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Q5® High-Fidelity DNA Polymerase

Q5® High-Fidelity DNA Polymerase

Company: New England Biolabs
Catalog#: M0491
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Conditional Knockdown of Proteins Using Auxin-inducible Degron (AID) Fusions in Toxoplasma gondii
Author:
Date:
2018-02-20
[Abstract]  Toxoplasma gondii is a member of the deadly phylum of protozoan parasites called Apicomplexa. As a model apicomplexan, there is a great wealth of information regarding T. gondii’s 8,000+ protein coding genes including sequence variation, expression, and relative contribution to parasite fitness. However, new tools are needed to functionally investigate hundreds of putative essential protein coding genes. Accordingly, we recently implemented the auxin-inducible degron (AID) system for studying essential proteins in T. gondii. Here we provide a step-by-step protocol for examining protein function in T. gondii using the AID system in a tissue culture setting. [摘要]  弓形虫是原生动物寄生虫称为Apicomplexa致命门的一员。 作为一个复杂的模型,关于T的信息有很多。 gondii的8,000多种蛋白质编码基因,包括序列变异,表达和对寄生虫适应的相对贡献。 然而,需要新的工具来功能性地调查数百个推定的必需蛋白质编码基因。 因此,我们最近实施了生长素诱导降解(AID)系统来研究T中的基本蛋白质。弓形虫。 在这里,我们提供了一个检查蛋白质功能的一步一步的协议。 在组织培养环境中使用AID系统。

【背景】生长素是一类通过靶向某些蛋白质在植物中进行蛋白酶体降解而发出信号的植物激素(Teale等人,2006)。 Kohei Nishimura等人具有将该植物特异性信号传导系统的组分转移到其他真核生物中用于有兴趣的蛋白质(POI)的条件调节,创建生长素诱导降解(AID)系统的聪明想法(Nishimura等人,2009)。这个系统已经被成功地用于几种真核生物,包括疟原虫疟原虫(Kreidenweiss et al。,2013; Philip和Waters,2015)。只需要两个转基因成分来实现这个系统,称为转运抑制剂反应1(TIR1)的植物生长素受体和用AID标记的POI。用生长素(例如,3-吲哚乙酸/ IAA)处理活化SCF ...

Single-step Marker Switching in Schizosaccharomyces pombe Using a Lithium Acetate Transformation Protocol
Author:
Date:
2016-12-20
[Abstract]  The ability to utilize different selectable markers for tagging or mutating multiple genes in Schizosaccharomyces pombe is hampered by the historical use of only two selectable markers, ura4+ and kanMX6; the latter conferring resistance to the antibiotic G418 (geneticin). More markers have been described recently, but introducing these into yeast cells often requires strain construction from scratch. To overcome this problem we and other groups have created transformation cassettes with flanking homologies to ura4+ and kanMX6 which enable an efficient and time-saving way to exchange markers in existing mutated or tagged fission yeast strains.

Here, we present a protocol for single-step marker switching by ...
[摘要]  利用不同的选择标记来标记或突变粟酒裂殖酵母中的多个基因的能力受到仅仅两种可选择标记的历史使用的阻碍,即 +和 kanMX6 ;后者赋予抗生素G418(遗传霉素)抗性。最近已经描述了更多的标记物,但是将它们引入酵母细胞通常需要从头开始施加应变。为了克服这个问题,我们和其他团队已经创建了具有与 + 和 kanMX6 的侧翼同源性的转换盒,这使得能够有效和省时的方式在现有的突变或标记的裂变酵母菌株中交换标记。
 在这里,我们提出了裂殖酵母,粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中醋酸锌转化的单步标记转换方案。以下我们将介绍如何将 ura4 + 标记交换到kanMX6 , natMX4 或 hphMX4标记,其分别对抗生素G418,海参(clonNAT)或潮霉素B提供抗性。我们还详细介绍了如何交换营养标记的任何 MX 标记,例如 arg3 + , his3 + , leu1 + 和 ura4 + 。

背景 这种用于粟酒裂殖酵母的单步骤标记交换方案允许将标记有类型的抗生素标记的任何标记或突变的基因替换为营养标记物(含有arg3 + , + ,并且已经构建了 ura4 + )并且为任何 MX交换遗传 ura4 + ...

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