| Artificial Inoculation of Epichloë festucae into Lolium perenne, and Visualisation of Endophytic and Epiphyllous Fungal Growth
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Author:
Date:
2018-09-05
[Abstract] Natural hosts for the fungal endophyte Epichloë festucae include Festuca rubra (fine fescue) and Festuca trachyphylla (hard fescue). Some strains also form stable associations with Lolium perenne (perennial ryegrass). L. perenne is a suitable host to study fungal endophyte–grass interactions, such as endophytic fungal growth within the plant and epiphyllous growth on the plant surface. Here we provide a detailed protocol based on work by, for artificial inoculation of E. festucae into L. perenne, and newly developed staining and visualization techniques for observing endophytic and epiphyllous hyphae and the expressorium, an appressorium-like structure used by the fungus to exit the plant. The staining method uses a combination of ...
[摘要] 真菌内生菌Epichloëfestucae的天然宿主包括 Festuca rubra （细羊茅）和 Festuca trachyphylla （硬羊茅）。一些菌株也与黑麦草（多年生黑麦草）形成稳定的关联。 升。 perenne 是研究真菌内生菌 - 草相互作用的合适宿主，例如植物内生真菌生长和植物表面的叶生生长。在这里，我们提供了一个基于工作的详细协议，用于 E的人工接种。 festucae 进入 L. perenne ，以及新开发的染色和可视化技术，用于观察内生和附生的菌丝和表达菌，这是一种类似真菌的结构，用于离开植物。染色方法使用葡聚糖结合苯胺蓝二铵盐（AB）和几丁质结合小麦胚凝集素缀合的Alexa Fluor ® 488-（WGA-AF488）的组合。该协议将是研究Epichloë -grass相互作用的有用工具，特别是不同Epichloë - 草关联，各种内生菌 - 宿主发育阶段的比较，以及分析突变Epichloë菌株。
【背景】Latch和Christensen（1985）开发了一种用Epichloë内生菌人工感染草的方案。这项工作一直是广泛的 E的基础。 festucae Fl1- L. perenne 共生研究（Scott et al。，2012年综述）。在我们最近的工作中，我们描述了一种新发现的真菌结构，即能够实现 E的表达式。 ...
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| In vitro Nitrate Reductase Activity Assay from Arabidopsis Crude Extracts
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Author:
Date:
2018-04-05
[Abstract] Nitrate reductase (NR) reduces the major plant nitrogen source, NO3-, into NO2-. NR activity can be measured by its final product, nitrite through its absorbance under optimized condition. Here, we present a detailed protocol for measuring relative enzyme activity of NR from Arabidopsis crude extracts. This protocol offers simple procedure and data analysis to compare NR activity of multiple samples.
[摘要] 硝酸还原酶（NR）将主要的植物氮源NO 3 N-2还原为NO 2 - 2。 NR活性可以通过其最终产物，亚硝酸盐在最佳条件下通过其吸光度来测量。 在这里，我们提供了一个详细的协议，用于测量来自拟南芥粗提物的NR的相对酶活性。 该协议提供简单的程序和数据分析来比较多个样品的NR活性。
【背景】氮是植物所需的主要营养素，主要以硝酸盐的形式吸收。硝酸还原酶是高等植物中首次同化氮的酶。植物硝酸还原酶的同型二聚体如下催化硝酸根的NAD（P）H依赖性还原为亚硝酸根：
NO <3> + NADH + H +→NO - + NAD + H 测量NR活性的方法可能是研究影响NR活性的生物因素的有力工具（Park等人，2011）。氮同化影响植物中氨基酸的含量，因此调节NR活性可用于提高某些作物的质量（Croy和Hageman，1970; Dalling和Loyn，1977; Ruan等人，1998） ）。在该协议中，在优化的缓冲液条件下限制时间内亚硝酸盐浓度增加作为可比值获得。亚硫酸盐浓度通过Griess测定法通过其在540nm处的吸光度来测量。简言之，亚硝酸盐与磺胺酸形成重氮盐，然后N-（1-萘基）乙二胺二盐酸盐形成有色偶氮化合物。可以比较这些值以确定样品如何具有不同的NR活性。此外，通过简单的过程可以将这些数值转换为精确增加的亚硝酸盐浓度。 ...
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| Fluorescein Transport Assay to Assess Bulk Flow of Molecules Through the Hypocotyl in Arabidopsis thaliana
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Author:
Date:
2018-04-05
[Abstract] The bulk transport of molecules through plant tissues underpins growth and development. The stem acts as a conduit between the upper and low domains of the plant, facilitating transport of solutes and water from the roots to the shoot system, and sugar plus other elaborated metabolites towards the non-photosynthetic organs. In order to perform this function efficiently, the stem needs to be optimized for transport. This is achieved through the formation of vasculature that connects the whole plant but also through connectivity signatures that reduce path length distributions outside the vascular system. This protocol was devised to characterize how cell connectivity affects the bulk flow of molecules traversing the stem. This is achieved by exposing young seedlings to fluorescein, for ...
[摘要] 分子通过植物组织的大量运输支撑了生长和发育。茎部充当植物上部和低部位之间的导管，促进溶质和水从根部向茎部系统的运输，糖和其他精细代谢物向非光合器官转运。为了有效地执行此功能，杆需要针对运输进行优化。这通过形成连接整个植物的脉管系统来实现，但也通过连接特征来减少血管系统外的路径长度分布。该协议被设计为描述细胞连接如何影响穿过茎的分子的大量流动。这是通过将幼苗暴露于荧光素而实现的，其中假定没有特定的转运蛋白存在于A中。在给定的暴露时间后，使用共焦显微镜和定量3D图像分析评估该荧光化合物在胚胎干（下胚轴）的单个细胞中的相对浓度。
【背景】结构和功能之间的联系一直着迷于生物学家，从器官的设计空间（Eldredge，1989）到进化路径的趋同或分歧（Morris，2003）。在较小规模的情况下，细胞也以稳健且严格控制的方式组织，与组织执行的功能密切相关（Jackson等人，2017a）。构成特定组织的细胞物理相互作用的集合也可被视为网络，即细胞连接体。这种连接体在植物中特别有趣，因为共享细胞壁阻碍细胞运动，因此网络动力学仅取决于细胞死亡和复制。
我们假设组织结构和细胞连接体与生理特征和器官功能有关。这样，网络指标和定量网络分析可用于预测并获得生物系统的理解（Duran-Nebreda和Bassel，2017; Jackson等人，2017b）。 ...
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