| Ratiometric Measurement of Protein Abundance after Transient Expression of a Transgene in Nicotiana benthamiana
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Author:
Date:
2020-09-05
[Abstract] Ratiometric reporters are tools to dynamically measure the relative abundance of a protein of interest. In these systems, a target protein fused to a fluorescent or bioluminescent reporter is expressed with fixed stoichiometry to a reference protein fused to a second reporter. Both fusion proteins are encoded on a single transcript but are separated during translation by a 2A “self-cleaving” peptide. This approach enables changes in the relative abundance of a target protein to be detected sensitively, reducing variability in expression of the ratiometric reporter transgene that may occur across different tissues or transformation events. We recently developed a set of Gateway-compatible plant transformation vectors termed pRATIO that combine a variety of promoters, fluorescent and ...
[摘要] [摘要] 比率报告基因是动态测量目标蛋白质相对丰度的工具。在这些系统中，与荧光或生物发光报告基因融合的靶蛋白以固定的化学计量比与与第二报告基因融合的参考蛋白表达。两种融合蛋白均编码在单个转录本上，但在翻译过程中被2A“自切割”肽隔开。这种方法使目标蛋白质的相对丰度的变化能够被敏感地检测到，从而减少了可能在不同组织或转化事件中发生的比例报告基因转基因表达的变异性。我们最近开发了一套与网关兼容的植物转化载体，称为pRATIO 结合了多种启动子，荧光和生物发光报告基因以及源自口蹄疫病毒的2A肽。在这里，我们详细描述了如何使用双荧光比率记者pRATIO3212检查靶蛋白的瞬时表达后的相对丰度烟草本塞姆氏叶。对于此示例，我们分析了响应于karrikins 和rac -GR24 处理的拟南芥MAX2 1（SMAX1）蛋白抑制子的降解。该方案提供了一种简单，快速，易于扩展的方法，用于体内分析农杆菌浸润的烟草叶片组织中的相对蛋白质丰度。
[背景] Karrikins （KARs ）是在烟雾中发现的丁烯内酯化合物，可刺激拟南芥种子萌发并增强幼苗的光形态发生（Flematti ，2004； Nelson 等，2009、2010 和2012）。拟南芥中的KAR响应需要α/β- 水解酶KARRIKIN对光的敏感性/低敏感性（KAI2 / HTL）（Sun and Ni，2011; ...
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| Preparation of HeLa Total Membranes and Assay of Lipid-inhibition of Serine Palmitoyltransferase Activity
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Author:
Date:
2020-06-20
[Abstract] Serine palmitoyltranferase (SPT) is a pyridoxal 5′ phosphate (PLP)-dependent enzyme that catalyzes the first and rate-limiting step of de novo synthesis of sphingolipids. SPT activity is homeostatically regulated in response to increased levels of sphingolipids. This homeostatic regulation of SPT is mediated through small ER membrane proteins termed the ORMDLs. Here we describe a procedure to assay ORMDL dependent lipid inhibition of SPT activity. The assay of SPT activity using radiolabeled L-serine was developed from the procedure established by the Hornemann laboratory. The activity of SPT can also be measured using deuterated L-serine but it requires mass spectrometry, which consumes money, time and instrumentation. The ORMDL dependent lipid inhibition of SPT activity can be ...
[摘要] [摘要] 丝氨酸Palmitoyltranferase （SPT）是吡哆醛5 ' 磷酸（PLP）依赖酶催化第一和限速步骤中从头合成鞘脂。SPT活动是Homeostatically调控响应水平的提高鞘脂。这SPT的稳态调节是通过小ER膜蛋白介导称为ORMDLs。在这里，我们描述了一种方法用放射性标记的L-丝氨酸以测定SPT活性的SPT活性。测定的ORMDL依赖性抑制脂质从由规定的程序被开发Hornemann 实验室。 SPT的活性也可以使用氘化的L-丝氨酸进行测定，但需要进行质谱分析，这会耗费金钱，时间和仪器。可以在细胞和无细胞系统中研究ORMDL依赖性脂质对SPT活性的抑制作用。在这里，我们提供了详细的协议来测量存在短链（C8-神经酰胺）或长链神经酰胺（C24-神经酰胺）时SPT活性。该协议的最大优势之一我们通过在HeLa细胞膜中提供外源鞘氨醇和24：1酰基辅酶A通过内源性神经酰胺合酶生成长链神经酰胺来实现这一目标。需要精密的仪器。
[背景 ] 丝氨酸palmit oyltranferase （SPT）是一种多亚基酶是在真核生物和原核生物一些广泛表达（花田等人，1997; Ikushiro 。等人，2001; Hornemann 等人，2007）.The ...
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