| Direct Visualization of the Multicopy Chromosomes in Cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942
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Author:
Date:
2018-08-05
[Abstract] Cyanobacteria are prokaryotic organisms that carry out oxygenic photosynthesis. The fresh water cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942 is a model organism for the study of photosynthesis and gene regulation, and for biotechnological applications. Besides several freshwater cyanobacteria, S. elongatus 7942 also contains multiple chromosomal copies per cell at all stages of its cell cycle. Here, we describe a method for the direct visualization of multicopy chromosomes in S. elongatus 7942 by fluorescence in situ hybridization (FISH).
[摘要] 蓝细菌是进行含氧光合作用的原核生物。 淡水蓝藻 Synechococcus elongatus PCC 7942是用于研究光合作用和基因调控以及生物技术应用的模式生物。 除了几种淡水蓝藻， S. 细胞 7942在其细胞周期的所有阶段每个细胞还含有多个染色体拷贝。 在这里，我们描述了一种直接可视化 S中多拷贝染色体的方法。 通过荧光原位杂交（FISH）测定细菌 7942。
【背景】蓝藻是原核微生物，其利用与高等植物中的叶绿体类似的产氧光合系统。虽然 Escherichia coli 和枯草芽孢杆菌等细菌具有单个圆形染色体，但是几种淡水蓝细菌每个细胞有多个圆形染色体（Mann和Carr，1974; Labarre 等人，1989; Binder和Chisholm，1995）。淡水蓝藻 Synechococcus elongatus PCC 7942（以下简称 S.longatus 7942）每个细胞携带3-8个染色体拷贝（Griese et al。，2011; Watanabe et al。，2012; Watanabe et al。，2015）。已经建立了荧光报告子 - 操纵子系统来获取 S的多拷贝染色体的图像。 elongatus 7942（Chen et al。，2012; Jain et ...
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| In vitro Enzymatic Assays of Histone Decrotonylation on Recombinant Histones
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Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract] Class I histone deacetylases (HDACs) are efficient histone decrotonylases, broadening the enzymatic spectrum of these important (epi-)genome regulators and drug targets. Here, we describe an in vitro approach to assaying class I HDACs with different acyl-histone substrates, including crotonylated histones and expand this to examine the effect of inhibitors and estimate kinetic constants.
[摘要] I类组蛋白去乙酰化酶（HDACs）是有效的组蛋白去蛋白酶，拓宽了这些重要（epi-）基因组调节因子和药物靶标的酶谱。 在这里，我们描述了一种体外方法来测定具有不同酰基 - 组蛋白底物的I类HDAC，包括巴豆酰化组蛋白，并将其扩展以检查抑制剂的作用并估计动力学常数。
【背景】组蛋白的翻译后修饰是基因组调控的重要方面，包括基因表达（例如参见Pengelly et al。，2013;在Castillo 等人中综述，2017）。组蛋白修饰改变染色质结构和/或调节蛋白质的结合，例如核小体重塑因子（在Bannister和Kouzarides，2011中综述）。大多数组蛋白修饰是可逆的并且可以酶促去除。例如，通过组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）除去组蛋白乙酰化，其中存在几类。近年来，新的组蛋白赖氨酸酰化，包括琥珀酰化，丙酰化，丁酰化，羟基丁基化和巴豆酰化已成为规范组蛋白乙酰化的新替代物，并且已经证实了许多这些新发现的组蛋白修饰的功能相关性（Sabari 等人，2017）。特别是，组蛋白巴豆酰化与活性基因表达有关，并被认为受细胞代谢状态的影响（Sabari et al。，2015; Fellows et al。 ，2018年）。最近已显示I类组蛋白脱乙酰酶也有效地去除组蛋白质（Wei et al。，2017; Fellows et al。，2018）。
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| Preparation of Cerebellum Granule Neurons from Mouse or Rat Pups and Evaluation of Clostridial Neurotoxin Activity and Their Inhibitors by Western Blot and Immunohistochemistry
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Author:
Date:
2018-07-05
[Abstract] Cerebellar Granule Neurons (CGN) from post-natal rodents have been widely used as a model to study neuronal development, physiology and pathology. CGN cultured in vitro maintain the same features displayed in vivo by mature cerebellar granule cells, including the development of a dense neuritic network, neuronal activity, neurotransmitter release and the expression of neuronal protein markers. Moreover, CGN represent a convenient model for the study of Clostridial Neurotoxins (CNT), most notably known as Tetanus and Botulinum neurotoxins, as they abundantly express both CNT receptors and intraneuronal substrates, i.e., Soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor activating protein receptors (SNARE proteins). Here, we describe a protocol for obtaining a highly pure ...
[摘要] 来自产后啮齿动物的小脑颗粒神经元（CGN）已被广泛用作研究神经元发育，生理学和病理学的模型。 CGN体外培养维持成熟小脑颗粒细胞在体内显示的相同特征，包括发育致密的神经炎网络，神经元活动，神经递质释放和神经元的表达 蛋白质标记。 此外，CGN代表了梭菌神经毒素（CNT）研究的便利模型，最着名的是破伤风和肉毒杆菌神经毒素，因为它们大量表达CNT受体和神经元内基质， ie ，可溶性N-乙基马来酰亚胺 - 敏感因子激活蛋白受体（SNARE蛋白）。 在这里，我们描述了从出生后大鼠/小鼠获得高纯度CGN培养物的方案和用CNT中毒的简便方法。 我们还说明了评估CNT活性及其抑制的方便方法。
【背景】梭菌神经毒素（CNT）的大家族由破伤风神经毒素（TeNT）和肉毒杆菌神经毒素（BoNT）的多种变体形成，它们分别是破伤风和肉毒中毒的神经麻痹毒素（Schiavo et al。，2000; Johnson和Montecucco，2008; Rossetto et al。，2014）。 TeNT，七种BoNT血清型（BoNT / A至/ G）及其许多亚型是金属蛋白酶，通过切割SNARE蛋白（可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子激活蛋白受体），三种必需蛋白质来阻断神经递质的释放而引起神经麻痹。控制突触小泡与突触前质膜的融合（Rossetto et al。，2014; ...
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