| Soluble and Solid Iron Reduction Assays with Desulfitobacterium hafniense
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] There is a pressing need to develop sustainable and efficient methods to protect and stabilize iron objects. To develop a conservation-restoration method for corroded iron objects, this bio-protocol presents the steps to investigate reductive dissolution of ferric iron and biogenic production of stabilizing ferrous iron minerals in the strict anaerobe Desulfitobacterium hafniense (strains TCE1 and LBE). We investigated iron reduction using three different Fe(III) sources: Fe(III)-citrate (a soluble phase), akaganeite (solid iron phase), and corroded coupons. This protocol describes a method that combines spectrophotometric quantification of the complex Fe(II)-Ferrozine® with mineral characterization by scanning electron microscopy and Raman spectroscopy. These three ...
[摘要] 迫切需要开发可持续和有效的方法来保护和稳定铁制物体。为了开发腐蚀铁物体的保护 - 恢复方法，该生物方案提出了研究严格厌氧菌[Desulfitobacterium hafniense （菌株TCE1）中三价铁的还原溶解和稳定亚铁矿物质的生物产生的步骤。和LBE）。我们使用三种不同的Fe（III）来源研究了铁还原：Fe（III） - 柠檬酸盐（可溶相），akaganeite（固体铁相）和腐蚀的试样。该协议描述了一种方法，该方法结合了复杂的Fe（II）-Ferrozine ®的分光光度定量，通过扫描电子显微镜和拉曼光谱进行矿物表征。这三种方法可以评估三价铁的还原溶解和生物矿物质生产，作为开发一种创新的可持续方法来稳定腐蚀铁的有希望的替代方法。
【背景】自铁器时代以来，铁已被用于生产日常用具。因此，考古学上的铁试验是过去极其重要的证据，应予以保留。然而，由于其反应性，铁容易被腐蚀并且考古铁物体可能被完全损坏。埋藏时，铁制品会根据埋葬地点的环境条件形成复杂的腐蚀层。挖掘后，条件发生变化，腐蚀层变得不稳定。为避免完全破坏，考古铁制物需要快速稳定处理。目前，可用的稳定化处理不能提供长期保护并且具有实质性缺点，例如毒性，低效率和大量废物的产生（Scott和Eggert，2009; Rimmer 等人， 2012）。因此，有必要开发新技术来稳定考古铁器。
越来越多地考虑利用微生物代谢来开发更有效，可持续和环保的保护 ...
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| Analysis of Metals in Whole Cells, Thylakoids and Photosynthetic Protein Complexes in Synechocystis sp. PCC6803
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Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] Metals are essential in many biological processes, including oxygenic photosynthesis. Here we described a method to measure the metal pool in whole cells and thylakoids, including the bioactive pool in intact photosynthetic protein complexes in the model oxygenic cyanobacterium Synechocystis PCC6803. In the first part of the protocol, whole cells and thylakoid membranes are carefully prepared, in which the total metal concentrations are measured by inductively coupled plasma triple-quadrupole mass spectrometry (ICP-QQQ-MS). In the second part of the protocol, isolated thylakoids are solubilized to release the integral membrane proteins and the metal binding protein complexes. These intact photosynthetic protein complexes are subjected to size exclusion chromatography (SEC) and ...
[摘要] 金属在许多生物过程中是必不可少的，包括含氧光合作用。 在这里我们描述了测量全细胞和类囊体中金属库的方法，包括模型含氧蓝藻PCH6803中完整光合蛋白复合体中的生物活性库。 在方案的第一部分中，仔细制备全细胞和类囊体膜，其中通过电感耦合等离子体三重四极杆质谱（ICP-MS / MS）测量总金属浓度。 在该方案的第二部分，分离的类囊体被溶解以释放完整的膜蛋白和金属结合蛋白复合物。 将这些完整的光合蛋白复合物进行尺寸排阻色谱（SEC），并通过ICP-MS / MS进行连接分析尺寸分离的复合物中的金属结合。
【背景】氧光合作用的过程需要金属，因为它们在光合电子传递链中作为辅因子和催化剂的基本功能。光合装置需要Fe-S簇，血红素桥Fe和非血红素Fe形式的铁（Fe），可溶性移动电子载体蛋白质质体蓝素中的铜（Cu），叶绿素中的镁（Mg）， ...
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| Assay to Access Anthelmintic Activity of Small Molecule Drugs Using Caenohabidtis elegans as a Model
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Author:
Date:
2017-01-20
[Abstract] This protocol proposes to use the nematode Caenorhabditis elegans as a model to screen and study the anthelmintic activity of natural and synthetic compounds and to observe their effects on the morphology and the ultrastructure of the helminths. Furthermore, C. elegans can be used to investigate the anthelmintic activity in embryonated eggs, larval stages and in the adults’ survival. As most current anthelmintics are not effective against all nematode life stages, this protocol can contribute to the identification of new alternatives to helminthic infections (Sant’Anna et al., 2016).
[摘要] 该方案建议使用线虫秀丽隐杆线虫作为模型来筛选和研究天然和合成化合物的驱虫活性，并观察其对趾甲的形态和超微结构的影响。此外，C。线虫可用于研究胚胎卵，幼虫期和成年人生存期的驱虫活性。由于目前的大多数驱虫药对所有的线虫生命阶段均无效，因此该方案可有助于确定蠕虫感染的新替代品（2016年Sant'Anna等人）。
背景 秀丽隐杆线虫是寄生线虫研究的典型生物，是具有潜在驱虫活性的化合物筛选的优良系统，因为它便宜，易于获得并且易于使用。另外，使用 C。线虫在调查线虫行为，运动，繁殖和死亡的测定中是不复杂和可靠的（Simpkin和Coles，1981）。用于筛选新化合物的方案。首先在深孔显微镜载玻片（Tomlinson等人，1985）中的无菌液体培养基中进行线虫，或使用加入熔融修饰的NGM琼脂中的药物（Driscoll等人，1989）。这些方法在药物筛选中无效，因为含有低食物供应的无菌培养物，引发子宫内出生导致产妇死亡（“内毒素”）（Lenaerts等人） 2008），添加到熔化琼脂中的药物可以改善由于高温导致的药物稳定性。在该方案中，我们使用96孔平板与大肠杆菌供应的液体培养基独立地评估每个阶段（卵，L1-L2幼虫，L3-L4幼虫和成年人）。
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