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AmpliScribeTM T7-FlashTM Transcription Kit

Company: Epicentre
Catalog#: ASF3257
Bio-protocol()
Company-protocol()
Other protocol()

Genotyping-free Selection of Double Allelic Gene Edited Medaka Using Two Different Fluorescent Proteins
Author:
Date:
2017-12-20
[Abstract]  This protocol describes a simple genotyping using two different colors of fluorescent protein genes inserted at the target locus. This method makes it possible to determine the genotype of each individual simply by observing the fluorescence later than F1 generation. [摘要]  该协议描述了使用两种不同颜色的荧光蛋白基因插入目标基因座的简单基因分型。这种方法可以简单地通过观察比F1代更晚的荧光来确定每个个体的基因型。

【背景】由于基因组编辑动物的常规基因分型在很大程度上取决于基于PCR的基因分型,所以有必要提取基因组DNA。在青aka中,尾鳍是一种易于再生的组织,因此经常用于基因分型以保持鱼的活力。要切断尾鳍,必须喂鱼几周,使其长得足够大(体长约1厘米)。喂养和照顾许多鱼费时费力。因此,希望减少繁殖早期如胚和早期幼虫的鱼的数量,以减少任务。然而,由于胚胎和幼虫的尾鳍太小而脆弱,因此很难将它们活下来。为了克服这个问题,基因分型的一个简单和非侵入性的方法是必不可少的。因此,我们开发了一种新的方法,只需通过观察荧光就可以无创地确定每个胚胎期的基因型。我们在基因敲入实验中证实了该方法的益处,该实验针对在受精后4天(dpf)(Murakami)在中枢神经系统(CNS)中表达的生长相关蛋白43( gap43 et al 。,2017)。这个基因适用于基因敲入实验,因为在先前的研究中,已经通过RT-PCR和原位杂交揭示了其时空表达模式(Fujimori等, 。,2008)。如果野生型靶基因的表达模式是未知的,则需要通过RT-PCR或任何其他技术来分析,以证实其与基因敲入菌株中报道基因的对应性。

Cytosolic and Nuclear Delivery of CRISPR/Cas9-ribonucleoprotein for Gene Editing Using Arginine Functionalized Gold Nanoparticles
Author:
Date:
2017-10-20
[Abstract]  In this protocol, engineered Cas9-ribonucleoprotein (Cas9 protein and sgRNA, together called Cas9-RNP) and gold nanoparticles are used to make nanoassemblies that are employed to deliver Cas9-RNP into cell cytoplasm and nucleus. Cas9 protein is engineered with an N-terminus glutamic acid tag (E-tag or En, where n = the number of glutamic acid in an E-tag and usually n = 15 or 20), C-terminus nuclear localizing signal (NLS), and a C-terminus 6xHis-tag. [Cas9En hereafter]

To use this protocol, the first step is to generate the required materials (gold nanoparticles, recombinant Cas9En, and sgRNA). Laboratory-synthesis of gold nanoparticles can take up to a few weeks, but can be synthesized in large batches that can be used for many years without compromising the quality. Cas9En ...
[摘要]  在该方案中,使用工程化的Cas9-核糖核蛋白(Cas9蛋白和sgRNA,一起称为Cas9-RNP)和金纳米颗粒制备用于将Cas9-RNP递送至细胞质和细胞核的纳米组件。 Cas9蛋白用N末端谷氨酸标签(E标签或En,其中n = E-标签中的谷氨酸数目,通常n = 15或20),C末端核定位信号(NLS) ,和C末端6xHis标签。 [Cas9En]

为了使用该方案,第一步是产生所需的材料(金纳米颗粒,重组Cas9En和sgRNA)。金纳米颗粒的实验室合成可能需要长达数周,但可以批量合成,可以使用多年,而不损害质量。可以从常规SpCas9基因(Addgene plasmid id = 47327)克隆Cas9En,并使用不属于该方案的标准实验室程序进行表达和纯化。类似地,可以使用来自模板基因(Addgene plasmid id = 51765)的体外转录实验室合成sgRNA,或者可以从各种来源购买。

一旦这些材料准备就绪,制作Cas9En-RNP复合物大约需要30分钟,并使得Cas9En-RNP /纳米纳米组件立即用于输送(图1)。完成交付(90-95%细胞质和核递送)在不到3小时内实现。后续编辑实验需要根据用户需要额外的时间。

报道了精氨酸功能化金纳米粒子(ArgNPs)(Yang等人,2011),重组Cas9En的表达和sgRNA的体外合成的合成(Mout ...

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