| Quantification of Starch in Guard Cells of Arabidopsis thaliana
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Author:
Date:
2018-07-05
[Abstract] In this protocol, we describe how to quantify starch in guard cells of Arabidopsis thaliana using the fluorophore propidium iodide and confocal laser scanning microscopy. This simple method enables monitoring, with unprecedented resolution, the dynamics of starch in guard cells.
[摘要] 在该方案中，我们描述了如何使用荧光团碘化丙啶和共聚焦激光扫描显微镜来量化拟南芥保卫细胞中的淀粉。 这种简单的方法能够以前所未有的分辨率监测保卫细胞中淀粉的动态变化。
【背景】淀粉是葡萄糖的复合聚合物，代表植物储存碳水化合物的最丰富形式。淀粉根据其衍生的细胞类型和外部环境条件提供不同的功能。在控制水和二氧化碳与环境交换的气孔中边界的保卫细胞中，淀粉可在转变为光的几分钟内动员，有助于产生有机酸和糖，从而增加保卫细胞膨胀并促进气孔开放。在叶肉细胞中，淀粉通常在白天逐渐积累，并在夜间降解以支持代谢（Santelia和Lunn，2017）。
因为保卫细胞仅占总叶的一小部分，所以难以使用常规方法定量测量淀粉。到目前为止，保卫细胞中的淀粉积累主要通过碘染色显现。该技术可以确定淀粉的存在/不存在，但不能提供准确的定量信息。
在这里，我们描述了一种基于荧光的成像方法来量化拟南芥保护细胞中的淀粉。该技术基于细胞壁材料和其他葡聚糖底物（包括淀粉）与荧光假席夫试剂碘化丙啶（PS-PI）的共价标记。用高碘酸处理分离的表皮，以将葡萄糖单元的羟基氧化成醛和酮基团。然后醛基（-CHO）可以与碘化丙锭共价反应，产生具有高荧光葡聚糖的样品，非常适合于共聚焦激光扫描显微镜。保卫细胞叶绿体中单个淀粉颗粒的面积可以使用数字成像来确定。我们应用这种方法来评估完整的拟南芥叶片的保护细胞中的淀粉含量在昼夜循环中的动态变化，并确定fusicoccin（质子泵的化学活化剂）对淀粉量的影响。分离表皮的保卫细胞剥离漂浮在气孔开放缓冲液中的碎片（Horrer ...
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| Crude Preparation of Lipopolysaccharide from Helicobacter pylori for Silver Staining and Western Blot
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Author:
Date:
2017-10-20
[Abstract] This protocol provides an easy and rapid method to prepare lipopolysaccharide from the gastric pathogen Helicobacter pylori for visualization on acrylamide gels by silver staining and for detecting the presence of Lewis antigens by Western blot. The silver staining is a four-step procedure, involving a 20 min-oxidation step, a 10 min-silver staining step, a 2-10 min color development step and finally a 1-min color termination step. Lipopolysaccharide from H. pylori wild-type and corresponding mutants analyzed by this method are described in a recent publication (Li et al., 2017). This crude preparation of LPS for silver staining is also applicable in other Gram-negative bacteria.
[摘要] 该方案提供了一种从胃病原幽门螺杆菌制备脂多糖的简便快速方法，用于通过银染显示丙烯酰胺凝胶，并通过Western印迹检测Lewis抗原的存在。 银染是四步法，包括20分钟氧化步骤，10分钟银染色步骤，2-10分钟显色步骤，最后是1分钟颜色终止步骤。 来自H的脂多糖。 在最近的出版物（Li等人，2017）中描述了通过该方法分析的野生型和相应的突变体的幽门螺杆菌。 这种用于银染的LPS的粗制剂也适用于其他革兰氏阴性细菌。
【背景】脂多糖（LPS）是一种大而可变的复合糖脂，其组成了大多数革兰氏阴性细菌外膜的外叶。 它通常由三个结构域组成：称为脂质A（或内毒素）的疏水结构域，其嵌入外膜中; 相对保守的非重复核 - 低聚糖; 和从细胞延伸到外部环境的可变O-抗原。 H的独特功能。 幽门螺杆菌脂多糖O抗原是模拟人Lewis抗原的岩藻糖基化寡糖结构的存在。 从革兰氏阴性细菌大规模提取高纯度的LPS是劳动密集型和耗时的。 在这里，在这个协议中，我们详细地描述了使用来自胃病原幽门螺杆菌的容易和快速的粗制备制剂用于通过银染和Lewis抗原通过蛋白质印迹进行表达。
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| Analyzing the Properties of Murine Intestinal Mucins by Electrophoresis and Histology
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Author:
Date:
2017-07-20
[Abstract] Specialized secretory cells known as goblet cells in the intestine and respiratory epithelium are responsible for the secretion of mucins. Mucins are large heavily glycosylated proteins and typically have a molecular mass higher than 106 Da. These large proteins are densely substituted with short glycan chains, which have many important functional roles including determining the hydration and viscoelastic properties of the mucus gel that lines and protects the intestinal epithelium. In this protocol, we comprehensively describe the method for extraction of murine mucus and its analysis by agarose gel electrophoresis. Additionally we describe the use of High Iron Diamine-Alcian Blue, Periodic Acid Schiff’s-Alcian Blue and immune–staining methods to identify and differentiate ...
[摘要] 在肠和呼吸上皮中称为杯状细胞的专门分泌细胞负责粘蛋白的分泌。 粘蛋白是大的重糖基化蛋白质，通常具有高于10μM的分子量。 这些大蛋白质被短聚糖链密集取代，其具有许多重要的功能作用，包括测定粘液凝胶的水合和粘弹性质，其保护肠上皮。 在该方案中，我们全面地描述了通过琼脂糖凝胶电泳提取小鼠粘液的方法及其分析。 此外，我们描述了使用高铁二胺 - 阿尔星蓝，周期酸席夫氏 - 阿尔辛蓝和免疫染色方法来鉴别和区分这些粘蛋白糖蛋白上糖基化的不同状态，特别是侧重于硫酸化和唾液酸化。
【背景】一层粘液保护肠上皮，主要由粘蛋白，水，蛋白质和无机盐组成。粘液屏障的粘性和凝胶状特性使其能够物理保护和润滑粘膜，主要由粘蛋白赋予。粘蛋白是大的重糖基化蛋白质，通常具有高于10μM的分子量。然而，粘蛋白主要用O-聚糖糖装饰，其占分子量的80％。不同的位点特异性和粘蛋白特异性糖基化模式影响粘蛋白和粘液凝胶的性质。众所周知，粘蛋白糖基化在感染和疾病中发生改变（Arike等人，2017; ...
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