| A Robust Mammary Organoid System to Model Lactation and Involution-like Processes
|
|
Author:
Date:
2021-04-20
[Abstract] The mammary gland is a highly dynamic tissue that changes throughout reproductive life, including growth during puberty and repetitive cycles of pregnancy and involution. Mammary gland tumors represent the most common cancer diagnosed in women worldwide. Studying the regulatory mechanisms of mammary gland development is essential for understanding how dysregulation can lead to breast cancer initiation and progression. Three-dimensional (3D) mammary organoids offer many exciting possibilities for the study of tissue development and breast cancer. In the present protocol derived from Sumbal et al., we describe a straightforward 3D organoid system for the study of lactation and involution ex vivo. We use primary and passaged mouse mammary organoids stimulated with fibroblast growth factor 2 ...
[摘要]
[摘要]乳腺是一种高度动态的组织，在整个生殖生活中都会发生变化，包括青春期的生长以及怀孕和进化的重复周期。乳腺肿瘤诊断代表在世界女性最常见的癌症宽。研究的监管机制乳腺的发育是至关重要的理解荷兰国际集团d如何YS调节可导致乳腺癌的发生和发展。三维（3D）乳腺组织体提供了许多令人激动的可能性的研究的组织发育和乳腺癌。在第E存在衍生自协议Sumbal等人，我们描述一个简单的3D类器官系统的研究的泌乳和复古体外。我们使用成纤维细胞生长因子2 （FGF2）和催乳素刺激的原代和传代小鼠乳腺类器官来模拟小鼠乳腺泌乳和内卷过程的三个周期。这种3D模型类器官代表一个有价值的工具来研究后期产后乳腺的发育和乳腺癌，尤其是产后-相关性乳腺癌。
图形摘要：
乳腺类器官的分离和培养程序
[背景技术]的Th e是乳腺的主要功能是提供营养吨经由牛奶产量Ò新生儿。牛逼乳腺他的发展是主要发生在出生后，由几个因素，包括激素和生长因子调控的一个高度动态的过程（Brisken和拉贾拉姆，2006;斯特恩利希特，2006年）。在青春期，激素和生长因子调节基本的胚胎导管树的导管形态发生（Brisken and ...
|
|
|
| Quantitative ChIP-seq by Adding Spike-in from Another Species
|
|
Author:
Date:
2018-08-20
[Abstract] Chromatin immunoprecipitation followed by sequencing (ChIP-seq) is a routine procedure in the lab; however, epigenome-wide quantitative comparison among independent ChIP-seq experiments remains a challenge. Here, we contribute an experimental protocol combined with a computational workflow allowing quantitative and comparative assessment of epigenome using animal tissues.
[摘要] 染色质免疫沉淀，然后测序（ChIP-seq）是实验室中的常规程序; 然而，独立ChIP-seq实验之间的表观基因组范围的定量比较仍然是一个挑战。 在这里，我们提供了一个实验方案，结合计算工作流程，允许使用动物组织定量和比较评估表观基因组。
【背景】 修饰组蛋白的染色质和表观遗传复合物调节DNA对转录机制的可及性，从而允许直接控制基因表达。为了表征组蛋白修饰的表观基因组特征，染色质免疫沉淀然后测序（ChIP-seq）已成为一种广泛使用的方法。然而，传统的ChIP-seq方案本质上不是定量的，因此禁止直接比较源自不同细胞类型的样品或经历过不同遗传或化学扰动的细胞。尽管已经提出了几种 in silico 归一化方法来克服这个缺点，但仍然缺乏基于实验的策略。 2014年，奥兰多等人（2014）开发了一种名为ChIP的方法，该方法使用参考外源基因组（ChIP-Rx），该方法利用恒定量的参考或''spike-in''表观基因组基于细胞的表观基因组比较。在当前的协议中，我们通过使用映射的尖峰参考表观基因组的百分比来改进该方法。我们已成功应用此协议直接比较来自动物组织的两个或更多ChIP-seq数据集。
|
|
|