| Expression and Purification of Recombinant Skd3 (Human ClpB) Protein and Tobacco Etch Virus (TEV) Protease from Escherichia coli
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Author:
Date:
2020-12-05
[Abstract] Skd3 (encoded by human CLPB) is a mitochondrial AAA+ protein comprised of an N-terminal ankyrin-repeat domain and a C-terminal HCLR-clade nucleotide-binding domain. The function of Skd3 has long remained unknown due to challenges in purifying the protein to high quality and near homogeneity. Recently we described Skd3 as a human mitochondrial protein disaggregase that solubilizes proteins in the mitochondrial intermembrane space. This protocol overcomes the challenges associated with purifying Skd3 and allows for in depth in vitro study of Skd3 activity. Tobacco etch virus (TEV) protease is required in the purification of Skd3. Thus, we also describe how to purify high quality TEV protease for use in the purification of Skd3, other purification protocols, and in vitro assays requiring TEV ...
[摘要] [摘要] Skd3（由人类CLPB编码）是一种线粒体AAA +蛋白，由N末端锚蛋白重复域和C末端HCLR分支核苷酸结合域组成。由于在纯化蛋白质达到高质量和接近均质性方面的挑战，Skd3的功能长期未知。最近，我们描述Skd3作为人类线粒体蛋白disaggregase ，在线粒体膜间间隙增溶蛋白。该协议克服了与纯化Skd3相关的挑战，并允许对Skd3活性进行深入的体外研究。Skd3的纯化需要烟草蚀刻病毒（TEV）蛋白酶。因此，我们还描述了如何净化高质量TEV蛋白酶可用于纯化Skd3，其他纯化方案以及需要TEV蛋白酶的体外测定。
[背景] Skd3是一种线粒体AAA +蛋白，与多系统线粒体疾病VII型3-甲基谷氨酸酸尿症（MGCA7）有关（Capo-Chichi等人，2015； Kanabus等人，2015； Saunders等人，， 2015; Wortmann等人，2015 ; Kiykim等人，2016 ）。由于在体外研究Skd3的能力有限，因此对生物学功能和这些突变对Skd3活性的影响的研究仍难以捉摸（Cupo和Shorter，2020； ...
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| Isolation, Purification and Characterization of Exosomes from Fibroblast Cultures of Skeletal Muscle
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Author:
Date:
2020-04-05
[Abstract] Exosomes are dynamic nanovesicles secreted by virtually all cells and are present in all biological fluids. Given their highly heterogeneous content exosomes have been implicated in many physiological and pathological processes that they exert by influencing cell-cell and cell-ECM communication. In recent years an increasing number of methods have been established for the purification and characterization of exosomes. These include ultracentrifugation, ultrafiltration, size exclusion chromatography, immune capture and precipitation using a proprietary polymer. Here, we provide a protocol based on differential ultracentrifugation and sucrose density gradients tailored for the isolation of crude and ultra-pure exosomes from primary fibroblast cultures derived from adult mouse skeletal ...
[摘要] [摘要 ] 外来体是几乎所有细胞分泌的动态纳米囊泡，并存在于所有生物体液中。鉴于它们的异质含量很高，外泌体已牵涉到它们通过影响细胞-细胞和细胞-ECM通讯而发挥的许多生理和病理过程。近年来，已经建立了越来越多的方法外泌体的纯化和表征。其中包括超速离心，超滤，尺寸排阻色谱，免疫捕获和使用专有聚合物的沉淀。在这里，我们提供了基于差分超速离心和蔗糖密度梯度的协议，该协议专门用于从成年小鼠骨骼肌衍生的原代成纤维细胞培养物中分离粗制和超纯外泌体。可以对该协议进行修改和修改，以从各种组织和体液中分离和表征外泌体。
背景 ] ë xosomes是单膜，异质纳米囊泡直径范围从30至150nm，secre 由所有细胞和存在于几乎所有的体液泰德。外泌体中存在的可溶性和膜大分子，mRNA，microRNA的光谱取决于代谢状态以及分泌这些纳米囊泡的细胞的发育起源。由于它们的货物组成，外泌体可以启动接收细胞中的信号传导途径，并参与了发育，免疫和正常组织生理的维持。在神经退行性疾病，纤维化和癌症等疾病条件下，它们被证明可以触发和传播病理刺激（Rackov 等，2018; Gurunathan 等，2019; van de Vlekkert 等，2019）。在这里，我们描述了从成年小鼠腓肠肌（GA）肌肉建立的成纤维细胞培养物中纯化外泌体的方案（van de Vlekkert ...
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| Differentiation of Myeloid-derived Suppressor Cells from Murine Bone Marrow and Their Co-culture with Splenic Dendritic Cells
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Author:
Date:
2017-09-20
[Abstract] Myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) possess the ability to suppress the immune response, and to amplify the regulatory properties of other immune cells, i.e., dendritic cells. Here we describe a protocol in which MDSCs were differentiated from murine bone marrow cells, and CD11c+ dendritic cells were purified from murine spleens. MDSCs and CD11c dendritic cells can be co-cultured and the immunoregulatory phenotype of the MDSCs-conditioned dendritic cells could be assessed by means of a specific functional in vivo experiment, i.e., a skin test as a measure of the delayed-type hypersensitivity reaction toward a poorly immunogenic antigen.
[摘要] 骨髓来源的抑制细胞（MDSCs）具有抑制免疫应答的能力，并扩增其他免疫细胞即树突状细胞的调节特性。 在这里，我们描述了MDSC与鼠骨髓细胞分化的方案，并且从鼠脾中纯化CD11c +树突状细胞。 可以共培养MDSC和CD11c树突状细胞，并且可以通过特定的功能体内实验来评估MDSCs条件树突细胞的免疫调节表型，即皮肤试验作为延迟型超敏反应的量度 抗免疫原性较差的抗原。
【背景】骨髓来源的抑制细胞（MDSCs）是由早期分化阶段的巨噬细胞，粒细胞，树突状细胞和骨髓细胞的前体组成的骨髓细胞组（Youn等人，2008），其在肿瘤的淋巴组织中大量积累感染性小鼠以及感染性疾病，败血症和创伤的小鼠。这些细胞的主要特征是它们以Ag特异性和/或非特异性方式抑制T细胞应答的能力。这些细胞现在被认为是负责肿瘤相关免疫缺陷的主要细胞类型之一;涉及MDSC介导的免疫抑制的主要因素包括Arg1的高表达（Marvel和Gabrilovich，2015）。精氨酸酶1（Arg1）和吲哚胺2,3-双加氧酶1（IDO1）分别是催化L-精氨酸（L-Arg）和L-色氨酸（L-Trp）降解的免疫调节酶，导致局部氨基酸剥夺。此外，与Arg1不同，IDO1在树突细胞（DC）中也具有非酶信号传导活性（Mondanelli等，2017）。除了其固有的免疫抑制活性外，MDSC还可能扩增其他免疫细胞的调节特性，特别是在肿瘤微环境中。虽然建立了MDSC-巨噬细胞相互作用的一些机制（Ugel等，2015），MDSCs和DCs之间的串扰仍然不清楚（Ostrand-Rosenberg等，2012）;为弥补这一差距，我们已经制定了该方案，并且我们证明了Arg1 ...
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