| Fractionation of Ovarian Follicles and in vitro Oocyte Maturation and Ovulation Assay of Ciona intestinalis Type A
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Author:
Date:
2020-04-05
[Abstract] Ascidians are the closest living relatives of vertebrates (Delsuc et al., 2006; Satoh et al., 2014) and are important for the evolutionary study of the ovarian follicle development including oocyte maturation and ovulation. However, neither the endogenous factors nor the molecular mechanisms underlying the oocyte maturation and ovulation had been elucidated mainly due to the lack of efficient procedure for isolating ovarian follicles. Here, we present the protocol for the effective fractionation and isolation of the ovarian follicle of Ciona intestinalis type A using stainless steel sieves with various particle size-meshes, and the simple incubation method of Ciona follicles for evaluating oocyte maturation and ovulation. Combined with the RNA-seq data ...
[摘要] [摘要 ] 海鞘是脊椎动物的近亲（Delsuc 等，2006； Satoh 等，2014），对于卵巢卵泡发育（包括卵母细胞成熟和排卵）的进化研究具有重要意义。然而，尚未阐明卵母细胞成熟和排卵的内源性因素或分子机制，主要是由于缺乏有效的分离卵泡的程序。在这里，我们介绍了使用不同粒径的不锈钢筛网有效分离和分离A型Ciona 小肠卵巢卵泡的方案，以及Ciona 的简单孵育方法 卵泡用于评估卵母细胞的成熟和排卵。结合每个部分的RNA-seq数据，当前的方法使我们以特定阶段的方式研究包括卵母细胞成熟和排卵在内的卵巢卵泡发育。
[背景 ] Ciona 卵巢卵泡分为四个主要发育阶段：I期（卵黄形成前），II期（卵黄形成），III期（卵黄形成后，GVBD之前）和IV期（GVBD后，排卵）卵泡。 （图1；Prodon 等，2006； Silvestre 等，2009）。成年海鞘的卵巢在整个发育阶段都包含许多卵泡，因此，在特定阶段分离单个卵泡既费时又麻烦。这阻碍了卵泡发育的功能分析，并提示需要有效的卵泡分离方法。在这里，我们提供一种有效的分离方法，每一个developmenta的混合物卵泡的升级可以使用一系列的分馏不锈钢筛具有各种粒度目ES （20-150 μ 米）。当前的分级方法使我们能够轻松快速地分离出卵泡的整个发育阶段。此外，卵母细胞的成熟和排卵可以分别通过生发小泡b ...
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| Cell-free Reconstitution of the Packaging of Cargo Proteins into Vesicles at the trans Golgi Network
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Author:
Date:
2020-03-05
[Abstract] Protein sorting at the trans Golgi network (TGN) plays important roles in targeting newly synthesized proteins to their specific destinations. The aim of this proposal is to reconstitute the packaging of non-Golgi resident cargo proteins into vesicles at the TGN, utilizing rat liver cytosol, semi-intact mammalian cells and nucleotides. The protocol describes how to perform the vesicle formation assay, how to isolate vesicles and how to detect cargo proteins in vesicles. This reconstitution assay can be used to quantitatively measure the efficiency of the packaging of a specific cargo protein into transport vesicles at the TGN under specific experimental conditions.
[摘要] [摘要] 反式高尔基体网络（TGN）上的蛋白质分选在将新合成的蛋白质靶向其特定目的地方面起着重要作用。该提议的目的是利用大鼠肝细胞溶质，半完整的哺乳动物细胞和核苷酸，在TGN处将非高尔基驻留的货物蛋白重新包装成囊泡。该协议描述了如何进行囊泡形成测定，如何分离囊泡以及如何检测囊泡中的货物蛋白。该重构测定法可用于定量测量在特定实验条件下将特定货物蛋白包装到TGN的运输小泡中的效率。
[背景] 的反式高尔基体网络（TGN）是在分泌运送路径的必要的交通枢纽。为了确保水泡运输的保真度，真核细胞利用各种蛋白质分选设备将特定的货物蛋白质准确地包装到TGN的运输小泡中，然后运至特定的目的地（Guo 等人，2014）。为了加深我们对TGN分选过程特异性的理解，重要的是开发一种能够忠实地重构TGN囊泡形成和货物分选过程的分析方法。该测定法可用于直接和定量地测量特定因子在调节特定货物蛋白包装到运输小泡中的作用。从内质网（ER）将货物蛋白包装到COPII囊泡中的无细胞重构已得到很好的建立（Kim 等，2005; Kim 等，2007; Merte 等，2010; Yuan 等。，2018；Niu 等，2019；）。已经开发出一种体外测定法，其在TGN处重构特定货物蛋白TGN46在运输小泡中的释放（Ponnambalam 等，1996；Wakana ...
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| Myeloid Progenitor Transformation Assay
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Author:
Date:
2017-12-05
[Abstract] Numerous oncogenes have been identified to cause leukemia. For example, chromosomal translocation generates various fusion genes of the mixed-lineage leukemia (MLL) gene and a partner gene in leukemia, whose gene products transform primary myeloid progenitors into an immortalized state. To characterize the transforming ability of leukemic oncogenes, researchers in the field have developed an ex vivo murine myeloid transformation assay using retroviral gene transduction and its protocol has been improved over the past 10 years. Here, we provide the detailed procedure for this assay.
[摘要] 许多致癌基因已被确定为导致白血病。 例如，染色体易位在白血病中产生混合谱系白血病（MLL ）基因和伴侣基因的各种融合基因，其基因产物将原始骨髓祖细胞转化为永生状态。 为了表征白血病癌基因的转化能力，本领域的研究人员已经利用逆转录病毒基因转导开发了一种离体小鼠骨髓转化试验，其方案在过去的10年中得到了改进。 在这里，我们提供了这个检测的详细程序。
【背景】染色体易位产生多种导致白血病的MLL融合基因（Meyer等人，2017）。野生型混合谱系白血病（MLL）蛋白质起着转录调节剂的作用，其在造血不成熟祖细胞中增强包括同源框（homoxox（Hox））基因在内的一组基因的表达（Jude等。，2007）。在正常造血期间，Hox基因在干/祖细胞部分中表达，但在分化过程中转录下调（Somervaille和Cleary，2006; Yokoyama等人， 2013年）;然而，MLL融合蛋白组成性地上调其靶基因并阻断分化以在离体培养条件下建立永生状态。最近，我们报道了MLL-ENL和MLL-AF10融合蛋白招募AF4以激活转录并且还募集DOT1L复合物以维持相同靶基因的转录以有效地转化造血祖细胞（Okuda等人， ...
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