| An Optimized CTAB Method for Genomic DNA Extraction from Freshly-picked Pinnae of Fern, Adiantum capillus-veneris L.
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Author:
Date:
2018-07-05
[Abstract] As the sister clade of seed plants, ferns are significant materials for plant phylogeny research. However, the genomic DNA extraction protocol for fern samples like modified CTAB method still lacks robustness. Here, we found that the amount and condition of the pinnae samples are critical for gDNA extraction in fern, Adiantum capillus-veneris L. In 500 μl CTAB solution, the recommended amount of pinnae is about 10-20 mg (2-3 pieces). The condition of the pinnae must be instantly-picked from a plant cultivated in a suitable environment. With these factors under control, it is highly reproducible to get the high-quality gDNA with low degradation rate
[摘要] 作为种子植物的姐妹分支，蕨类植物是植物系统发育研究的重要材料。 然而，像改良CTAB方法的蕨类样品的基因组DNA提取方案仍然缺乏稳健性。 在这里，我们发现羽片样品的数量和条件对于蕨类植物， Adiantum capillus-veneris L中的gDNA提取至关重要。在500μlCTAB溶液中，推荐的羽片量约为10-20 mg（2-3片）。 必须从在合适环境中栽培的植物中立即采摘羽片的状况。 在控制这些因素的情况下，获得具有低降解率的高质量gDNA具有高度可重复性
【背景】CTAB方法已应用于 Adiantum capillus-veneris L的gDNA提取（Han et al 。，2012; Li et al 。，2017年）。 然而，该方案在我们的实验中仍显示出不稳定性和高降解率。 蕨类植物的羽片积聚了大量的次级代谢产物，如多糖和多酚，这对DNA提取不利（Ponnusamy et al。，2015）。
为了提高gDNA提取的稳健性，我们基本上从两个方面对协议进行了优化：1）减少材料用量，仅使用2-3个羽片（约10-20毫克）。 2）必须从在适宜的培养环境（温度：25℃，湿度：65％，16小时白光/ 8小时黑暗处理）中培养的植物中新鲜采摘羽片，并立即用于DNA提取。 ...
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| A Reliable Assay to Evaluate the Virulence of Aspergillus nidulans Using the Alternative Animal Model Galleria mellonella (Lepidoptera)
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Author:
Date:
2017-06-05
[Abstract] The greater wax moth Galleria mellonella has emerged as an effective heterologous host to study fungal pathogenesis and the efficacy of promising antifungal drugs (Mylonakis et al., 2005; Li et al., 2013). Here, a methodology describing the Aspergillus nidulans infection in G. mellonella larvae, along with insect survival analysis, is reported. This protocol allowed the distinction between virulent A. nidulans strains (such as TNO2A3), which induced high larval mortality rates, to those in which gene deletion was accompanied by reduced pathogenicity such as ∆gcsA and ∆sdeA (Fernandes et al., 2016).
[摘要] 作为一种有效的异源宿主，越来越多的蜡蛾已经出现了一种有效的异源宿主，用于研究真菌发病机制和有希望的抗真菌药物的功效（Mylonakis等人，2005; Li＆ et al。2013）。这里，描述了一种描述构巢曲霉感染的方法。 mellonella 幼虫与昆虫存活分析一起报道。该协议允许区分有毒的 A。造成高幼虫死亡率的构巢组织菌株（如TNO2A3）与基因缺失伴随着致病性降低的病例如ΔGCA和ΔSAA（Fernandes 等人，2016）。
背景 -G。 mellonella 是一种廉价的模型，易于处理，其先天免疫反应与哺乳动物免疫系统分享功能相似性。此外，感染真菌突变菌株的幼虫和小鼠表现出相似的存活率（Brennan等人，2002）。因此，幼虫构成了一种方便的动物宿主，用于在真菌发病机理分析中代替脊椎动物的使用。尽管昆虫模型具有所有优点，但只有少数报告显示了G中曲霉菌感染的作用。蜡螟。该协议描述了一种有效的方法，用于分析G中的构巢曲霉发病机制。 mellonella 幼虫。
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| Isolating and Measuring the Growth and Morphology of Pro-embryogenic Masses in Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze (Araucariaceae)
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Author:
Date:
2016-12-05
[Abstract] Embryogenic suspension cultures of Araucaria angustifolia (Bertol.) Kuntze (Araucariaceae) can be used as a model to test the effects of compounds added to the culture medium on the cellular growth and morphology of Pro-Embryogenic Masses (PEMs). PEMs are formed by embryogenic and suspensor-type cells. To measure changes in the cellular growth of embryogenic cultures, we performed sedimented cell volume (SCV) quantification, which is a non-destructive method. Morphological analysis by microscopy allowed for the observation of growth and development of PEMs and the alterations in embryogenic and suspensor-type cells. The methods used here provide an efficient means for monitoring the cellular growth of PEMs and identifying morphological changes during the development of ...
[摘要] 可以使用南洋杉（Araucaria angustifolia）（Bertol。）Kuntze（Araucariaceae）的胚胎悬浮培养物作为模型来测试添加到培养基中的化合物对前胚胎形成质量的细胞生长和形态的影响PEM）。 PEM由胚胎形成和悬浮细胞形成。为了测量胚胎发生培养物的细胞生长的变化，我们进行沉降细胞体积（SCV）定量，其是非破坏性方法。通过显微镜进行的形态学分析允许观察PEM的生长和发育以及胚胎形成和悬浮体型细胞的改变。这里使用的方法提供了一个有效的手段监测PEM的细胞生长和识别胚胎发育培养发展过程中的形态变化。这些研究还可以与生物化学和分子分析例如蛋白质组学结合，以进一步研究胚胎生长和形态。
关键词：体细胞胚胎发生，大小，沉淀细胞体积
< br=""> [背景] Silveira 等。 （2006）使用SCV测量来分析外源多胺对A的形态学变化的影响。 angustifolia PEMs和Osti等人 。 （2010）测试不同一氧化氮供体对细胞生长和PEM形态的影响。最近，Douétts-Peres等人。 ...
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