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KpnI-HF®

Company: New England Biolabs
Catalog#: R3142S
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Other protocol()

Generation of Targeted Knockout Mutants in Arabidopsis thaliana Using CRISPR/Cas9
Author:
Date:
2017-07-05
[Abstract]  The CRISPR/Cas9 system has emerged as a powerful tool for gene editing in plants and beyond. We have developed a plant vector system for targeted Cas9-dependent mutagenesis of genes in up to two different target sites in Arabidopsis thaliana. This protocol describes a simple 1-week cloning procedure for a single T-DNA vector containing the genes for Cas9 and sgRNAs, as well as the detection of induced mutations in planta. The procedure can likely be adapted for other transformable plant species. [摘要]  CRISPR / Cas9系统已成为植物及其以外基因编辑的强大工具。 我们已经开发了植物载体系统,用于拟南芥中多达两个不同靶位点的基因的目标Cas9依赖性诱变。 该方案描述了对于含有Cas9和sgRNA的基因的单个T-DNA载体的简单的1周克隆程序,以及植物中诱导突变的检测。 该方法可能适用于其他可转化植物物种。
【背景】CRISPR / Cas9系统(Cas9)提供了一种简单且广泛适用的方法来修改感兴趣的基因组区域,因此成为植物和其他生物体基因组编辑的首选工具(Schiml和Puchta,2016)。该系统依赖于可以通过短的人造单指导RNA分子(sgRNA)向基因组DNA序列引导的化脓性链球菌(Cas9)的细菌Cas9核酸酶(Jinek等人, ,2012),在那里它创建一个双链断裂(DSB)。然后通过植物细胞的固有DNA修复机制修复这些DSB。在这里,可以区分两个主要途径(Salomon和Puchta,1998)。 (i)与DSB位点高度同源的DNA分子可用作修复模板。可以利用这种同源性定向修复(HDR)方法在DSB的现场引入特定的序列(Schiml等人,2014; Baltes and Voytas,2015)。然而,由于这些序列的低融合率,植物中HDR介导的基因编辑仍然具有挑战性。 ...

Use of Geminivirus for Delivery of CRISPR/Cas9 Components to Tobacco by Agro-infiltration
Author:
Date:
2017-04-05
[Abstract]  CRISPR/Cas9 system is a recently developed genome editing tool, and its power has been demonstrated in many organisms, including some plant species (Wang et al., 2016). In eukaryotes, the Cas9/gRNA complexes target genome sites specifically and cleave them to produce double-strand breaks (DSBs), which can be repaired by non-homologous end joining (NHEJ) pathway (Wang et al., 2016). Since NHEJ is error prone, mutations are thus generated. In plants, delivery of genome editing reagents is still challenging. In this protocol, we detail the procedure of a virus-based gRNA delivery system for CRISPR/Cas9 mediated plant genome editing (VIGE). This method offers a rapid and efficient way to deliver gRNA into plant cells, especially for those that are recalcitrant to ... [摘要]  CRISPR / Cas9系统是最近开发的基因组编辑工具,其功能已被证实在许多生物体中,包括一些植物物种(Wang等人,2016)。 在真核生物中,Cas9 / gRNA复合物特异性地靶向基因组位点并切割它们以产生双链断裂(DSB),其可以通过非同源末端连接(NHEJ)途径修复(Wang等人, 。,2016)。 由于NHEJ易出错,因此产生突变。 在植物中,基因组编辑试剂的递送仍然是挑战性的。 在本协议中,我们详细介绍了CRISPR / Cas9介导的植物基因组编辑(VIGE)的基于病毒的gRNA传递系统的过程。 该方法提供了将gRNA递送到植物细胞中的快速且有效的方式,特别是对于那些难以转基因农杆菌的方法。

已经报道了基于病毒的基因组编辑技术使用解构DNA病毒和RNA病毒(Baltes等人,2014; Ali等人,2015)。 最近,我们使用了一种完整的双因素病毒 - 卷心菜叶卷曲病毒(CaLCuV)(一种感染广西芥菜科的成员,包括花椰菜的二分酵母病毒),用于高效率 第一次(Yin等人,2015年),其主机之一的基因组编辑(Nicotiana benhamiana)首次进行基因组编辑。

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