| [2-3H]Mannose-labeling and Analysis of N-linked Oligosaccharides
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Author:
Date:
2017-07-20
[Abstract] Modifications of N-linked oligosaccharides of glycoproteins soon after their biosynthesis correlate to glycoprotein folding status. These alterations can be detected in a sensitive way by pulse-chase analysis of [2-3H]mannose-labeled glycoproteins, with enzymatic removal of labeled N-glycans, separation according to size by HPLC and radioactive detection in a scintillation counter.
[摘要] 其生物合成后不久，糖蛋白的N-连接寡糖的修饰与糖蛋白折叠状态相关。 可以通过脉冲追踪分析[2- 3 H]甘露糖标记的糖蛋白，通过酶切除标记的N-聚糖来检测这些变化，根据大小通过HPLC分离和放射性 在闪烁计数器中检测。
【背景】在将新生多肽进入ER后，进行若干翻译后修饰，这对于折叠，成熟和质量控制过程至关重要。加入核糖寡糖Glc 3 N 3 GlcNAc 2以产生N-连接的糖蛋白是非常常见的修饰，首先发生（Benyair等人，2011）。前体N-聚糖的加工通过在早期分泌室（Tannous等人，2015）中创建识别标签来引导糖蛋白成熟和质量控制机制。在后期阶段，在整个分泌途径中，寡糖的核心作为将糖链扩展成复合聚糖的平台，其结构涉及糖蛋白的运输和功能（Kamiya等人， ，2012）。由于早期N-连接的聚糖修饰反映糖蛋白生物合成和质量控制，寡糖加工已成为许多研究的主题（Avezov等人，2010; Hosokawa等人。，2010; Ninagawa等人，2014; Ogen-Shtern等人，2016）。糖蛋白组学方法大大改善了N-聚糖的表征，但它们不允许研究早期分泌途径中聚糖加工的动力学。
＆NBSP;这里我们描述一种用于分离和分析代谢标记的N-连接寡糖的简化脉冲追踪方法。该方法包括通过[2- H] ...
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| Assessment of Cellular Redox State Using NAD(P)H Fluorescence Intensity and Lifetime
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Author:
Date:
2017-01-20
[Abstract] NADH and NADPH are redox cofactors, primarily involved in catabolic and anabolic metabolic processes respectively. In addition, NADPH plays an important role in cellular antioxidant defence. In live cells and tissues, the intensity of their spectrally-identical autofluorescence, termed NAD(P)H, can be used to probe the mitochondrial redox state, while their distinct enzyme-binding characteristics can be used to separate their relative contributions to the total NAD(P)H intensity using fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM). These protocols allow differences in metabolism to be detected between cell types and altered physiological and pathological states.
[摘要] NADH和NADPH分别是分解代谢和合成代谢过程的氧化还原辅因子。此外，NADPH在细胞抗氧化防御中起着重要作用。在活细胞和组织中，其光谱相同的自发荧光（称为NAD（P）H）的强度可用于探测线粒体氧化还原状态，而其不同的酶结合特征可用于将其相对贡献与总共分离使用荧光寿命成像显微镜（FLIM）的NAD（P）H强度。这些方案允许在细胞类型和改变的生理和病理状态之间检测代谢的差异。
背景 氧化还原辅因子烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NADH）及其磷酸化对应物NADPH的还原形式本质上是荧光的，两者都吸收波长为340（±30）nm并在460（±50）nm处发射的光（Patterson等人。，2000）。这些光谱特征在氧化成NAD（上标+）或NADP（superson），（2007））时损失。单独的NAD和NADP池的氧化还原平衡决定了对比的代谢过程（Ying，2008），如图1所示。NAD作为电子受体，用于通过三羧酸氧化线粒体中的糖，脂质和氨基酸底物（TCA）循环，并作为内线粒体膜（IMM）上的电子传递链（ETC）的电子供体，促使将质子泵送到膜间隙中，作为合成三磷酸腺苷（ATP）的电源，通过F 1 F 0 O 3 ATP合成酶（Osellame等人，2012）。因此，线粒体中NADH与NAD + 的平衡反映了TCA循环与ETC活性的平衡。 ...
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| Determination of the Glycolysis and Lipogenesis in Culture of Hepatocytes
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Author:
Date:
2016-11-05
[Abstract] Metabolic flux analyses are needed to provide insights into metabolic regulation that occurs in cells. The current protocol describes fast and reproducible methods for determining glycolysis and de novo lipogenesis of hepatocytes. Primary culture of hepatocytes is an ‘in vitro’ model useful to study liver glucose and lipid metabolism (Denechaud et al., 2016). The protocol is divided in 2 parts. Part I: Glycolysis experiment is assessed using the Seahorse extracellular flux (XF) analyser. Glycolysis is determined via the measurement of the extracellular acidification rate (ECAR) of the media, which come predominately from the cellular excretion of lactic acid after the conversion of glucose in pyruvate. Part II: De novo lipogenesis experiment determines ...
[摘要] 需要代谢通量分析来提供细胞中发生的代谢调节的见解。目前的协议描述了确定糖酵解和肝细胞脂肪生成的快速和可重复的方法。肝细胞的原代培养是用于研究肝葡萄糖和脂质代谢的"体外"模型（Denechaud等人，2016）。协议分为2部分。第I部分：使用海马细胞外通量（XF）分析仪评估糖酵解实验。糖酵解通过测量培养基的细胞外酸化速率（ECAR）来确定，所述培养基主要来自丙酮酸中葡萄糖转化后乳酸的细胞排泄。第II部分：新生脂肪生成实验测定来自乙酸盐C 14+前体的甘油三酯（TG）中的放射性C 14+掺入。在2小时后，向培养基中补加乙酸盐，提取脂质，并在新合成的TG标记的定量之前通过TLC（薄层色谱）分离。
[背景] 有不同的方法来评估葡萄糖和脂质代谢：代谢物定量，酶活性和代谢组学...我们的协议聚焦于活细胞的代谢通量分析并且不需要代谢组学设施。海马细胞外通量（XF）分析仪，现在存在于很多机构，是通过确定培养基pH值间接测量活细胞间接糖酵解的强大工具。脂肪生成协议不需要大投资，是高度可重复的。也可以使用氚化水确定，其通过脂肪酸合酶引入新鲜合成的脂质中。
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