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Trizma® base

Trizma ® base

Company: Sigma-Aldrich
Catalog#: T1503
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Expression and Ni-NTA-Agarose Purification of Recombinant Hepatitis C Virus E2 Ectodomain Produced in a Baculovirus Expression System
Author:
Date:
2018-10-05
[Abstract]  In this protocol, we describe the production and purification of the ectodomain of the E2661 envelope protein (amino acids 384-661) of the Hepatitis C virus, which plays a fundamental role in the entry of the virus into the host cell. This protein has been expressed in both prokaryotic and eukaryotic systems but in small quantities or without native protein characteristics. In our case, we use the Baculovirus expression system in insect cells. E2661 is secreted into the extracellular medium and purified by means of affinity chromatography a Ni-NTA-column because the protein has a tag of six histidines at its amino terminal end. The purified protein possesses a native-like conformation and it is produced in large quantities, around 5-6 mg per liter. [摘要]  在该协议中,我们描述了丙型肝炎病毒的E2 661 包膜蛋白(氨基酸384-661)的胞外域的产生和纯化,其在病毒进入中起基础作用。 进入宿主细胞。 该蛋白质已经在原核和真核系统中表达,但是少量或没有天然蛋白质特征。 在我们的例子中,我们在昆虫细胞中使用杆状病毒表达系统。 E2 661 被分泌到细胞外培养基中并通过亲和层析Ni-NTA-柱纯化,因为该蛋白质在其氨基末端具有六个组氨酸的标签。 纯化的蛋白质具有天然样构象,并且大量生产,每升约5-6mg。
【背景】丙型肝炎病毒(HCV)是全世界慢性肝炎,肝硬化和肝细胞癌的主要原因(Major et al。,2001; Alter,2006)。此时,没有HCV疫苗,抗病毒药物用于治疗HCV感染(Imran et al。,2014)。然而,治疗费用昂贵且不是100%有效(Kohli et al。,2014)。 HCV包膜糖蛋白E2负责与细胞受体的相互作用,因此它是研究病毒感染周期的第一步的主要候选者。由于糖基化和聚集,先前的表达系统产生低水平的异质蛋白质,并且难以区分经历生产性和非生产性折叠的分子(Flint ...

A Method for SUMO Modification of Proteins in vitro
Author:
Date:
2018-10-05
[Abstract]  The Small Ubiquitin-related Modifier (SUMO) is a protein that is post-translationally added to and reversibly removed from other proteins in eukaryotic cells. SUMO and enzymes of the SUMO pathway are well conserved from yeast to humans and SUMO modification regulates a variety of essential cellular processes including transcription, chromatin remodeling, DNA damage repair, and cell cycle progression. One of the challenges in studying SUMO modification in vivo is the relatively low steady-state level of a SUMO-modified protein due in part to the activity of SUMO deconjugating enzymes known as SUMO Isopeptidases or SENPs. Fortunately, the use of recombinant SUMO enzymes makes it possible to study SUMO modification in vitro. Here, we describe a sensitive method for ... [摘要]  小泛素相关修饰物(SUMO)是一种蛋白质,其翻译后添加到真核细胞中并可逆地从其他蛋白质中去除。 SUMO和SUMO途径的酶从酵母到人类都很保守,SUMO修饰调节了多种基本细胞过程,包括转录,染色质重塑,DNA损伤修复和细胞周期进程。 研究SUMO修饰体内的挑战之一是SUMO修饰蛋白的相对低的稳态水平,部分原因是SUMO去缀合酶(SUMO Isopeptidases或SENPs)的活性。 幸运的是,使用重组SUMO酶可以在体外研究SUMO修饰。 在这里,我们描述了一种灵敏的方法,用于检测目标人类蛋白质的SUMO修饰,使用来自兔网织红细胞和放射性标记的氨基酸的体外转录和翻译系统。
【背景】与其他泛素蛋白家族修饰一样,SUMO修饰通过ATP依赖性酶促级联发生,涉及E1激活酶(人类中的Aos1 / Uba2异二聚体),E2结合酶(Ubc9)和许多E3连接之一的连续活性。酶(Gareau和Lima,2010)。具有SUMO缀合共有位点的蛋白质ΨKxE(Ψ是疏水残基,其后是赖氨酸,任何氨基酸和谷氨酸),可以通过哺乳动物中表达的一种或几种SUMO旁系同源物(包括SUMO1,SUMO2)进行有效修饰。或SUMO3(统称为SUMO2 / 3,因为它们的序列同源性为97%)(Gareau和Lima,2010; Flotho和Melchior,2013)。 ...

Identifying Protein Interactions with Histone Peptides Using Bio-layer Interferometry
Author:
Date:
2018-09-20
[Abstract]  Histone post-translational modifications (PTMs) regulate numerous cellular processes, including gene transcription, cell division, and DNA damage repair. Most histone PTMs affect the recruitment or exclusion of reader proteins from chromatin. Here, we present a protocol to measure affinity and interaction kinetics between histone peptides and the recombinant protein using Bio-layer interferometry. [摘要]  组蛋白翻译后修饰(PTM)调节许多细胞过程,包括基因转录,细胞分裂和DNA损伤修复。 大多数组蛋白PTM影响从染色质中募集或排除读取蛋白。 在这里,我们提出了一个协议,使用生物层干涉测量法测量组蛋白肽和重组蛋白之间的亲和力和相互作用动力学。

【背景】真核染色质结构大致分为常染色质和异染色质(Cheung和Lau,2005),异染色质结构根据组蛋白翻译后修饰(PTM)的组合进一步细分。这些PTM不仅改变染色质构象,还在基因表达和蛋白质募集中建立直接调节作用(Felsenfeld和Groudine,2003; Allshire和Madhani,2017)。组蛋白PTM的无数组合 - 包括乙酰化,磷酸化,甲基化,泛素化,生物素化,SUMO化和脯氨酸异构化,统称为“组蛋白标记” - 可以被发现,特别是在从核小体核心突出的非结构化N末端尾部( Guetg和Santoro,2012)。这些PTM通过不同“读者”或效应蛋白的活动调节许多细胞过程,包括基因转录,细胞分裂和DNA损伤修复(Suganuma和Workman,2011)(Musselman et al。, 2012)。因此,已经做出很大努力来识别读者的组蛋白修饰。

使用常规方法(例如,表面等离子体共振[SPR]和SPR成像[SPRi]生物传感器)研究读取蛋白与其靶蛋白PTM之间的相互作用通常需要大量底物或复杂的多步实验方法并且由于各种方法特定的限制而变得复杂。这些问题排除了量化相互作用强度的简便性和准确性(Phizicky和Fields,1995; ...

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