| K+ Release Assay and K+ Measurement in Oocyte Assay
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Author:
Date:
2020-11-05
[Abstract] The Xenopus oocyte is a powerful system for the exogenous expression and functional characterization of plant membrane transport proteins. Until now, a number of potassium transporters and channels have been identified in oocytes expression system by the two-electrode voltage clamp technology. It is difficult to characterize K+/H+ anti-transporters, especially, electroneutral transporter. The K+ efflux assay system enables easy, fast, large-scale measurement of the transporters activity without two-electrode voltage clamp technology. This protocol describes a technique to measure the efflux activity of potassium transporter in oocytes expressing system.
[摘要] [摘要]爪蟾卵母细胞是针对外源表达和植物膜转运蛋白的功能表征一个强大的系统。迄今为止，通过两电极电压钳技术已经在卵母细胞表达系统中发现了许多钾转运蛋白和钾通道。很难表征K + / H +反转运蛋白，尤其是电中性转运蛋白。K +外排测定系统无需两电极电压钳技术即可轻松，快速，大规模地测量转运蛋白的活性。该协议描述了一种测量卵母细胞表达系统中钾转运蛋白外排活性的技术。
[背景[非洲爪蟾卵母细胞中积累了酶，蛋白质和细胞器，这些都可以被利用来生产大量，正确翻译后修饰，正确定点的外来蛋白质（Miller and Zhou，2000）。因此，卵母细胞通过使用两电极电压钳技术提供了一种有效的表达系统，以功能上表征植物膜蛋白。在卵母细胞中表达的第一个植物钾转运蛋白是K +通道（Cao等，1992）。此后，大部分钾通道和转运已经在卵母细胞的研究（Schachtman等人，1994; V é RY等人，1994; Wang和吴，2013年）。但是一些K + / H +反转运蛋白是电中性的，两电极电压钳技术无法表征这些转运蛋白。为了克服这个问题，我们采用了一种新的方法来确定这些转运蛋白的活性，方法是测量孵育前后培养基中钾含量的变化。细胞内ķ +浓度为约70 - 150mM的（韦伯，1999年）。由表达的K +转运蛋白介导的K +外排可引起细胞内和细胞外K ...
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| Activation of Fibroblast Contractility via Cell-Cell Interactions and Soluble Signals
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Date:
2018-09-20
[Abstract] The collagen contraction assay is an in vitro, three-dimensional method to determine the factor(s) affecting the contractile behavior of activated cells such as fibroblasts in either physiological or pathological scenarios. The collagen lattices/hydrogels are seeded with fibroblasts to mimic the interactions between these cells and their surrounding extracellular matrix proteins in the connective tissue. This method is an important platform to assess components as potential therapeutic targets to prevent pathologies such as fibrosis, which are manifestations of hyperactivated fibroblasts. We have described a basic version of this collagen contraction assay, which is amenable to customization using different cell types under diverse experimental conditions.
[摘要] 胶原收缩测定是体外三维方法，用于确定影响生理或病理场景中活化细胞如成纤维细胞的收缩行为的因子。 胶原蛋白晶格/水凝胶用成纤维细胞接种，以模拟这些细胞与其周围细胞外基质蛋白在结缔组织中的相互作用。 该方法是评估组分作为潜在治疗靶标的重要平台，以预防纤维化等病症，这些病症是过度活化的成纤维细胞的表现。 我们已经描述了这种胶原收缩测定的基本版本，其适于在不同实验条件下使用不同细胞类型进行定制。
【背景】细胞外基质的组织收缩和重塑是许多生理条件（例如伤口愈合）中的基本过程。这两种现象的核心是成纤维细胞，它不仅产生和分泌细胞外基质蛋白，而且还可以通过机械相互作用重组它们。有趣的是，这些细胞行为通常在诸如纤维化的病理条件下被夸大（Desmoulière et al。，2005），从而说明需要理解这些过程的分子调节。虽然人们早就知道，胶原蛋白是细胞外基质的主要成分之一，是组织收缩的主要参与者（Bell et al。，1979），对机械细节的透彻理解。这个过程仍然难以捉摸。对体外成纤维细胞胶原基质体外收缩的研究使研究人员能够识别导致组织收缩的新型运动员（Ngo et al。，2006; Su and Chen， 2015年）。基于该测定，可溶性因子如TGFβ（Levi-Schaffer 等，1999）和免疫细胞（Garbuzenko et al。，2002; ...
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| Assessment of Caenorhabditis elegans Competitive Fitness in the Presence of a Bacterial Parasite
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Author:
Date:
2018-08-20
[Abstract] Accurate measurements of an organism’s fitness are crucial for measuring evolutionary change. Methods of fitness measurement are most accurate when incorporating an individual’s survival and fecundity, as well as accounting for any ecological interactions or environmental effects experienced by the organism. Here, we describe a protocol for measuring the relative mean fitness of Caenorhabditis elegans populations, or strains, through an assay that accounts for individual survival, fecundity, and intraspecific competitive ability in the presence of a bacterial parasite. In this competitive fitness assay nematodes from a focal population or strain are mixed with a GFP-marked tester strain in equal proportions, the mixture of nematodes are then exposed to a parasite, and the ...
[摘要] 准确测量生物体的适应度对于衡量进化变化至关重要。当结合个体的生存和繁殖力以及考虑生物体所经历的任何生态相互作用或环境影响时，适合度测量的方法是最准确的。在这里，我们描述了一种用于测量秀丽隐杆线虫种群或菌株的相对平均适合度的方案，该方案通过在细菌寄生虫存在下计算个体存活率，繁殖力和种内竞争能力的测定。在这种竞争性适应性测定中，来自焦点种群或菌株的线虫与GFP标记的测试菌株以相等比例混合，然后将线虫的混合物暴露于寄生虫，并且通过测量来确定焦点菌株的相对竞争适合度。一代后，焦点线虫与GFP标记的线虫的比例发生变化。具体地，可以实施该协议以通过确定进化线虫与祖先线虫群体的相对竞争适合度来测量实验进化后线虫宿主适应度的变化。
【背景】 准确测量适应度和适应度随时间的变化对于确定群体对自然选择的反应至关重要。尽管如此，健康是众所周知难以衡量的，因为它包含了个人的生存，繁殖力，繁殖时间，并且必须考虑到对个体的生态和环境影响。尽管在所有可能的条件下没有用于测量适合度的协议是最佳的，但是考虑到生存和繁殖力的适应度的测量，同时保持生态和环境影响不变，可能提供对给定场景的适合性的可靠总体估计。在这里，我们描述了一个用于测量 C之间相对适应度差异的协议。线虫种群或菌株，用于确定细菌寄生虫存在时进化时间内相对适合度的变化。我们利用革兰氏阴性细菌粘质沙雷氏菌作为 ...
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