| Microtubule Seeded-assembly in the Presence of Poorly Nucleating Nucleotide Analogues
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Author:
Date:
2020-08-20
[Abstract] Microtubule dynamic instability is driven by the hydrolysis of the GTP bound to the β-subunit of the α-β tubulin heterodimer. Nucleotide analogues are commonly used to mimic the different steps of the tubulin GTPase cycle, but most of them are poor microtubule nucleators. Usually, microtubule assembly is seeded by guanylyl-(α, β)-methylene-diphosphonate (GMPCPP) or glycerol that can be limiting factors in monitoring the effect of other nucleotide analogs on their polymerization. Here, we describe a protocol that allows the assembly of microtubules in the presence of nucleotide analogues without the need of heterogeneous seeds and at a low final glycerol concentration. Microtubules are first assembled in the presence of the analogue of interest and glycerol to promote assembly. These ...
[摘要] [摘要 ] 微管动态不稳定性是由与α - β 微管蛋白异二聚体的β- 亚基结合的GTP水解驱动的。核苷酸类似物通常用于模拟微管蛋白GTPase循环的不同步骤，但其中大多数是不良的微管成核剂。通常，微管组装是通过胍基-（α ，β ）-亚甲基-二膦酸酯（GMPCPP）或甘油来接种的，它们可能是限制其他核苷酸类似物对其聚合作用的监测因素。 在这里，我们描述了一种协议，该协议允许在核苷酸类似物存在的情况下组装微管，而无需异质种子，并且最终甘油浓度低。首先在感兴趣的类似物和甘油的存在下组装微管以促进组装。然后对这些微管进行超声处理，以产生种子，这些种子将在不存在甘油的情况下用于组装微管。这种策略产生了均质的核苷酸结合的微管，可以通过生化或结构方法（如冷冻电子显微镜）进一步分析。
[背景 ] 核苷酸类似物通常用于研究的构象变化，该α - β 微管组装和水解绑定到其可交换的（E）的网站上的GTP的期间微管蛋白异源二聚体经历。但是，除GMPCPP以外，大多数类似物都是微管成核剂。为克服这一困难，GMPCPP稳定化的种子通常用于存在其他类似物的情况下延长微管（Maurer 等人，2011和2014； Zhang ...
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| Molecular Size Analysis of Recombinant Importin-histone Complexes Using Analytical Ultracentrifugation
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Author:
Date:
2020-05-20
[Abstract] Histones constitute the protein components of nucleosomes. Despite their small sizes, histones do not diffuse through the nuclear pore complex. Instead, they are transported to the nucleus by importins, either alone or in complex with histone chaperones. Determining the molecular size of the importin-histone complexes is key to understanding the mechanism of histone transport and also the potential roles of importins as histone chaperones and in the assembly of nucleosomes. Here we report a simple and reproducible sedimentation-velocity based method to determine the molecular sizes of importin-histone complexes using analytical ultracentrifugation. The method does not use any reporter tags or interaction with column resin thereby analyzing the interactions of the native proteins.
[摘要] [摘要] 组蛋白构成核小体的蛋白质成分。尽管其尺寸很小，但组蛋白不会通过核孔复合物扩散。取而代之的是，它们单独或与组蛋白分子伴侣复合地被重要蛋白转运至细胞核。确定importin-histone复合物的分子大小是理解组蛋白转运机制的关键，也是importins作为组蛋白伴侣和在核小体组装中的潜在作用的关键。在这里，我们报告了一种简单且可重现的沉降速度为基础的方法，该方法使用分析超速离心法来确定importin-histone配合物的分子大小。该方法不使用任何报告子标签或与色谱柱树脂的相互作用，从而分析了天然蛋白质的相互作用。
[背景] 核小体是真核染色质的最基本的结构和功能单元。组蛋白H2A，H2B，H3和H 4是核小体的蛋白质成分。每个核包括147个碱基的DNA wrapp的对编绕Ñ H3-H4四聚体和H2A-H2B二聚体的两个拷贝（Luger的等人，1997年一）。像细胞中的其他蛋白质一样，组蛋白在细胞质中合成。然而，核小体组装在核中。尽管它们的小尺寸（单体是10-15 kDa）的，组蛋白不通过核孔复合物扩散，而是可以单独使用或在复合物与由组蛋白importins伴侣输送要么（约翰逊-SAL IBA 等人，2000 ; Baake 等等人，2001；Mosammaparast 等人，2001，2002a和2002b；Muhlhausser ...
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| Combinations of Patch-Clamp and Confocal Calcium Imaging in Acutely Isolated Adult Mouse Amygdala Brain Slices
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Author:
Date:
2018-08-05
[Abstract] Calcium imaging is a powerful technique in the study of neuronal physiology, as it avoids the enzyme treatment on neurons and is able to study the neuronal activities in vivo. Using calcium-imaging techniques, we are able to monitor the elevation of calcium in the neuron. Furthermore, we can combine calcium imaging with other methods, like whole-cell patch clamp recordings, to detect a single cell calcium signal in brain slices. In this protocol, we describe a detailed confocal imaging method that is combined with whole-cell patch clamp configuration using brain slices (Du et al., 2017).
[摘要] 钙成像是神经生理学研究中的一项强有力的技术，因为它避免了对神经元的酶处理，并且能够研究体内的神经元活动。 使用钙成像技术，我们能够监测神经元中钙的升高。 此外，我们可以将钙成像与其他方法结合起来，如全细胞膜片钳记录，以检测脑切片中的单细胞钙信号。 在该协议中，我们描述了一种详细的共焦成像方法，该方法与使用脑切片的全细胞膜片钳配置相结合（Du et al。，2017）。
【背景】几十年来，脑切片已成功用于研究突触，神经元和神经回路。许多实验操作已经应用于脑切片模型，例如药物应用，细胞内记录和光学成像。与培养的神经元相比，脑切片保留了神经元回路的许多基本功能特性。钙成像是一种广泛使用的技术，旨在表明分离的细胞和组织的细胞内钙（Ca 2 + ）状态。研究脑组织中的细胞内钙可以深入了解各种生理过程，如细胞增殖，信号转导，突触可塑性和细胞死亡，因为钙浓度在这些功能中起着关键作用（Cameron et al。，2016）。钙指示剂是一种荧光分子，它与Ca 2 + ...
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