| Characterising Maturation of GFP and mCherry of Genomically Integrated Fusions in Saccharomyces cerevisiae
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Author:
Date:
2018-01-20
[Abstract] Single-molecule fluorescence microscopy enables unrivaled sub-cellular quantitation of genomically encoded fusions of native proteins with fluorescent protein reporters. Fluorescent proteins must undergo in vivo maturation after expression before they become photoactive. Maturation effects must be quantified during single-molecule analysis. Here we present a method to characterise maturation of GFP and mCherry genetic protein fusions in budding yeast Saccharomyces cerevisiae.
[摘要] 单分子荧光显微镜技术使天然蛋白与荧光蛋白报告基因的基因组编码融合成为无与伦比的亚细胞定量。 荧光蛋白质在表达后必须进行体内成熟，然后它们变成光敏的。 成熟效应必须在单分子分析过程中进行量化。 在这里，我们提出一种方法来表征GFP和mCherry遗传蛋白融合在芽殖酵母酿酒酵母中的成熟。
【背景】单分子荧光显微技术能够灵敏定量分子化学计量，流动性和拷贝数，不仅在逐个细胞的基础上，而且精确到个别的亚细胞区室（Leake，2012; Wollman和Leake，2015; Shashkova， >等。，2017）。该技术依赖于感兴趣的野生型蛋白质的内源表达的荧光蛋白融合，从而存在一对一的标记。然而，所有荧光蛋白在进入明亮的荧光状态之前的体内成熟时间从几分钟到几十分钟不等（Badrinarayanan等人，2012）。因此，测量任何成熟效应和量化是否存在标记蛋白质的不成熟“暗部分”是最重要的。这些测量也与光漂白（FRAP）后的荧光恢复特别相关。 FRAP可用于研究活细胞中的分子转换（Beattie等人，2017）。 FRAP基于荧光标记组分定位的细胞区域的光漂白，随后定量该区域随时间的任何荧光恢复。可以使用在初始光漂白剂之后作为时间函数的荧光强度之间的测量关系来确定分子迁移率和动力学参数，例如特定荧光组分从分子复合物解离的速率（Leake等人， ...
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| Isolation and Expansion of Mesenchymal Stem Cells from Murine Adipose Tissue
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Author:
Date:
2017-08-20
[Abstract] Mesenchymal stem cells (MSCs) are currently intensively studied due to significant promise which they represent for successful implementations of future cell therapy clinical protocols. This in turn emphasizes importance of careful preclinical studies of MSC effects in various murine disease models. The appropriate cell preparations with reproducible biological properties are important to minimize variability of results of experimental cell therapies. We describe here a simple protocol for isolation of murine MSCs from adipose tissues and their reproducible multi-log expansion under hypoxia conditions.
[摘要] 间充质干细胞（MSC）目前正在深入研究，因为它们代表未来细胞治疗临床方案的成功实施的重大前景。 这又强调了对各种鼠疾病模型中MSC效应的仔细临床前研究的重要性。 具有可重现的生物学性质的合适的细胞制剂对于最小化实验细胞疗法结果的变异性是重要的。 我们在这里描述了一种用于从脂肪组织中分离鼠MSC的简单方案及其在缺氧条件下的可重复的多对数扩增。
【背景】最初由Friedenstein鉴定的MSC是成纤维细胞样形态的骨髓细胞，粘附于塑料和高自我更新能力，导致体外成纤维细胞样集落的形成（Friedenstein等，1976; Review in Phinney andSensebé ，2013）。 MSCs由于其在医学上的潜在应用，目前是研究最成熟的成体祖细胞类型之一。这些细胞可以从各种器官中分离（Murray等，2014），并且被认为是源于血管，以周细胞或血管壁细胞。除了能够沿着成骨，脂肪形成和软骨形成谱系分化的能力之外，MSC具有免疫调节特性，并且被认为参与对组织损伤的反应，以及通过其影响巨噬细胞极化的能力来组织抗炎反应（Prockop，2013; Caplan，2016）。
鉴于这些特性，MSCs代表了未来相关细胞治疗临床方案的成功实施的巨大前景。这反过来强调了在各种鼠疾病模型中使用MSC进行仔细临床前研究的重要性。制备大量具有可重复生物学特性的合适细胞样品的能力对于在开发基于MSC的实验细胞疗法期间最小化结果的变异性至关重要。然而，与具有强抗氧化防御性并因此在大气氧条件下相当好的人类MSC不同，小鼠MSC对氧应激更敏感，并且在常规CO2培养箱中培养时具有有限的寿命和扩张能力。相反，在缺氧条件下培养这些细胞，相反，显着延长了它们的寿命，并允许多对数扩增，提供足够量的具有可重复性质的细胞材料，用于用鼠实验疾病模型重复实验（Boregowda等，2012; ...
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| Evaluation of Plasmid Stability by Negative Selection in Gram-negative Bacteria
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Author:
Date:
2017-05-05
[Abstract] Plasmid stability can be measured using antibiotic-resistance plasmid derivatives by positive selection. However, highly stable plasmids are below the sensitivity range of these assays. To solve this problem we describe a novel, highly sensitive method to measure plasmid stability based on the selection of plasmid-free cells following elimination of plasmid-containing cells. The assay proposed here is based on an aph-parE cassette. When synthesized in the cell, the ParE toxin induces cell death. ParE synthesis is controlled by a rhamnose-inducible promoter. When bacteria carrying the aph-parE module are grown in media containing rhamnose as the only carbon source, ParE is synthesized and plasmid-containing cells are eliminated. Kanamycin resistance (aph) is ...
[摘要] 可以通过阳性选择使用抗生素抗性质粒衍生物来测量质粒稳定性。然而，高度稳定的质粒低于这些测定的灵敏度范围。为了解决这个问题，我们描述了一种新颖的，高度灵敏的方法来测量质粒稳定性，这是基于在含有质粒的细胞消除后，无质粒细胞的选择。这里提出的检测方法是基于aph-parE 盒式磁带。当细胞合成时，ParE毒素诱导细胞死亡。 ParE合成由鼠李糖诱导型启动子控制。当携带 aph-parE 模块的细菌生长在含有鼠李糖作为唯一碳源的培养基中时，合成ParE，消除含有质粒的细胞。进一步使用卡那霉素抗性（ aph ）来证实在鼠李糖生长的细菌中不存在质粒。
背景 通过使用抗生素抗性质粒衍生物的阳性选择测定质粒稳定性。携带研究质粒的细胞在选择性抗生素（Gerdes等人，1985; del Solar等人，1987）的存在下被阳性选择。这种技术的主要缺点是其灵敏度;高度稳定的质粒低于这些测定的敏感性。为了解决这个问题，已经描述了依靠直接选择无质粒细胞例如 - 四环素系统的替代方法（Bochner等人，1980; Maloy和Nunn，1981; Garcia-Quintanilla 等人，2006）。 - ...
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