| In vitro Chaperone Activity Assay Using α-Amylase as Target Protein
|
|
Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] Small heat shock proteins (sHSP) are stress proteins which are ubiquitously found in almost all living organisms. They function as molecular chaperones, which assist in protein folding during translation and in the prevention of irreversible protein aggregation under denaturing conditions. This protocol describes the use of α-amylase as target protein in assessing the chaperone activity of wild and mutant recombinant small heat shock proteins of Mycobacterium leprae. Chaperone activity of these proteins, along with α-crystallin, a standard sHSP was demonstrated using a new method employing their protective effect against heat denaturation of α-amylase from porcine pancreas. The regained enzymatic activity of the α-amylase was demonstrated on starch agar plates stained with ...
[摘要] 小热休克蛋白（sHSP）是在几乎所有生物体中无处不在发现的应激蛋白。 它们作为分子伴侣起作用，这有助于在翻译过程中蛋白质折叠以及在变性条件下预防不可逆的蛋白质聚集。 该协议描述了使用α-淀粉酶作为靶蛋白来评估麻风分枝杆菌的野生和突变重组小热休克蛋白的分子伴侣活性。 这些蛋白质的陪伴分子活性以及标准sHSP的α-晶状体蛋白通过采用其对猪胰α-淀粉酶的热变性的保护作用的新方法被证实。 在用碘 - 碘化钾（I 2 -KI）溶液染色的淀粉琼脂平板上证实α-淀粉酶的重新酶活性。
【背景】热休克蛋白（HSPs）是一组保守的蛋白质，当细胞暴露于外部应激（包括热应激和冷应激）时诱导蛋白质。该组中的大多数成员在功能上与蛋白质折叠和解折叠机制有关。小热休克蛋白（sHSPs）是热休克蛋白的子集，其分子大小为12至43kDa，并且保守的C末端区域称为'α-晶域'。 sHSP通过与部分未折叠的蛋白结合并阻止其完全变性而显示ATP非依赖性分子伴侣活性。有几种用于证明sHSPs的体外伴侣蛋白活性的方法，其使用各种底物蛋白如RuBisCO（Goloubinoff等人，1989），rhodanese（Mendoza等人（Farahbakhsh等，1995），溶菌酶（Rozema和Gellman，1996），苹果酸脱氢酶（Lee等， ...
|
|
|
| Ubiquitin Proteasome Activity Measurement in Total Plant Extracts
|
|
Author:
Date:
2017-09-05
[Abstract] The fine-tuned balance of protein level, conformation and location within the cell is vital for the dynamic changes required for a cell to respond to a given stimulus. This requires the regulated turnover of damaged or short-lived proteins through the ubiquitin proteasome system (UPS). Thus, the protease activity of the proteasome is adjusted to meet the current demands of protein degradation via the UPS within the cell. We describe the adaptation of an intramolecular quenched fluorescence assay utilizing substrate-mimic peptides for the measurement of proteasome activity in total plant extracts. The peptide substrates contain donor-quencher pairs that flank the scissile bond. Following cleavage, the increase in dequenched donor emission of the product is subsequently measured over time ...
[摘要] 细胞内的蛋白质水平，构象和位置的微调平衡对于细胞对给定刺激作出反应所需的动态变化是至关重要的。 这需要通过泛素蛋白酶体系统（UPS）调节受损或短寿命蛋白质的周转。 因此，调节蛋白酶体的蛋白酶活性以满足目前通过细胞内的UPS的蛋白质降解的需求。 我们描述了使用底物 - 模拟肽进行分子内淬灭荧光测定来测定总植物提取物中蛋白酶体活性的适应性。 肽底物含有侧向于剪切键的供体 - 猝灭剂对。 切割后，随后随时测量产物的去质子供体发射的增加，并用于计算相对蛋白酶体活性。
【背景】泛素蛋白酶体系统（UPS）是真核细胞中主要的蛋白质降解机制，因此，UPS对许多细胞过程的调节至关重要，包括信号传导，细胞周期，囊泡运输和免疫。用于营业额的蛋白质通过泛素的共价连接标记，然后被26S蛋白酶体降解。 26S蛋白酶体由两个亚颗粒组成，即20S核心蛋白酶（CP），其分隔蛋白酶活性位点和19S调节颗粒，其将适当的底物识别并转移到CP腔中进行分解。调节蛋白酶体活性以维持蛋白酶抑制以响应内部和外部条件的波动。我们最近显示，UPS涉及植物免疫的几个方面，一系列植物和动物病原体颠覆了UPS来增强其毒力（Üstünet al。，2013;üstünet al。，2014;ÜstünandBörnke，2015 ;Üstünet ...
|
|
|
| Infection of Nicotiana benthamiana Plants with Potato Virus X (PVX)
|
|
Author:
Date:
2016-12-20
[Abstract] Potato Virus X (PVX) is the type member of Potexvirus genus, a group of plant viruses with a positive-strand RNA genome (~6.4 kb). PVX is able to establish compatible infections in Nicotiana benthamiana, a commonly used host in plant virology, leading to mild symptoms, such as chlorotic mosaic and mottling. PVX has been widely used as a viral vector for more than two decades (Chapman et al., 1992; Baulcombe et al., 1995; Aguilar et al., 2015). It provides a feasible means for the systemic expression in plants of heterologous proteins, such as avirulence factors, proteins with pharmacological properties, etc., (Hammond-Kosack et al., 1995; Gleba et al., 2014), and also as a tool to help decipher the function ...
[摘要] 马铃薯病毒X（PVX）是Potexvirus属（一组具有正链RNA基因组（〜6.4kb）的植物病毒）的类型成员。 PVX能够在烟草烟草（Nicotiana benthamiana）中建立相容的感染，这是常用于植物病毒学的宿主，导致轻度症状，如褪色马赛克和斑驳。 PVX已经被广泛用作病毒载体二十多年（Chapman等人，1992; Baulcombe等人，1995; Aguilar等人。它为异源蛋白质植物中的全身表达提供了可行的手段，例如无毒性因子，具有药理学性质的蛋白质，等等（Hammond-Kosack等人， 1995; Gleba等人，2014），并且还作为通过病毒诱导的基因沉默（VACS）（Lacomme和Chapman，2008）帮助解释植物中基因功能的工具。摩擦（A）和农用过滤（B）的两种不同的方案，即允许PVX在N中的有效乘法和传播。本文详细描述本文。摩擦方法需要先前感染的液体，并且通过诱导对叶组织的机械损伤来实现感染，从而允许病毒颗粒穿透植物表面。农杆菌过滤需要先前修饰的农杆菌携带并将PVX序列递送到植物细胞中。将土壤杆菌生长直至饱和，并用注射器将其浸入植物组织中建立感染。这两种方法中的任何一种都可以成功应用，选择应主要基于材料和时间的可用性，但建议在使用嵌合病毒时使用农杆菌滤过。
背景 ...
|
|
|