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Date:
2020-05-20
[Abstract] We have developed enabling techniques for sulfoglycomics based on MALDI-MS mapping and MS/MS sequencing of permethylated sulfated glycans. We then extended further the analytical workflow to C18 reverse phase (RP)-nanoLC-nanoESI-MS/MS analyses of permethylated sulfated glycans in the negative ion mode. The advantages are that extra sulfates on permethylated di- and multiply sulfated glycans will survive in nanoESI conditions to allow detection of multiply charged intact molecular ions, and more comprehensive MS/MS can be performed in an automated fashion at higher sensitivity, compared with MALDI-MS/MS. Parallel higher energy collision dissociation (HCD) and ion trap collision induced dissociation (CID)-based MS2, coupled with product-dependent MS3 in data dependent ...
[摘要] [摘要 ] 我们已经开发使得能够对技术sulfoglycomics 基于MALDI-MS映射和全甲基化的硫酸化聚糖的MS / MS测序。然后，我们进一步将分析工作流程扩展到以负离子模式对过甲基化硫酸化聚糖进行C18反相（RP）-nanoLC - nanoESI -MS / MS分析。优点是，全甲基化二硫酸和多硫酸化聚糖上的额外硫酸盐将在nanoESI 条件下存活，从而允许检测多电荷的完整分子离子，并且与MALDI-相比，可以自动方式以更高的灵敏度执行更全面的MS / MS。 MS / MS。基于并行高能碰撞解离（HCD）和离子阱碰撞诱导解离（CID）的MS 2 ，在数据依赖的采集模式下结合产物依赖的MS 3 被证明在解析和鉴定异构化的硫酸化聚糖结构上具有很高的生产力。内部glycomic 数据挖掘软件，GlyPick ，被开发并用于自动识别和目标硫酸化的相对定量下游工艺glycotopes 基于其诊断MS的累积强度2根离子从数千HCD-MS的萃取2 和/或CID -MS 2 数据。
[背景 ] 当前质谱（MS）为基础的glycomic 映射仍然不足划定的全部复杂性糖组。尽管MALDI-MS定位和MS / MS测序将有效地提供非常有用的第一印象糖组学特征，但几乎不可能在检测到的每个推定的聚糖信号上获得MALDI-MS / ...
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