| A Protocol for Simple, Rapid, and Direct Detection of SARS-CoV-2 from clinical samples, using Reverse Transcribed Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP)
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Author:
Rawi Naddaf, Nadav Ben-Assa, Tal Gefen, Tal Capucha, Haitham Hajjo, Noa Mandelbaum, Lilach Elbaum, Shai Kaplan, Assaf Rotem, Michal Chowers, Moran Szwarcwort-Cohen, Mical Paul and Naama Geva-Zatorsky,
Date:
2020-10-20
[Abstract] SARS-CoV-2 has quickly spread all around the globe causing illness and wide damages. Most countries were unprepared for such a rapid spread and crisis. This led to various strategies for effective control of the new pandemic. A key aspect in all countries was to effectively test the population for the virus. Most countries chose a lockdown strategy in which many workplaces and activities are completely closed, leading to substantial economy costs. Here, we present a protocol we recently developed that allows rapid and simple detection of SARS-CoV-2 for the large population, eliminating costs and involvement of professional teams and laboratories. This protocol is based on Reverse Transcribed Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP). We tested this protocol directly on patient ...
[摘要] [摘要] SARS-CoV-2在全球迅速蔓延，导致疾病和广泛的损害。大多数国家对如此迅速的蔓延和危机毫无准备。这导致了有效控制这一新流行病的各种战略。所有国家的一个关键方面是对人口进行有效的病毒检测。大多数国家选择了一种封锁战略，即许多工作场所和活动完全关闭，从而导致巨大的经济成本。在这里，我们介绍了一个我们最近开发的协议，它允许对大量人群进行快速和简单的SARS-CoV-2检测，省去了成本和专业团队和实验室的参与。该方案基于反向转录环介导的等温扩增（RT-LAMP）。我们直接在患者样本上测试了该方案，包括鼻腔和喉咙的临床拭子以及唾液。值得注意的是，该方案简单、廉价，并且可以很容易地应用于其他病原体。
[背景] 由新型严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）引起的Covid-19大流行正在影响大量人群，世界卫生组织（WHO）已宣布为大流行。
大规模的人口监测和检疫被证明是应对这场危机的有效策略。检测的关键是逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）试验。虽然这项测试是有效的，但它需要在抽样和执行测试方面的专业经验。此外，试剂和实验室设备昂贵（Bruce等人，2020年）。总之，这给大规模测试带来了瓶颈。
幸运的是，到目前为止，其他的分子生物学方法可以克服这些局限性。其中一种方法是比色环介导的等温扩增（LAMP）（Notomi等人，2000年）。LAMP是在一个单一且恒定的温度（即等温）下进行的，并且允许一步反转录。它的结果可以用肉眼观察到颜色的变化。这种方法成本低廉，几乎不需要实验室设备（Wang等人，2016年；Yu等人，2020年；Zhang等人，2020年）。它可以广泛应用于工作场所和学校等护理点，这可以极大地增加测试对象的数量。我们将这种方法视为一种监测工具，可以显著增加每天的检查总数，并确定患者是否需要在医院进行进一步的检查。 ...
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| Isolation and Analysis of Proteoglycans and Glycosaminoglycans from Archaeological Bones and Teeth
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Author:
Date:
2017-04-05
[Abstract] We have developed methods for isolating proteoglycans and glycosaminoglycans from archaeological bones and teeth. These methods have been previously published (Coulson-Thomas et al., 2015) and are described here in more detail. In the case of glycosaminoglycans, the method was a previously described method (Nader et al., 1999) which we optimized for archeological samples.
[摘要] 我们开发了从考古学骨骼和牙齿中分离蛋白聚糖和糖胺聚糖的方法。 以前已经公开了这些方法（Coulson-Thomas等人，2015），并且在这里更详细地描述。 在糖胺聚糖的情况下，该方法是先前描述的方法（Nader等人，1999），其针对考古样品进行了优化。
【背景】骨组织主要由矿物成分（羟基磷灰石）和由胶原，非胶原蛋白和蛋白聚糖（PG）组成的有机基质组成。 由于与羟基磷灰石紧密结合，细胞外基质蛋白和PG被保护免受死亡后温度和化学药剂的破坏作用。 然而，到目前为止，只有DNA和蛋白质已经从考古学骨骼中成功提取，因此我们开发了从考古学骨骼和牙齿中分离PG和糖胺聚糖（GAG）链的方法。 PGs和GAG在骨形态发生，体内平衡和退行性骨病中起主要作用，从考古骨骼分析这些分子将揭示有价值的古生物学信息。
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| Virus Overlay Assay (Far-Western blotting)
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Author:
Date:
2013-10-05
[Abstract] Virus overlay assay is a method to detect protein-protein interaction in vitro. We performed the virus overlay assay to identify the receptor proteins interacting with the infectious spleen and kidney necrosis virus (ISKNV).
[摘要] 病毒覆盖测定法是一种在体外检测蛋白质 - 蛋白质相互作用的方法。 我们进行病毒覆盖测定，以确定与感染性脾肾坏死病毒（ISKNV）相互作用的受体蛋白。
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