| Nuclear/Cytoplasmic Fractionation of Proteins from Caenorhabditis elegans
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Author:
Date:
2018-10-20
[Abstract] C. elegans is widely used to investigate biological processes related to health and disease. To study protein localization, fluorescently-tagged proteins can be used in vivo or immunohistochemistry can be performed in whole worms. Here, we describe a technique to localize a protein of interest at a subcellular level in C. elegans lysates, which can give insight into the location, function and/or toxicity of proteins.
[摘要] ℃。 线虫>广泛用于研究与健康和疾病相关的生物过程。 为了研究蛋白质定位，荧光标记的蛋白质可用于体内>或免疫组织化学可在整个蠕虫中进行。 在这里，我们描述了一种在 C中亚细胞水平定位感兴趣的蛋白质的技术。 线虫>裂解物，可以洞察蛋白质的位置，功能和/或毒性。
【背景】亚细胞分级已用于不同的模式生物中以鉴定和研究细胞核，细胞膜和细胞质中的蛋白质功能。 例如，当聚集倾向蛋白定位于细胞核或细胞质中时，它们的毒性可能更大（Kontopoulos et al。>，2006; Barmada et al。>，2010）。 在这里，我们提供了一个协议（改编自Chen et al。>，2000和La Rocca et al。>，2007）来定位的细胞核和细胞质组分中的特定蛋白质。>℃。线虫>。
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| Filter Retardation Assay for Detecting and Quantifying Polyglutamine Aggregates Using Caenorhabditis elegans Lysates
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Author:
Date:
2018-10-05
[Abstract] Protein aggregation is a hallmark of several neurodegenerative diseases and is associated with impaired protein homeostasis. This imbalance is caused by the loss of the protein’s native conformation, which ultimately results in its aggregation or abnormal localization within the cell. Using a C. elegans model of polyglutamine diseases, we describe in detail the filter retardation assay, a method that captures protein aggregates in a cellulose acetate membrane and allows its detection and quantification by immunoblotting.
[摘要] 蛋白质聚集是几种神经退行性疾病的标志，并且与蛋白质体内平衡受损有关。 这种不平衡是由蛋白质天然构象的丧失引起的，最终导致其在细胞内聚集或异常定位。 使用 C。 线虫聚谷氨酰胺疾病模型，我们详细描述了过滤阻滞测定，一种捕获醋酸纤维素膜中蛋白质聚集体的方法，并允许通过免疫印迹进行检测和定量。
【背景】帕金森氏症，阿尔茨海默氏症和多聚谷氨酰胺疾病等神经退行性疾病的一个病理特征是在大脑不同区域存在蛋白质聚集物（Soto，2003; Stroo et al。，2017）。在多谷氨酰胺疾病的情况下，编码序列中谷氨酰胺（CAG）重复的异常扩增扰乱了蛋白质的天然折叠。结果，错误折叠的蛋白质暴露其氨基酸序列的区域，这使得它易于与其他蛋白质聚集，形成大的，不溶的聚集体，这可能妨碍正常的细胞功能（综述于Kuiper 等人 ，2017）。
已经开发了几种用于检测不溶性蛋白质聚集体的方法，包括例如染料结合测定（例如，硫磺素T，刚果红，NIAD-4）和电子显微镜检查。过滤阻滞测定是一种快速而灵敏的方法，可检测和定量体内和体外形成的蛋白质聚集体，包括聚谷氨酰胺（Scherzinger et al。 ，1997; Wanker et al。，1999），α-突触核蛋白（Recasens et al。，2018），和amyloid-beta聚集体（Bieschke et ...
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| Retroviral Capsid Core Stability Assay
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Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract] Structural stability of the capsid core is a critical parameter for the productive infection of a cell by a retrovirus. Compromised stability can lead to premature core disassembly, exposure of replication intermediates to cytosolic nucleic acid sensors that can trigger innate antiviral responses, and failure to integrate the proviral genome into the host DNA. Thus, core stability is a critical feature of viral replicative fitness. While there are several well-described techniques to assess viral capsid core stability, most are generally time and labor intensive. Recently, our group compared the relative stability of murine leukemia virus capsid cores using an in vitro detergent-based approach combined with ultracentrifugation against the popular fate of capsid assay. We found ...
[摘要] 衣壳核心的结构稳定性是逆转录病毒对细胞的生产性感染的关键参数。受损的稳定性可导致核心过早解体，将复制中间体暴露于细胞溶质核酸传感器，其可触发先天的抗病毒反应，并且不能将原病毒基因组整合到宿主DNA中。因此，核心稳定性是病毒复制适应性的关键特征。虽然有几种充分描述的技术来评估病毒衣壳核心稳定性，但大多数通常是时间和劳动密集型的。最近，我们小组使用基于体外洗涤剂的方法结合超速离心法对衣壳测定的流行命运比较了鼠白血病病毒衣壳核心的相对稳定性。我们发现两种方法都得出了类似的结论，尽管第一种方法是比较显示核心稳定性差异的病毒突变体时评估相对衣壳核心稳定性的一种非常简单和快速的方法。
【背景】逆转录病毒已经进化出复制周期，在规避宿主抗病毒反应方面表现优异。逆转录病毒开发的一种策略是将其复制中间体与胞质核酸传感器如cGAS，TREX1，IFI203和DDX41屏蔽起来（Yan et al。，2010; Gao et al。，2013; Lahaye et al。，2013; Stavrou et al。，2015）。在复制过程中，逆转录病毒在细胞质中产生RNA-DNA杂合体和未甲基化的双链前病毒DNA，这是先天免疫传感器的常见靶标（Yan et al。，2010; Gao et al。，2013; Lahaye et ...
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