| A Method for Extracting the Nuclear Scaffold from the Chromatin Network
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Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract] Each cell contains many large DNA polymers packed in a nucleus of approx. 10 μm in diameter. With histones, these DNA polymers are known to form chromatins. How chromatins further compact in the nucleus is unclear but it inevitably depends on an extensive non-chromatin nuclear scaffold. Imaging of endogenous chromatin network and the complementary scaffold that support this network has not been achieved but biochemical and proteomic investigations of the scaffold can still provide important insights into this chromatin-organizing network. However, this demands highly inclusive and reproducible extraction of the nuclear scaffold. We have recently developed a simple protocol for releasing the scaffold components from chromatins. The inclusiveness of the extract was testified by the ...
[摘要] 每个细胞都含有许多大型DNA聚合物，其中包含大约一个核。直径10微米。用组蛋白，已知这些DNA聚合物形成染色质。染色质在核中如何进一步致密还不清楚，但它不可避免地依赖于广泛的非染色质核支架。内源性染色质网络的成像和支持该网络的互补支架尚未实现，但支架的生化和蛋白质组学研究仍然可以提供关于该染色质组织网络的重要见解。但是，这需要高度包容和可重复的提取核支架。我们最近开发了一个简单的协议，用于从染色质中释放脚手架组件。提取物的包容性由以下观察结果证实：当从核中提取时，剩余的核染色质被释放为延伸且通常平行的染色质纤维。基本上，该方案包括纯核的产生，用Triton X-100处理细胞核以产生包膜消耗的细胞核（TxN），并在含蔗糖的缓冲液中在500mM NaCl中提取细胞核。 TxN的这个组合提取被称为TxNE。
【背景】通过蛋白质和核糖核蛋白的复杂支架，染色质在细胞核中密集并动态地压缩。与细胞骨架网络不同（Fischer和Fowler，2015），对这种核支架的显微观察在技术上是具有挑战性的。这可能反映了每个细胞核内染色质的主导地位，支架与细胞核交织在一起。核的球形排列也对成像这种支架结构造成挑战。核支架的主要元素是核层（NL）（Gruenbaum和Foisner，2015）。 ...
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| Quantification of Neisseria meningitidis Adherence to Human Epithelial Cells by Colony Counting
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Author:
Date:
2018-02-05
[Abstract] To cause an infection, the human specific pathogen Neisseria meningitides must first colonize the nasopharynx. Upon tight interaction with the mucosal epithelium, N. meningitidis may cross the epithelial cellular barrier, reach the bloodstream and cause sepsis and/or meningitis. Since N. meningitidis niche is restricted to humans the availability of relevant animal models to study host-pathogen interactions are limiting. Therefore, most findings that involve N. meningitidis colonization derive from studies using cultured human cell lines. Human epithelial cells have been successfully used to examine and identify molecular effectors involved in initial adherence of the pathogen. Here, we describe a standard protocol to quantify the adherence of N. ...
[摘要] 为了引起感染，人类特定的病原体脑膜炎奈瑟氏脑必须首先在鼻咽中定居。 与粘膜上皮紧密相互作用时， 脑膜炎双球菌可能穿过上皮细胞屏障，到达血流并引起败血症和/或脑膜炎。 由于 N meningitidis niche限于人类。 因此，大多数涉及N 脑膜炎菌群定植来源于使用培养的人类细胞系的研究。 在最初的病原体坚持。 在这里，我们描述了一个标准协议来量化N的遵守情况。 脑膜炎双球菌对上皮细胞FaDu细胞的作用。 感染后收集的细胞裂解物的集落计数用于量化对上皮细胞的粘附。
【背景】作为细菌发病机制的重要一步。细菌粘附素与宿主细胞表面受体之间的分子相互作用决定了定植位点（Soto and Hultgren，1999）。鼻咽中的上皮层形成人类限制性病原体N的第一个细胞屏障。 meningitidis 遇到和无症状殖民。牢固粘附，并与宿主细胞相互作用可导致上皮细胞和进入血液的渗透，在危及生命的败血症和/或脑膜炎（斯蒂芬斯，2009）得到的。从细菌膜延伸出来的长细丝（称为IV型菌毛（Tfp））与PilC1尖端定位的粘附素在初始依从性中起关键作用。脑膜炎到鼻咽上皮细胞（Marceau等，1995; Rudel等，1995）。 Tfp不仅促进与宿主细胞的相互作用，而且参与细菌聚集体的发育，这可以有助于高水平的粘附和抵抗剪切应力（Helaine等，2005，Mikaty ...
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| Generation of Chemically Induced Liver Progenitors (CLiPs) from Rat Adult Hepatocytes
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Author:
Date:
2018-01-20
[Abstract] Primary mature hepatocytes (MHs) or their progenitor cells are candidate cell sources for cell transplantation therapy in severe liver diseases. However, stable culture of these cells or generation of equivalent cells from pluripotent stem cells has been limited. Using a cocktail of small molecules that we previously found useful in stable culture of multiple types of stem/progenitor cells, we recently established a novel method to generate bipotent liver progenitor cells, named chemically induced liver progenitors (CLiPs), from adult rat MHs. Here, we describe a detailed protocol for the induction of rat CLiPs. We first describe the method to isolate primary rat MHs and then describe how to induce CLiPs from these MHs. In addition, we describe a method to evaluate the bipotentiality of ...
[摘要] 原代成熟肝细胞（MH）或其祖细胞是重症肝病中细胞移植治疗的候选细胞来源。然而，这些细胞的稳定培养或多能干细胞的等效细胞的产生受到限制。我们使用先前在多种类型的干/祖细胞稳定培养中发现有用的小分子混合物，最近建立了一种从成年大鼠MHs产生双能肝脏祖细胞（命名为化学诱导肝祖细胞（CLiPs））的新方法。在这里，我们描述了诱导大鼠CLiPs的详细方案。我们首先描述分离原代鼠MH的方法，然后描述如何从这些MH中诱导CLiPs。另外，我们描述了一种评估产生的CLiPs分化成肝细胞和胆管上皮细胞的双能性的方法。我们还介绍了如何通过长期的文化和详细的示例数据建立稳定的CLiP。可以在2周内产生初级CLiPs，并且可以在2.5-4个月内建立经历10次传代的稳定的CLiPs，批次间变异性。
【背景】对于实现肝病再生医学的新型细胞来源有着强烈的需求。目前唯一的治疗终末期肝病的方法是肝移植，但是由于供者短缺，其应用受到限制。最近，我们小组提出了一种产生能够在体外稳定地扩增的新型LPC的方法，并且可以以广泛的效率重新繁殖慢性肝炎动物模型的损伤肝脏（Katsuda等人， / ...
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