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Author:
Date:
2018-01-20
[Abstract] Biliary excretion offers a way to analyze various contaminants in aquatic organisms, and fish bile has been used as a biomarker for environmental contamination. The use of the fish bile proteome as a tool for monitoring the impact of environmental contaminants has been recently validated. However, scarce studies in this context are available, and much remains to be investigated. In this context, this protocol describes a fast, reproducible and cheap biliary clean-up procedure for subsequent proteomic analyses, such as zymography and mass spectrometry.
[摘要] 胆汁排泄提供了分析水生生物中各种污染物的方法，并且鱼胆已被用作环境污染的生物标志物。 最近验证了使用鱼胆蛋白质组作为监测环境污染物影响的工具。 然而，在这方面缺乏研究，还有很多需要调查。 在这种情况下，这个协议描述了一个快速，可重复和廉价的胆道清理程序后续蛋白质组学分析，如酶谱和质谱。
【背景】胆汁排泄是分析水生生物中几种化学污染物的一种替代方法。虽然直到最近，焦点只是检测环境污染物，而不是评估可能的生物化学效应，例如差异蛋白质表达，鱼胆汁已被常规用作环境污染的生物标志物数十年。然而，鱼胆汁蛋白质组最近被验证作为监测环境污染物对鱼代谢的影响的工具。这些包括多环芳香烃（Pampanin等人，2014），金属和类金属（Hauser-Davis等人，2012a）和复杂混合物（ Hauser-Davis et al。，2012b）等污染物。但是，这是一个很新的领域，在这方面还缺乏研究。在这种情况下，鱼胆含有大量的干扰蛋白定量，1D和2D电泳和质谱分析（Hauser-Davis等人，2012b）的脂质和胆汁盐。因此，为了获得可重现的结果，清理过程是至关重要的，并为随后的蛋白质组学应用充分准备这种液体。
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