|
Author:
Date:
2018-07-05
[Abstract] As the sister clade of seed plants, ferns are significant materials for plant phylogeny research. However, the genomic DNA extraction protocol for fern samples like modified CTAB method still lacks robustness. Here, we found that the amount and condition of the pinnae samples are critical for gDNA extraction in fern, Adiantum capillus-veneris L. In 500 μl CTAB solution, the recommended amount of pinnae is about 10-20 mg (2-3 pieces). The condition of the pinnae must be instantly-picked from a plant cultivated in a suitable environment. With these factors under control, it is highly reproducible to get the high-quality gDNA with low degradation rate
[摘要] 作为种子植物的姐妹分支，蕨类植物是植物系统发育研究的重要材料。 然而，像改良CTAB方法的蕨类样品的基因组DNA提取方案仍然缺乏稳健性。 在这里，我们发现羽片样品的数量和条件对于蕨类植物， Adiantum capillus-veneris L中的gDNA提取至关重要。在500μlCTAB溶液中，推荐的羽片量约为10-20 mg（2-3片）。 必须从在合适环境中栽培的植物中立即采摘羽片的状况。 在控制这些因素的情况下，获得具有低降解率的高质量gDNA具有高度可重复性
【背景】CTAB方法已应用于 Adiantum capillus-veneris L的gDNA提取（Han et al 。，2012; Li et al 。，2017年）。 然而，该方案在我们的实验中仍显示出不稳定性和高降解率。 蕨类植物的羽片积聚了大量的次级代谢产物，如多糖和多酚，这对DNA提取不利（Ponnusamy et al。，2015）。
为了提高gDNA提取的稳健性，我们基本上从两个方面对协议进行了优化：1）减少材料用量，仅使用2-3个羽片（约10-20毫克）。 2）必须从在适宜的培养环境（温度：25℃，湿度：65％，16小时白光/ 8小时黑暗处理）中培养的植物中新鲜采摘羽片，并立即用于DNA提取。 ...
|