
2020-07-05
[Abstract] Pluripotent stem cells (PSCs) have the potential to provide homogeneous cell populations of T cells that can be grown at a clinical scale and genetically engineered to meet specific clinical needs. OP9-DLL4, a stromal line ectopically expressing the Notch ligand Delta-like 4 (DLL4) is used to support differentiation of PSCs to T-lymphocytes. This article outlines several protocols related to generation of T cells from human and non-human primate (NHP) PSCs, including initial hematopoietic differentiation of PSC on OP9 feeders or defined conditions, followed by coculture of the OP9-DLL4 cells with the PSC-derived hematopoietic progenitors (HPs), leading to efficient differentiation to T lymphocytes. In addition, we describe a protocol for robust T cell generation from hPSCs conditionally ...
[摘要] [摘要] 多能干细胞（PSCs）有潜力提供同质的T细胞群体，这些细胞可以在临床规模上生长，并通过基因工程来满足特定的临床需求。OP9-DLL4是一种异位表达Notch配体Delta-like 4（DLL4）的基质细胞系，用于支持psc向T淋巴细胞的分化。本文概述了从人类和非人类灵长类（NHP）PSC中产生T细胞的几种方法，包括在OP9喂食者或特定条件下对PSC进行初始造血分化，然后将OP9-DLL4细胞与PSC衍生的造血祖细胞（HPs）共培养，从而有效地分化成T淋巴细胞。此外，我们描述了一个从有条件表达ETS1的hPSCs中产生健壮T细胞的方案。所提出的协议提供了一个平台，用于疾病建模和评估其在大型动物模型免疫治疗中的应用。
[背景] T淋巴细胞（T细胞）在细胞介导的免疫反应中起着关键作用，参与肿瘤细胞的监测和杀伤。在过去的几十年里，已经开发了几种策略来重定向、培养和/或增强抗肿瘤的T淋巴细胞（Houot等人，2015年；June等人，2018年），并将其用于基于T细胞的过继免疫治疗。最近的临床试验表明，用嵌合抗原受体（CAR）-T细胞治疗复发性和难治性淋巴瘤患者的疗效显著（Riviere和Sadelain，2017）。
人类多能干细胞（hPSCs），包括胚胎（hESCs）和诱导（hiPSCs），为生产用于过继性细胞免疫疗法的T细胞提供了一种很有前景的资源，可与基因工程技术相结合，产生现成的CAR ...
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