Quantitative Nucleocytoplasmic Transport Assays in Cellular Models of Neurodegeneration
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Author:
Date:
2020-06-20
[Abstract] Nucleocytoplasmic transport deficits are suggested to play a role in neurodegenerative disorders, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Given the importance and complexity of this process, understanding when these aberrations occur and which pathways are involved is of great importance. Here, we make use of CRISPR-Cas9 technology to design cell lines stably expressing fluorophore proteins shuttling between the nucleus and cytoplasm by karyopherins of choice. To validate this protocol, we measured an ALS-associated nucleocytoplasmic transport pathway in the presence of the disease-associated peptide poly-PR. This technique allows measuring a particular active nucleocytoplasmic transport pathway in intact cells in a neurodegenerative disease-associated context. Moreover, these ...
[摘要] [摘要]核细胞质运输缺陷被认为在神经退行性疾病中发挥作用,包括肌萎缩性侧索硬化症(ALS)。鉴于这一过程的重要性和复杂性,了解这些畸变何时发生以及涉及哪些途径是非常重要的。在这里,我们利用CRISPR-Cas9技术来设计细胞系,稳定地表达荧光素蛋白在细胞核和细胞质之间穿梭的选择的卡里菲林。为了验证这个协议,我们测量了一个ALS相关的核细胞质运输途径,在疾病相关的多肽poly-PR的存在。这种技术允许测量在神经退行性疾病相关的背景下,在完整细胞中的一个特定的活性核细胞质运输途径。此外,这些实验可以在不需要昂贵的设备的情况下进行,并有可能升级为高通量筛选目的。
[背景]核细胞质运输对细胞稳态至关重要,并通过形成水通道的大型多蛋白复合物穿过核膜,称为核孔复合物(NPCs)(Stoffler et al., 1999; Ryan and Wente, 2000)。虽然这些通道允许小蛋白被动地平衡穿过核膜(被动运输),但大多数蛋白质似乎是由核素主动运输的,即进口蛋白或出口蛋白(主动运输)。含有核定位信号(NLS)的货物蛋白被导入素所定位。已经确定了各种受体介导的导入途径,但最有特色的途径涉及导入素-β1/导入素-α(KPNB1/KPNAx),其中货蛋白含有经典的NLS(cNLS),以SV40大T抗原NLS为例(Lange et al., ...
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H1N1 Virus Production and Infection
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Author:
Date:
2018-10-20
[Abstract] Influenza A virus is a member of orthomyxoviridae family causing wide-spread infections in human respiratory tract. Mouse infection model is widely used in antiviral research and pathogenesis study against influenza A virus. Here, we report a protocol in infected mice with different virus doses and strains to explore how an inhibitor of lysine-specific demethylase (LSD1) impacts disease progression.
[摘要] 甲型流感病毒是正粘病毒科的成员,在人呼吸道中引起广泛的感染。 小鼠感染模型广泛用于抗甲型流感病毒的抗病毒研究和发病机制研究。 在这里,我们报告了受感染小鼠中具有不同病毒剂量和菌株的方案,以探索赖氨酸特异性去甲基化酶(LSD1)的抑制剂如何影响疾病进展。
【背景】甲型流感病毒是正粘病毒科的一员,是一种负义RNA病毒,具有八个分段的单链病毒RNA(vRNA)基因组,编码10种以上的蛋白质。在过去100年中,流感病毒株的爆发经常出现在人群中,包括1918年由H1N1亚型引起的“西班牙流感”,1957年由H2N2引起的“亚洲流感”,1968年由H3N2引起的“香港流感”, “H1N1流感”于1977年发生的“俄罗斯流感”,以及2009年H1N1流行的“猪流感”(Smith et al。>,2009; Lim and Mahmood,2011; Kumar et al。> ,2018年)。季节性甲型流感病毒也在世界范围内传播,容易在人与人之间传播,每年导致全世界300万至500万人住院(Molinari et al。>,2007)。季节性流感感染每年导致290,000-650,000人死亡,主要是年幼儿童,老年人和重症患者(Kumar et al。>,2018)。
流感病毒研究中使用动物模型不仅可以阐明影响疾病结果的病毒和宿主因素,还可以在易感宿主中传播,还可以评估旨在预防或降低流感发病率和死亡率的干预措施(Thangavel和Bouvier,2014)。在本文中,我们使用两种甲型流感病毒,A ...
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Qualitative in vivo Bioluminescence Imaging
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Date:
2018-09-20
[Abstract] Bioluminescence imaging (BLI) technology is an advanced method of carrying out molecular imaging on live laboratory animals in vivo. This powerful technique is widely-used in studying a variety of biological processes, and it has been an ideal tool in exploring tumor growth and metastatic spread in real-time. This technique ensures the optimal use of laboratory animal resources, particularly the ethical principle of reduction in animal use, given its non-invasive nature, ensuring that ongoing biological processes can be studied over time in the same animal, without the need to euthanize groups of mice at specific time points. In this protocol, the luciferase imaging technique was developed to study the effect of co-inoculating pericytes (contractile, αSMA+ mesenchymal ...
[摘要] 生物发光成像(BLI)技术是一种在体内实验室动物上进行分子成像的先进方法。 这种强大的技术广泛应用于研究各种生物过程,是实时探索肿瘤生长和转移扩散的理想工具。 该技术确保实验室动物资源的最佳利用,特别是减少动物使用的伦理原则,考虑到其非侵入性,确保可以在同一动物中随时间研究正在进行的生物过程,而无需安乐死 小鼠在特定的时间点。 在该方案中,开发了荧光素酶成像技术以研究共同接种周细胞(收缩性,αSMA + 间充质干细胞样细胞,位于微血管内的细胞)对生长和转移性扩散的影响。 卵巢癌使用侵袭性卵巢癌细胞系-OVCAR-5-作为例子。
【背景】生物发光成像(BLI)的原理是基于相对简单的生化过程的发光特性,即,荧光素酶介导的分子底物荧光素氧化产生光。在癌症研究中,BLI是一种流行的工具(Contag et ...
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