| A Quantitative Assay to Measure Stress Granule Association of Proteins and Peptides in Semi-permeabilized Human Cells
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Author:
Date:
2020-12-20
[Abstract] Stress granules (SGs) are membrane-less organelles that form in the cytoplasm through phase separation, in response to diverse stressors. SGs contain translationally stalled mRNAs, proteins involved in translation, and various RNA-binding proteins (RBPs). Due to the high local concentration of aggregation-prone RBPs, SGs might act as condensation sites for aberrant phase transitions of RBPs and could favor formation of solid protein aggregates underlying the pathological cytoplasmic inclusions found in numerous neurodegenerative diseases. Most assays aiming at studying the recruitment of RBPs into SGs are based on overexpression and SG recruitment of RBPs in intact cells. These approaches are, however, often limited by the predominantly nuclear localization of many RBPs, which precludes ...
[摘要] [摘要]圣RESS颗粒剂（SGS）是膜较少细胞器形式在通过相分离细胞质中，响应于不同的压力源。SG包含翻译停滞的mRNA，翻译中涉及的蛋白和各种RNA结合蛋白（RBP）。由于易于凝集的RBP的局部浓度很高，SG可能充当RBP异常相变的缩合位点，并且可能有助于形成在许多神经退行性疾病中发现的病理性细胞质内含物的固体蛋白质聚集体。大多数分析瞄准荷兰国际集团在研究限制性商业惯例的招募SG的基础上表达和SG招聘完整细胞的限制性商业惯例。但是，这些方法通常受到许多RBP的主要核定位的限制，这排除了足以进行SG定位的细胞质RBP浓度，并且没有解决独立于SG形成的RBP募集问题。在这里，我们提出了一个定量的方法来评估重组限制性商业惯例的募集至预先形成的SG，独立于RBP的核定位，用半透细胞和荧光显微镜。在该测定中，SG被第一LY由应激诱导的，然后第质膜ë应激的细胞随后被选择性地透化，以提供重组蛋白的访问的SG。通过用小麦胚芽凝集素阻塞核孔来阻止目的蛋白的核输入。这种测定方法使人们能够定量研究在没有核导入且在受控条件下将RBP募集到SG中的分子机制。该方法允许对野生型，突变体或直接比较翻译后修饰的限制性商业惯例，用于解决第其它蛋白质电子影响“预防或促进限制性商业惯例的SG关联，并且也适用于合成的肽。
图形摘要：
工作流概述在半SG招募重组蛋白质或肽的分析透化细胞 ...
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| H1N1 Virus Production and Infection
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Author:
Date:
2018-10-20
[Abstract] Influenza A virus is a member of orthomyxoviridae family causing wide-spread infections in human respiratory tract. Mouse infection model is widely used in antiviral research and pathogenesis study against influenza A virus. Here, we report a protocol in infected mice with different virus doses and strains to explore how an inhibitor of lysine-specific demethylase (LSD1) impacts disease progression.
[摘要] 甲型流感病毒是正粘病毒科的成员，在人呼吸道中引起广泛的感染。 小鼠感染模型广泛用于抗甲型流感病毒的抗病毒研究和发病机制研究。 在这里，我们报告了受感染小鼠中具有不同病毒剂量和菌株的方案，以探索赖氨酸特异性去甲基化酶（LSD1）的抑制剂如何影响疾病进展。
【背景】甲型流感病毒是正粘病毒科的一员，是一种负义RNA病毒，具有八个分段的单链病毒RNA（vRNA）基因组，编码10种以上的蛋白质。在过去100年中，流感病毒株的爆发经常出现在人群中，包括1918年由H1N1亚型引起的“西班牙流感”，1957年由H2N2引起的“亚洲流感”，1968年由H3N2引起的“香港流感”， “H1N1流感”于1977年发生的“俄罗斯流感”，以及2009年H1N1流行的“猪流感”（Smith et al。>，2009; Lim and Mahmood，2011; Kumar et al。> ，2018年）。季节性甲型流感病毒也在世界范围内传播，容易在人与人之间传播，每年导致全世界300万至500万人住院（Molinari et al。>，2007）。季节性流感感染每年导致290,000-650,000人死亡，主要是年幼儿童，老年人和重症患者（Kumar et al。>，2018）。
流感病毒研究中使用动物模型不仅可以阐明影响疾病结果的病毒和宿主因素，还可以在易感宿主中传播，还可以评估旨在预防或降低流感发病率和死亡率的干预措施（Thangavel和Bouvier，2014）。在本文中，我们使用两种甲型流感病毒，A ...
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| Isolation and Culture of Mouse Lung ILC2s
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Author:
Date:
2018-10-05
[Abstract] Group 2 Innate Lymphoid Cells (ILC2) play an important role in immune responses at barrier surfaces, notably in the lung during airway allergic inflammation or asthma. Several studies have described methods to isolate ILC2s from wild-type naive mice, most of them using cell sorting to obtain a pure population. Here, we describe in detail, a simple, efficient method for isolation and culture of lung mouse ILC2s. Lungs from Rag2-/- mice pretreated with IL-33 are collected and processed into single cell suspensions. Lymphoid cells are then recovered by density gradient separation. Lin-CD45+ cells are selected by depletion of lineage positive cells followed by positive selection of CD45+ cells. Culture of the isolated cells for several days ...
[摘要] 第2组先天性淋巴细胞（ILC2）在屏障表面，特别是在气道过敏性炎症或哮喘期间的肺中的免疫应答中起重要作用。一些研究已经描述了从野生型幼稚小鼠中分离ILC2的方法，其中大多数使用细胞分选来获得纯种群。在这里，我们详细描述了一种简单有效的肺小鼠ILC2分离和培养方法。收集用IL-33预处理的 Rag2 - / - 小鼠的肺并加工成单细胞悬浮液。然后通过密度梯度分离回收淋巴样细胞。通过耗尽谱系阳性细胞然后阳性选择CD45 + 细胞来选择Lin - CD45 + 细胞。将分离的细胞培养数天导致高度纯化的ILC2群体表达典型的细胞表面标志物（CD90.2，Sca1，CD25，CD127和IL-33R）。这些细胞可在培养物中扩增长达10天，并用于多种离体测定或体内过继转移实验。
【背景】第2组先天性淋巴细胞（ILC2）是组织驻留细胞，其在抗寄生虫先天免疫以及过敏性炎症的发展中起关键作用。它们通过产生大量的2型细胞因子IL-5和IL-13对上皮细胞衍生的细胞因子如白细胞介素-33（IL-33）起反应，后者又诱导嗜酸性粒细胞增多和粘液产生（Cayrol和Girard，2018）。为了更好地表征这些细胞的功能和调节，许多组通过荧光激活细胞分选（FACS）从野生型小鼠（WT）的肺中分选ILC2。由于稳定状态下肺中存在的ILC2数量较少，因此该方法导致纯化细胞的产量较低（每只小鼠1×10 ...
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