{{'Search' | translate}}
 

TWEEN® 20

TWEEN ® 20

Company: Sigma-Aldrich
Catalog#: P2287
Bio-protocol()
Company-protocol()
Other protocol()

Biochemical Analysis of Dimethyl Suberimidate-crosslinked Yeast Nucleosomes
Author:
Date:
2018-03-20
[Abstract]  Nucleosomes are the fundamental unit of eukaryotic chromosome packaging, comprised of 147 bp of DNA wrapped around two molecules of each of the core histone proteins H2A, H2B, H3, and H4. Nucleosomes are symmetrical, with one axis of symmetry centered on the homodimeric interaction between the C-termini of the H3 molecules. To explore the functional consequences of nucleosome symmetry, we designed an obligate pair of H3 heterodimers, termed H3X and H3Y, allowing us to compare cells with single or double H3 alterations. Our biochemical validation of the heterodimeric X-Y interaction included intra-nucleosomal H3 crosslinking using dimethyl suberimidate (DMS). Here, we provide a detailed protocol for the use of DMS to analyze yeast nucleosomes. [摘要]  核小体是真核染色体包装的基本单元,由围绕核心组蛋白H2A,H2B,H3和H4中的每一个的两个分子包裹的147bp DNA组成。 核小体是对称的,一个对称轴以H3分子的C-末端之间的同源二聚体相互作用为中心。 为了探索核小体对称性的功能性后果,我们设计了一对特异性H3异二聚体,称为H3X和H3Y,使我们能够比较具有单一或双重H3改变的细胞。 我们对异二聚体X-Y相互作用的生物化学验证包括使用二甲基琥珀三酸酯(DMS)进行的核内H3交联。 在这里,我们提供了使用DMS来分析酵母核小体的详细方案。

【背景】组蛋白的翻译后修饰影响染色体生物学的各个方面,包括转录,复制,修复和重组。因为核小体包含每个核心组蛋白的两个拷贝,所以修饰可以是对称的(在两个H3尾部上的相同修饰,例如,在核小体内的两个H3尾部上的K27me(Voigt等人

对于单个核小体内H3X-H3Y相互作用的生化验证,我们生成了表达细菌生物素连接酶BirA,N-末端V5-标记的H3X和N-末端生物素接受表位标记的H3Y的酵母菌株(Beckett等人, 1999)。 ...

Conditional Knockdown of Proteins Using Auxin-inducible Degron (AID) Fusions in Toxoplasma gondii
Author:
Date:
2018-02-20
[Abstract]  Toxoplasma gondii is a member of the deadly phylum of protozoan parasites called Apicomplexa. As a model apicomplexan, there is a great wealth of information regarding T. gondii’s 8,000+ protein coding genes including sequence variation, expression, and relative contribution to parasite fitness. However, new tools are needed to functionally investigate hundreds of putative essential protein coding genes. Accordingly, we recently implemented the auxin-inducible degron (AID) system for studying essential proteins in T. gondii. Here we provide a step-by-step protocol for examining protein function in T. gondii using the AID system in a tissue culture setting. [摘要]  弓形虫是原生动物寄生虫称为Apicomplexa致命门的一员。 作为一个复杂的模型,关于T的信息有很多。 gondii的8,000多种蛋白质编码基因,包括序列变异,表达和对寄生虫适应的相对贡献。 然而,需要新的工具来功能性地调查数百个推定的必需蛋白质编码基因。 因此,我们最近实施了生长素诱导降解(AID)系统来研究T中的基本蛋白质。弓形虫。 在这里,我们提供了一个检查蛋白质功能的一步一步的协议。 在组织培养环境中使用AID系统。

【背景】生长素是一类通过靶向某些蛋白质在植物中进行蛋白酶体降解而发出信号的植物激素(Teale等人,2006)。 Kohei Nishimura等人具有将该植物特异性信号传导系统的组分转移到其他真核生物中用于有兴趣的蛋白质(POI)的条件调节,创建生长素诱导降解(AID)系统的聪明想法(Nishimura等人,2009)。这个系统已经被成功地用于几种真核生物,包括疟原虫疟原虫(Kreidenweiss et al。,2013; Philip和Waters,2015)。只需要两个转基因成分来实现这个系统,称为转运抑制剂反应1(TIR1)的植物生长素受体和用AID标记的POI。用生长素(例如,3-吲哚乙酸/ IAA)处理活化SCF ...

Bioassay of Xanthomonas albilineans Attachment on Sugarcane Leaves
Author:
Date:
2017-01-20
[Abstract]  Sugarcane (interspecific hybrids of Saccharum species) is an economically important crop that provides 70% of raw table sugar production worldwide and contributes, in some countries, to bioethanol and electricity production. Leaf scald, caused by the bacterial plant pathogen Xanthomonas albilineans, is one of the major diseases of sugarcane. Dissemination of X. albilineans is mainly ensured by contaminated harvesting tools and infected stalk cuttings. However, some strains of this pathogen are transmitted by aerial means and are able to survive as epiphytes on the sugarcane phyllosphere before entering the leaves and causing disease. Here we present a protocol to estimate the capacity of attachment of X. albilineans to sugarcane leaves. Tissue-cultured ... [摘要]  甘蔗(蔗糖种类的种间杂交种)是一种经济上重要的作物,其在世界范围内提供70%的生食糖生产,并在一些国家对生物乙醇和电力生产作出贡献。由细菌植物病原体Xanthomonas albilineans引起的叶片烫伤是甘蔗的主要疾病之一。传播X。 albilineans主要由受污染的收获工具和感染的茎秆确保。然而,这种病原体的一些菌株通过空中装置传播,并且能够在进入叶子并引起疾病之前作为甘蔗叶片上的附生植物生存。在这里,我们提出一个协议来估计X的附件容量。白皮书到甘蔗叶。将组织培养的甘蔗小植物浸入X的细菌悬浮液中。白皮书和X附件。通过两种方法确定了白皮书:叶片印记(半定量方法)和叶洗/匀浆(定量方法)。这些方法是评估甘蔗叶烫伤病原体菌株/突变体致病性的重要手段。

背景 管理X之间相互作用的机制。 albilineans 和它的宿主植物(甘蔗)不是公知的。 Albicidin是由白念珠菌产生的植物毒素,是已被证明在这种病原体的致病性中发挥作用的唯一分子因子(Birch,2001)。然而,X的致病性。白皮书不完全依赖于albicidin。缺乏Albicidin的突变体仍然能够有效地定殖甘蔗茎并产生疾病症状(Birch,2001; ...

Comments