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Pipette tips 200 μl

Company: Sorenson Bioscience
Catalog#: 14220
Bio-protocol()
Company-protocol()
Other protocol()

Single-cell qPCR Assay with Massively Parallel Microfluidic System
Author:
Date:
2020-03-20
[Abstract]  The single-cell transcriptome is the set of messenger RNA molecules expressed in one cell. It is extremely variable and changes according to external, physical and biochemical conditions. Due to sensitivity shortages, most of genetic studies use bulk samples, providing only the average gene expression. Single-cell technologies have provided a powerful approach to a more detailed understanding of the heterogenic populations and minority cells. However, since it is still a quite novel technique, standardized protocol has to be established. Single-cell qPCR, although partly limited by the number of genes, is relatively simple to analyze. Therefore, its use is accessible without the necessity to recourse to complex bioinformatics analyses. The main steps for single-cell qPCR, as illustrated ... [摘要]  [摘要 ] 单细胞转录组是在一个细胞中表达的信使RNA分子的集合。它变化很大,并会根据外部,物理和生化条件而变化。由于敏感性不足,大多数基因研究使用大量样品,仅提供平均基因表达。单细胞技术提供了一种强大的方法,可以更详细地了解异质群体和少数细胞。然而,因为它仍然是一个相当新的技术,标准化协议具有至b e建立。尽管单细胞qPCR受基因数量的限制,但分析起来相对简单。因此,无需使用复杂的生物信息学分析就可以使用它。如本协议所述,单细胞qPCR的主要步骤包括单细胞分离,细胞裂解液,cDNA逆转录合成,cDNA库生成的扩增以及最终的定量聚合酶链反应。

[背景 ] 的单细胞转录是一套完整的在一个细胞中表达的信使RNA(mRNA)分子。它变化很大,并会根据外部,物理和生化条件而变化。因此,这是生物异质性的来源,其中来自相同环境的细胞与其他细胞相似但不相同。

由于灵敏度不足,大多数遗传研究使用大量样本,其中有数百至数千个细胞,仅提供平均基因表达。这极大地限制了少数细胞群体的研究,这可能会带来特定的特性,例如在癌症情况下的耐药性或转移能力。单细胞技术能够在单细胞水平上分析转录组,从而揭示了异源群体的复杂性。这些技术不仅应用于癌症,而且还应用于许多细胞生物学研究中,包括成年组织,干细胞,免疫细胞等。以及微生物学和病毒学等其他领域(Wen and ...

Determining Ribosome Translational Status by Ribo-ELISA
Author:
Date:
2018-01-05
[Abstract]  The Ribo-ELISA was originally developed to elucidate the basis for the ribopuromycylation method (RPM)-based detection of ribosome bound nascent chains. The Ribo-ELISA enables characterization of the translational status of ribosomes, and can be applied to the discovery of super-ribosomal complexes with novel ribosome associated macromolecules that are isolated by physical fractionation in sucrose gradients or other methods. [摘要]  Ribo-ELISA最初是为阐明基于核糖核苷酸化方法(RPM)的核糖体结合新生链检测的基础而开发的。 Ribo-ELISA能够表征核糖体的翻译状态,并且可以应用于通过蔗糖梯度中的物理分离或其他方法分离的新型核糖体相关大分子的超核糖体复合物的发现。

【背景】核糖体是由40S和60S亚单位组成的异构结构,当多个核糖体与单个mRNA结合时,它们以单体和多核糖体存在于细胞中。 另外,翻译核糖体可以与调节翻译的多个分子复合物相关联。 核糖体ELISA(Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay)能够通过核糖体相关新生链的体外嘌呤化检测翻译核糖体(David等人,2012)。 在将嘌呤霉素添加至具有结合的新生链的核糖体时,这种化学反应自发进行。 该方法定量测定每个核糖体中出现的新生链的数量,并且可以用于确定单核细胞相对于多核糖体的翻译状态,并鉴定结合其他大分子的核糖体,其改变其在沉淀柱中的沉降速率或迁移。

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