| In vitro Crosslinking Reactions and Substrate Incorporation Assays for The Identification of Transglutaminase-2 Protein Substrates
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Author:
Date:
2020-06-20
[Abstract] Transglutaminase (TG2) catalyzes protein crosslinking between glutamyl and lysyl residues. Catalytic activity occurs via a transamidation mechanism resulting in the formation of isopeptide bonds. Since TG2-mediated transamidation is of mechanistic importance for a number of biological processes, assays that enable rapid and efficient identification and characterization of candidate substrates are an important first-step to uncovering the function of crosslinked proteins. Herein we describe an optimized and flexible protocol for in vitro TG2 crosslink reactions and substrate incorporation assays. We have previously employed these techniques in the identification of the protein high mobility group box 1 (HMGB1) as a TG2 substrate. However, the protocol can be adapted for ...
[摘要] [摘要]转谷氨酰胺酶(TG2)催化谷氨酰和赖氨酰残基之间的蛋白质交联。催化活性通过转酰胺机制发生，导致异肽键的形成。由于TG2介导的transamidation是一些生物过程的机械重要性，检测，使快速和有效的识别和表征的候选底物是一个重要的第一步，以揭示交联蛋白的功能。在这里，我们描述了一个优化和灵活的协议，用于体外TG2交联反应和底物结合测定。我们以前曾采用这些技术在鉴定蛋白质高流动性基团盒1（HMGB1）作为TG2底物。然而，该协议可以适应任何候选转酰胺化底物的鉴定。
[背景]转谷氨酰胺酶(TG2)是转谷氨酰胺酶家族的成员，催化钙依赖性转酰胺化反应。转谷氨酰胺酶家族包括TG1-7和FXIIIa，以及带4.2的非催化活性成员，在蛋白质支架中发挥作用(Satchwell等，2009；Gundemir等，2012)。TG2在该家族中的独特之处在于，它是无处不在的表达和多向性功能；除了蛋白交联外，TG2还具有蛋白二硫异构酶(Hasegawa等，2003；Mastroberardino等，2006)、G蛋白(Nakaoka等，1994；Baek等，1996；Vezza等，1999)和激酶(Mishra和Murphy，2004；Mishra等，2006和2007)的功能。
蛋白质交联发生在与肽结合的谷氨酰残基(谷氨酰胺供体底物)的γ-羧酰胺基与赖氨酰残基(赖氨酸受体底物)的ϵ-氨基基之间，从而形成ϵ-(γ-谷氨酰)赖氨酸异肽键(Folk和Finlayson，1977)。交联反应的示意图如图1所示。 ...
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| Fluorophore-Based Mitochondrial Ca2+ Uptake Assay
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Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract] The physiological importance of mitochondrial calcium uptake, observed in processes such as ATP production, intracellular calcium signaling, and apoptosis, makes desirable a simple, straightforward way of investigating this event with unambiguous results. The following protocol uses a calcium-sensitive, membrane-impermeable fluorophore to monitor extra-mitochondrial calcium levels in the presence of permeabilized mammalian cells harboring activated mitochondria.
[摘要] 在诸如ATP产生，细胞内钙信号传导和细胞凋亡的过程中观察到的线粒体钙摄取的生理学重要性使得以明确的结果研究该事件的简单，直接的方式成为可取的。 以下方案使用钙敏感的膜不可渗透的荧光团来监测在具有活化的线粒体的透化的哺乳动物细胞存在下的线粒体外钙水平。
【背景】线粒体钙单向转运蛋白（MCU）介导的钙通量是钙进入线粒体的主要方式。线粒体钙由于几个原因是重要的，其中三个原因经常在文献中引用。其一，线粒体中的钙激活Krebs循环中的关键脱氢酶，导致ATP产生增加。最近的一项研究表明，线粒体钙对F1FO-ATP酶和细胞色素链活性有直接影响（Glancy和Balaban，2012），进一步增强其在细胞能量产生中的关键作用。二，由于MCU的低微摩尔亲和力和大量细胞溶质钙线粒体可以隔离，MCU介导的钙摄取也在清除细胞质钙的瞬时增加中起关键作用，反过来，形成使用钙的细胞信号通路作为第二信使（Wheeler et al。，2012）。三，线粒体钙的调节在细胞凋亡的调节中起重要作用（Zoratti和Szabo，1995）。线粒体钙水平的急剧增加通过诱导内膜中线粒体通透性转换孔的开放而引发细胞死亡，这一事件消除了线粒体内部膜电位并从膜间隙释放细胞色素C，暗黑/ Smac和半胱氨酸蛋白酶（ Zoratti和Szabo，1995; ...
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| Xenograft Mouse Model of Human Uveal Melanoma
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Author:
Date:
2017-11-05
[Abstract] Uveal melanoma (UM) is a malignant intraocular tumor in adults. Metastasis develops in almost half of the patients and over 90% of the metastases are in the liver. With the advances in molecular targeting therapy for melanoma, a proper metastasis animal model is of increasing importance for testing the accuracy and effectiveness of systemic therapies. Here, we describe a xenograft model for mimicking human UM liver metastasis by injecting human UM cells into the vitreous cavity in nude mice. The athymic nude mice are immunocompromised and suitable for xenograft tumor growth and metastasis, and intravitreal injection of cells is a quicker and easier operation under a binocular scope, thereby it is simple and effective to test human UM growth and metastasis.
[摘要] 葡萄膜黑色素瘤（UM）是成人中的恶性眼内肿瘤。 几乎一半的患者发生转移，90％以上的转移灶位于肝脏。 随着分子靶向治疗黑色素瘤的进展，正确的转移动物模型对于检测全身治疗的准确性和有效性越来越重要。 在这里，我们描述了一个模仿人类UM肝转移的异种移植模型，通过将人类UM细胞注入裸鼠的玻璃体腔中。 无胸腺裸鼠具有免疫功能低下，适合异种移植瘤的生长和转移，在双眼镜下，玻璃体内注射细胞更快，更容易手术，因此简单有效地检测人类的UM生长和转移。
【背景】UM是成人中最常见的原发性眼内肿瘤，发病率在世界范围内为5至10个/百万（Singh et al。，2011）。几乎一半的患者在初始诊断即使在治疗或/和移除原发性肿瘤后15年内也发生转移（Kujala等人，2003; Weis等人， 2016）。在超过4％的患者中，诊断时已经存在微转移（Finger等人，2005）。这个数字可能会被低估，因为早期的UM检测的限制。目前的药物治疗，例如眼球摘除术，斑块近距离放疗，质子束照射已经成功地去除或抑制早期的局灶性眼内UMs（Dogrusoz等人，2017）。但是一般来说，UM对标准的化学疗法具有抗性，迄今为止还没有有效的全身治疗可用于转移性病变（Goh和Layton，2016; ...
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