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Date:
2016-12-20
[Abstract] RNA sequencing (RNA-seq) has become a popular method for profiling gene expression. Among many applications, one common purpose is to identify differentially expressed genes and pathways in different biological or pathological conditions. This protocol provides detailed procedure for RNA-seq analysis of ~250,000 sorted Drosophila intestinal cells (Chen et al., 2016), in which RNA amplification is not required.
[摘要] RNA测序（RNA-seq）已经成为描述基因表达的流行方法。 在许多应用中，一个共同目的是在不同的生物学或病理学条件下鉴定差异表达的基因和途径。 该方案提供了〜250,000个分选的果蝇肠细胞的RNA-seq分析的详细程序（Chen等，2016），其中不需要RNA扩增。
【背景】RNA-seq的转录组分析已经成为鉴定不同生物或病理条件下差异表达基因和途径的常用方法。 对于产生低mRNA水平的样品，通常在深度测序之前进行RNA或cDNA扩增（Dutta等，2015）。 然而，这个程序可能会潜在地省略以低丰度表达的重要候选人。 在这里，我们提供了不需要RNA扩增的分选的果蝇肠细胞的RNA-seq分析的详细程序。
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