| Heterologous Expression and Purification of the CRISPR-Cas12a/Cpf1 Protein
|
|
Author:
Date:
2018-05-05
[Abstract] This protocol provides step by step instructions (Figure 1) for heterologous expression of Francisella novicida Cas12a (previously known as Cpf1) in Escherichia coli. It additionally includes a protocol for high-purity purification and briefly describes how activity assays can be performed. These protocols can also be used for purification of other Cas12a homologs and the purified proteins can be used for subsequent genome editing experiments.
Figure 1. Timeline of activities for the heterologous expression and purification of Francisella novicida Cas12a (FnCas12a) from Escherichia coli
[摘要] 该协议提供了分步说明（图1），用于在大肠杆菌中异源表达新西兰弗朗西斯菌弗朗西丝菌Cas12a（以前称为Cpf1）。 它还包括一个高纯度纯化方案，并简要介绍如何进行活性测定。 这些方案也可以用于其他Cas12a同系物的纯化，并且纯化的蛋白质可以用于随后的基因组编辑实验。
![“”src]()
图1.从大肠杆菌 异源表达和纯化<弗朗西斯弗朗西丝菌 Cas12a（FnCas12a）的活动时间表
【背景】原核CRISPR-Cas免疫系统通过使用CRISPR RNA（crRNA）作为外源DNA或RNA的序列特异性靶向的指导来提供针对病毒和质粒的保护（van der Oost等人，2014; Marraffini ，2015）。 1类CRISPR-Cas系统（包含I型，III型和IV型）通常形成多亚基蛋白-cRNA效应复合物，而2类系统（包含II型，V型和VI型）依赖于单个crRNA-引导的效应物核酸酶用于目标干扰（Mohanraju et al。 2016年）。
...
|
|
|
| Adhesion of Enteroaggregative E. coli Strains to HEK293 Cells
|
|
Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract] Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) is a recognized cause of acute diarrhea among both children and adults worldwide. EAEC strains are characterized by the presence of aggregative adherence fimbriae (AAF), which play a key role in pathogenesis by mediating attachment to the intestinal mucosa and by triggering host inflammatory responses. The aggregative adherence fimbria II (AAF/II) is the most important adherence factor of EAEC prototype strain 042 (EAEC042) to intestinal cells. Multiple receptors for AAF/II on epithelial cells have been identified including the transmembrane signaling mucin Muc1. This protocol describes a method to measure adherence of EAEC strains to HEK293 cells expressing the Muc1 glycoprotein.
[摘要] 肠道集聚性大肠杆菌（EAEC）是全球儿童和成人急性腹泻的公认原因。 EAEC菌株的特征在于存在聚集粘附菌毛（AAF），其通过介导与肠粘膜的附着和通过引发宿主炎症反应而在发病机制中起关键作用。 聚合粘附菌毛II（AAF / II）是EAEC原型菌株042（EAEC042）对肠细胞最重要的粘附因子。 已经鉴定了上皮细胞上AAF / II的多种受体，包括跨膜信号传导粘蛋白Muc1。 该协议描述了测量EAEC菌株对表达Muc1糖蛋白的HEK293细胞的依从性的方法。
【背景】EAEC是世界范围内地方性和流行性腹泻病的重要原因。尽管发展中国家儿童腹泻最常见，但EAEC还与免疫受损成人腹泻，旅行者和工业化国家的食源性疾病有关，例如由志贺毒素（Stx）2a型产生的大致致命爆发2011年在北欧的血清型O104：H4的EAEC菌株（Harrington等人，2006; Rasko等人，2011）。 EAEC发病机制由生物体粘附肠细胞，产生肠毒素和细胞毒素并最终诱导炎症的能力决定（Harrington等，2006）。 EAEC对肠细胞的依从性由AAF菌毛粘附素介导（Czeczulin等人，1997）。迄今为止，已经描述了至少5种AAF菌毛的变体，全部编码在范围为55至65MDa的毒力质粒中（Jonsson等人，2015）。 ...
|
|
|
| A Quick and Easy Method for Making Competent Escherichia coli Cells for Transformation Using Rubidium Chloride
|
|
Author:
Date:
2017-11-05
[Abstract] This protocol describes a quick and efficient method to make competent E. coli cells for transformation using rubidium chloride. Commercial competent cells are expensive and this protocol provides a cheaper alternative to them.
[摘要] 这个协议描述了一个快速有效的方法来做出胜任的E。 使用氯化铷转化大肠杆菌细胞。 商业感受态细胞是昂贵的，这个协议提供了一个更便宜的选择。
【背景】基因克隆的成功高度依赖于细菌细胞的转化效率。 通过用化学物质或电脉冲处理细胞可以人为地提高效率。 有几个协议可用于准备主管的E。 然而，它们通常是长期的，费力的，并且在能力上表现出不一致。 Green和Rogers（2013）的方案克服了这些缺点，并允许制备高感受态细胞（〜10 6 -10 8 CFU /μgDNA）。 虽然其他协议要求细胞在低温（19-22°C）下生长，但该协议涉及在37°C下生长细胞。 因此，与18-24小时相比，细胞生长更快并且在4小时内达到对数期。 该协议是高度可重复的。
|
|
|