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Ampicillin

Company: Sigma
Catalog#: A9393
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Quantification of Bacteria Residing in Caenorhabditis elegans Intestine
Author:
Date:
2020-05-05
[Abstract]  Quantification of intestinal colonization by pathogenic or commensal bacteria constitute a critical part of the analysis to understand host-microbe interactions during different time points of their interplay. Here we detail a method to isolate non-pathogenic and pathogenic bacteria from C. elegans intestines, and classify gut phenotypes induced by bacterial pathogens using fluorescently-tagged bacteria. Furthermore, these methods can be used to isolate and identify new culturable bacterial species from natural microbiomes of wild nematodes. [摘要]  [ 摘要] 量化中肠道定植通过致病或者共生细菌构成一个关键部分中的分析要了解主机微生物相互作用在不同的时间点中他们的相互作用。在这里我们详细介绍一个方法要隔离非致病性和致病性细菌从C. 线虫 肠,而且分类肠表型诱导由细菌病原体使用荧光标记的细菌。此外,这些方法可以被用于为了隔离和识别新的可培养的细菌种类从天然微生物组中野生线虫。

[ 背景] 在该野生,线虫是否暴露为一宽品种中细菌和真菌群落(Frezal 而菲利克斯,2015年)。在实验室条件下,该线虫C. 线虫已被历史维护在一个单一食物源(布伦纳,1974年)。^ h H但是,该蠕虫被冲击下随着各种致病菌和一个增加数中的非- 病原细菌中多样化的营养质量(Garsin 的Et 铝,。2003 ; Gracida 而Eckmann,2013 ; 德克森的Et 铝,。2016 ; 麦克尼尔的Et 铝。,2013 ; 谭的Et 铝,1999年)。C. 线虫胚胎能要提取从妊娠雌雄同体通过使用次氯酸钠处理。这个过程省去细菌允许的新世代要被暴露游记要一个微生物吨。他的优势提供了一个独特的框架为了研究宿主与微生物相互作用。遗传易处理中的线虫和细菌允许为了研究真核生物(Garsin 的Et 铝,2003)和原核(加拉格尔和Manoil,2001)基因功能在不同的时间点在这个动态 相互作用。

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In vivo Quantification of Alkanes in Escherichia coli
Author:
Date:
2020-04-20
[Abstract]  Microbial production of alkanes employing synthetic biology tools has gained tremendous attention owing to the high energy density and similarity of alkanes to existing petroleum fuels. One of the most commonly studied pathways includes the production of alkanes by AAR (acyl-ACP (acyl carrier protein) reductase)-ADO (aldehyde deformylating oxygenase) pathway. Here, the intermediates of fatty acid synthesis pathway are used as substrate by the AAR enzyme to make fatty aldehyde, which is then deformylated by ADO to make linear chain alkane. However, the variation in substrate availability to the first enzyme of the pathway, i.e., AAR, via fatty acid synthesis pathway and low turnover of the ADO enzyme make calculation of yields and titers under in vivo conditions extremely ... [摘要]  [摘要] 由于烷烃的高能量密度和与现有石油燃料的相似性,使用合成生物学工具生产烷烃的微生物受到了广泛关注。最常研究的途径之一是通过AAR(酰基-ACP (酰基)载体蛋白)还原酶)-ADO(醛Deformylating 加氧酶)途径。在这里,中间体脂肪酸合成途径被用作基材由AAR Enzym E要使脂肪醛,然后是Deformylated 通过ADO,使线性链烷烃。但是,即该途径的第一种酶的底物利用率的变化,即,AAR,通过脂肪酸合成途径和ADO酶的低周转率,使得在体内条件下的产量和效价的计算极为困难。在体内测定中,将确定的ADO酶底物外加到培养基中有助于监测菌体的流入。因此,该底物提供了更准确的产物收率测量方法。在此方案中,我们包括用于实施体内测定法以监测大肠杆菌中烷烃生产的详细指南。

[背景] 利用工程微生物生产烷烃的研究已广受欢迎,因为它提供了一种有吸引力的替代方案,可减少对化石燃料的依赖,同时减轻气候变化的影响(Lee 等,2008;Knothe ,2010; Lu,2010; Schirmer 等。人,2010;谭等人。,2011)各种途径已被发现或人工Assemb ...

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