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CAPS

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Company: Sigma-Aldrich
Catalog#: C2632
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Identification of Buffer Conditions for Optimal Thermostability and Solubility of Herpesviral Protein UL37 Using the Thermofluor Assay
Author:
Date:
2020-06-20
[Abstract]  Structural and biochemical studies of proteins require high amounts of stable, purified proteins. Protein stability often depends on the buffer composition, which includes pH and concentration of salts or other solutes such as glycerol, hence an efficient method for identifying optimal buffer conditions for stability would minimize time and resources used for protein purification and further studies. This protocol describes the use of the Thermofluor assay, in combination with a custom 24-condition screen, to identify buffer conditions that increase protein thermostability, using the conserved herpesviral protein UL37 as an example. Detailed instructions on screen conditions, running the Thermofluor MATLAB script, and analyzing the data are provided. In comparison to circular dichroism ... [摘要]  [摘要]蛋白质的结构和生化研究需要大量稳定、纯化的蛋白质。蛋白质的稳定性通常取决于缓冲液的组成,其中包括pH值和盐或其他溶质(如甘油)的浓度,因此,确定最佳缓冲液稳定性条件的有效方法可以将用于蛋白质纯化和进一步研究的时间和资源减至最少。本协议描述了使用热氟分析,结合自定义的24条件筛选,以确定缓冲条件,增加蛋白质热稳定性,使用保存的疱疹病毒蛋白UL37为例。详细说明了屏幕条件,运行Thermofluor的MATLAB脚本,并对数据进行了分析。与圆二色谱法(CD)相比,缓冲屏结合热荧光分析法为蛋白质热稳定性分析提供了一种快速、信息量大的方法。

[背景]蛋白UL37在疱疹病毒的生命周期中具有多种功能,是高效病毒复制所必需的。作为病毒膜的一个组成部分——夹在包含衣壳和脂质膜的基因组之间的一层——UL37不仅是病毒组装所必需的(Desai等人,2001年;Jambunathan等人,2014年),而且也是有效的衣壳运输(Leege等人,2009年)、神经入侵(Richards等人,2017年)和对抗宿主天然免疫应答(Liu等人,2008;Zhao等人,2016)。要更好地理解其多功能性的本质,就需要对其结构和生化特性有详细的了解,而这又需要性能良好的纯化蛋白质。

不同UL37结构体的初始制备在溶解度、单分散性和纯化蛋白的产率方面存在差异,使得蛋白制备不一致,进一步的表征也不可重现。由于缓冲优化是解决这些问题的直接方法,我们开发了一种24条件筛选法,可以改变缓冲剂、pH值以及NaCl和甘油的浓度,并将其与热氟分析法结合使用(Phillips等人,2011年),以确定最大限度提高热稳定性的缓冲条件。UL37的N端和C端具有可变的平均热稳定性和最佳缓冲条件(图1,表1)。然而,在所有情况下,提高蛋白质稳定性的条件也提高了蛋白质的溶解度,最终提高了纯化蛋白质的产量,从而促进了下游的生化特性。 ...

Heterologous Expression and Purification of Catalytic Domain of CESA1 from Arabidopsis thaliana
Author:
Date:
2016-10-20
[Abstract]  Heterologous expression of plant cellulose synthase (CESA) and its purification has remained a challenge for decades impeding detailed biophysical, biochemical and structural characterization of this key enzyme. An in-depth knowledge of structure and function of CESA proteins would enable us to better understand the hierarchical structure of the plant cell wall. Here, we report a detailed, and reproducible method of purification of catalytic domain of CESA1 from Arabidopsis thaliana that was recombinantly expressed in Escherichia coli. The method relies on a two stage purification procedure to obtain the catalytic domain in monomer and trimer forms. The biochemical and biophysical data including low resolution structures of the protein have been published (Vandavasi et ... [摘要]  植物纤维素合酶(CESA)的异源表达及其纯化在数十年来一直是阻碍该关键酶的详细生物物理,生物化学和结构表征的挑战。对CESA蛋白的结构和功能的深入了解将使我们能够更好地理解植物细胞壁的层次结构。在这里,我们报告了在大肠杆菌中重组表达的来自拟南芥的CESA1的催化结构域的详细的和可重复的纯化方法。该方法依赖于两阶段纯化方法以获得单体和三聚体形式的催化结构域。已经公开了包括蛋白质的低分辨率结构的生物化学和生物物理数据(Vandavasi等人,2016)。目前,这种蛋白质的结晶研究正在进行中。

[Backg 圆形] 纤维素是植物细胞壁最重要的结构组分,地球最大的生物可再生材料来源,但它的植物合成机制了解很少。植物纤维素合成复合物(CSC),也称为"玫瑰花结",因为其在电子显微镜图像中的六聚体外观,是一个大的多亚基跨膜蛋白复合物负责纤维素链的合成和它们组装成微原纤维。 ...

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