| High-throughput Microscopic Analysis of Salmonella Invasion of Host Cells
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Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract] Salmonella is a Gram-negative bacterium causing a gastro-enteric disease called salmonellosis. During the first phase of infection, Salmonella uses its flagella to swim near the surface of the epithelial cells and to target specific site of infection. In order to study the selection criteria that determine which host cells are targeted by the pathogen, and to analyze the relation between infecting Salmonella (i.e., cooperation or competition), we have established a high-throughput microscopic assay of HeLa cells sequentially infected with fluorescent bacteria. Using an automated pipeline of image analysis, we quantitatively characterized a multitude of parameters of infected and non-infected cells. Based on this, we established a predictive model that ...
[摘要] 沙门氏菌是革兰氏阴性细菌，引起称为沙门氏菌病的胃肠疾病。在感染的第一阶段，沙门氏菌使用其鞭毛在上皮细胞表面附近游泳并靶向特定的感染部位。为了研究确定哪种宿主细胞被病原体靶向的选择标准，并分析感染沙门氏菌（ ie ，合作或竞争）之间的关系，我们有建立了对荧光细菌依次感染的HeLa细胞的高通量显微镜检测。使用自动化图像分析管道，我们定量表征了感染和未感染细胞的众多参数。基于此，我们建立了一个预测模型，使我们能够识别宿主细胞易受感染的参数。我们发现宿主细胞易损性有两个来源：病原体诱导的细胞易感性从沙门氏菌摄取中出现并持续存在于感染过程的后期阶段;以及与细胞固有属性相关的宿主细胞固有的脆弱性，例如局部细胞拥挤和胆固醇含量。我们的方法基于形态学或分子宿主细胞参数预测单层上皮细胞中沙门氏菌感染的概率。在这里，我们提供了工作流程的详细描述，包括基于计算机的分析管道。我们的方法有可能应用于研究宿主 - 病原体相互作用的其他组合。
【背景】鼠伤寒沙门氏菌血清型鼠伤寒沙门氏菌通过摄入受污染的食物或水感染宿主，引起沙门氏菌病。一旦细菌到达肠道的远端回肠，它们就会侵入广泛的宿主细胞，包括肠上皮细胞（Watson和Holden，2010）。在宿主细胞入侵的第一阶段，沙门氏菌选择其目标，使用其鞭毛游泳并扫描上皮表面（Misselwitz et ...
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| Quantification of Colibactin-associated Genotoxicity in HeLa Cells by In Cell Western (ICW) Using γ-H2AX as a Marker
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Author:
Date:
2018-03-20
[Abstract] The genotoxin colibactin is produced by several species of Enterobacteriaceae. This genotoxin induces DNA damage, cell cycle arrest, senescence and death in eukaryotic cells (Nougayrède et al., 2006; Taieb et al., 2016). Here we describe a method to quantify the genotoxicity of bacteria producing colibactin following a short infection of cultured mammalian cells with colibactin producing E. coli.
[摘要] 基因毒素colibactin由几种肠杆菌科产生。 该基因毒素在真核细胞中诱导DNA损伤，细胞周期停滞，衰老和死亡（Nougayrède等人，2006; Taieb等人，2016）。 在这里，我们描述了一种方法来量化生产colibactin的细菌的基因毒性，在短时间感染培养的哺乳动物细胞后，产生e colibactin。大肠杆菌。
【背景】基因毒素colibactin是由几种肠杆菌科产生的聚酮化合物非核糖体肽杂交化合物。由编码在54kb基因组基因座pks岛上的机器合成的这种毒素在真核细胞中诱导DNA损伤，细胞周期停滞，衰老和死亡（Nougayrède等人， 2006年; Taieb 等人，2016年）。大肠杆菌素的基因毒性活性取决于直接的宿主细胞 - 细菌相互作用，并且不能从培养物上清液，杀死的细菌或细菌裂解物而非生命细菌重演。可以通过量化巨细胞病表型（对于方案参见Bossuet-Greif等人，2017）或双链DNA断裂的定量来评估对真核细胞的大肠杆菌素基因毒性效应的可视化和定量在彗星试验（揭示DNA片段化）或H2AX组蛋白磷酸化作用宿主细胞核中，双链DNA标记断裂。组蛋白H2AX的磷酸化表征为对遗传毒性剂的早期和敏感反应（Audebert等人，2010）。证明H2AX磷酸化比彗星试验在体外以及体内灵敏度高10-100倍（Audebert等人， ...
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| PhagoKinetic Track Assay: Imaging and Analysis of Single Cell Migration
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Author:
Date:
2016-01-05
[Abstract] Cell migration is a highly complex and dynamic biological process, essential in several physiological phenomena and pathologies including cancer dissemination and metastasis formation. Thus understanding single cell migration is highly relevant and requires a suitable image-based assay. Depending on the speed of the moving cells, one may require fast time-lapse microscopy, which is not always suitable for high-throughput screening. To overcome this, a quantitative and fixed single cell migration assay was developed based on the PhagoKinetic Tracks (PKT) procedure. Briefly, cells are seeded on top of a monolayer of carboxylated latex beads, and as cells migrate, they phagocytose these beads and leave behind a migratory track. These bead-free migratory tracks can be visualized using a ...
[摘要] 细胞迁移是高度复杂和动态的生物过程，在几种生理现象和病理包括癌症传播和转移形成中是必需的。因此，理解单细胞迁移是高度相关的，并需要合适的基于图像的测定。根据移动细胞的速度，可能需要快速时间延迟显微术，这不总是适合于高通量筛选。为了克服这一点，基于Phago运动轨迹（PKT）程序开发了定量和固定的单细胞迁移测定。简言之，将细胞接种在单层羧化的乳胶珠的顶部，并且当细胞迁移时，它们吞噬这些珠并留下迁移轨迹。这些无珠移动轨迹可以使用标准明场显微镜可视化，并分析单细胞迁移的多参数定量评估（Naffar-Abu-Amara等人，2008）。
在这里，我们描述了PKT测定的详细和优化的方案，适用于RNAi和药物筛选（van Roosmalen等人，2015）。这个协议允许用户在单细胞水平研究迁移行为，没有快速和活成像显微镜。
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