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Magnesium chloride

氯化镁

Company: Sigma-Aldrich
Catalog#: M8266
Bio-protocol()
Company-protocol()
Other protocol()

Isothermal Titration Calorimetry: A Biophysical Method to Characterize the Interaction between Label-free Biomolecules in Solution
Author:
Date:
2018-08-05
[Abstract]  This protocol can be applied to analyze the direct interaction between a soluble protein and a target ligand molecule using Isothermal Titration Calorimetry (ITC, Malvern). ITC allows the biophysical characterization of binding between label-free, non-immobilized and in-solution biomolecules by providing the stoichiometry of the interaction, the equilibrium binding constants and the thermodynamic parameters. ITC monitors heat changes (released and/or absorbed) caused by macromolecular interactions with no restrictions of buffer and molecular weight of the macromolecules. [摘要]  该方案可用于使用等温滴定量热法(ITC,Malvern)分析可溶性蛋白质和靶配体分子之间的直接相互作用。 ITC允许通过提供相互作用的化学计量,平衡结合常数和热力学参数来对无标记,非固定和溶液内生物分子之间的结合进行生物物理表征。 ITC监测由大分子相互作用引起的热变化(释放和/或吸收),而不限制大分子的缓冲液和分子量。

【背景】大分子相互作用是关键的细胞事件,因为它们形成信号转导途径的基础。因此,大分子相互作用是研究的重要领域,因为它们允许更深入地理解作为生理学和病理生理学过程基础的分子机制,以及能够调节引起疾病的大分子结合事件的药物的合理设计。

在这种情况下,等温滴定量热法(ITC)是一种用于表征大分子相互作用的强大技术。 ITC确定两个分子结合时发生的热变化。可以吸收热量(吸热反应)或释放(放热反应)。 ITC通过确定由仪器的加热器提供给参比和样品池的差异功率来监测这种热变化,这是在结合反应期间抵消两个电池之间的任何温差所需的,使得参考之间没有温度差异。和样品细胞(图1)。

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Quantification of Root Colonizing Bacteria
Author:
Date:
2018-07-20
[Abstract]  Here we describe a simple method to quantify the number of viable bacteria (e.g., Enterobacter sp. SA187) that colonize the root system of Arabidopsis thaliana. [摘要]  在这里,我们描述了一种简单的方法来量化活菌的数量(例如, Enterobacter sp。SA187),它们定殖于拟南芥的根系。。

【背景】接种细菌对根的定殖是有益细菌与宿主植物之间相互作用的重要步骤。 肠杆菌 sp。 SA187是一种内生细菌,已从土着沙漠植物 Indigofera argentea 的根瘤中分离出来(Andrés-Barrao et al。,2017; Lafi et al。 ,2017)。 SA187在不同的非生物胁迫(如盐度,干旱或高温)下促进模式植物拟南芥的生长,证明了作为植物生长促进细菌(PGPR)用于提高非生物抗性和产量的重要潜力。干旱地区的农作物SA187可以定殖 A的根和芽。在½MS琼脂平板或土壤中的拟南芥(deZélicourt et al。,2018)。跟踪接种菌株SA187在非寄主植物 A上的命运。 thaliana ,我们应用了常规的培养依赖方法。该方案已成功用于抵抗 A的根和芽的细菌数量。拟南芥植物在不同的非生物胁迫下(deZélicourt et al。,2018)。

Detecting the Interaction of Double-stranded RNA Binding Protein, Viral Protein and Primary miRNA Transcript by Co-immunoprecipitation in planta
Author:
Date:
2018-05-05
[Abstract]  MicroRNAs (miRNAs) play important roles in plant growth, development, and response to infection by microbes. Double-stranded RNA binding protein 1 (DRB1) facilitates the processing of primary miRNA transcripts into mature miRNAs. Recently, we found that NS3 protein encoded by rice stripe virus (RSV) associates with DRB1 and promotes miRNA biogenesis during RSV infection (Zheng et al., 2017). RNA co-immunoprecipitation (RIP) method was applied to identity association patterns among DRB1, NS3, and miRNA transcript. [摘要]  微小RNA(miRNA)在植物生长,发育和微生物感染反应中发挥重要作用。 双链RNA结合蛋白1(DRB1)有助于将初级miRNA转录物加工成成熟的miRNA。 最近,我们发现水稻条纹病毒(RSV)编码的NS3蛋白与DRB1相关并促进RSV感染期间的miRNA生物合成(Zheng等人,2017)。 RNA共免疫沉淀(RIP)方法被用于鉴定DRB1,NS3和miRNA转录物之间的关联模式。

【背景】在双链RNA(dsRNA)结合蛋白HYPONASTIC LEAVES1(DRB1 / HYL1)的帮助下,通过RNA酶III酶DICER-LIKE1(DCL1)从其初级转录物(pri-miRNA) 锌指蛋白SERRATE(SE)。 水稻条纹病毒(RSV)感染广泛地干扰miRNA积累。 我们发现RSV编码的非结构蛋白3(NS3)通过与水稻中的DRB1相互作用下调pri-miRNAs来促进miRNA积累(Zheng等人,2017)。 为了揭示NS3如何增强pri-miRNA的加工,我们使用免疫共沉淀(Co-IP)来说明NS3,DRB1和pri-miRNA体内的关系。 该协议有助于了解两种蛋白质和一种RNA转录本之间的关联模式。

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