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Date:
2016-02-05
[Abstract] An important component of this methodology is to assess the role of the tumor microenvironment on tumor growth and survival. To tackle this problem, we have adapted the original approach of Warburg (Warburg, 1923), by combining thin tissue slices with Stable Isotope Resolved Metabolomics (SIRM) to determine detailed metabolic activity of human tissues. SIRM enables the tracing of metabolic transformations of source molecules such as glucose or glutamine over defined time periods, and is a requirement for detailed pathway tracing and flux analysis. In our approach, we maintain freshly resected tissue slices (both cancerous and non- cancerous from the same organ of the same subject) in cell culture media, and treat with appropriate stable isotope-enriched nutrients, e.g., 13 ...
[摘要] 这种方法的一个重要组成部分是评估肿瘤微环境对肿瘤生长和存活的作用。为了解决这个问题，我们采用Warburg（Warburg，1923）的原始方法，通过将薄组织切片与稳定同位素解析代谢组学（SIRM）组合来确定人体组织的详细代谢活性。 SIRM使得能够在定义的时间段内跟踪诸如葡萄糖或谷氨酰胺的来源分子的代谢转化，并且是详细的途径追踪和通量分析的要求。在我们的方法中，我们保持在细胞培养基中新鲜切除的组织切片（来自同一受试者的相同器官的癌性和非癌性），并用适当的稳定的富含同位素的营养物，例如葡萄糖或13 C 15葡萄糖或13 C 15葡萄糖或13 C 15葡萄糖， - 谷氨酰胺。这些切片可存活至少24小时，并使得有可能消除对靶组织代谢的系统影响，同时保持原始的3D细胞结构。因此，它是用于评估治疗剂对靶组织代谢的影响及其对个体患者的治疗功效的极好的临床前平台（Xie等人，2014; Sellers等人，/em>，2015）。
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