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Yeast Extract

酵母抽提物

Company: BD
Catalog#: 212750
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Other protocol()

Method for CRISPR/Cas9 Mutagenesis in Candida albicans
Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract]  Candida albicans is the most prevalent and important human fungal pathogen. The advent of CRISPR as a means of gene editing has greatly facilitated genetic analysis in C. albicans. Here, we describe a detailed step-by-step procedure to construct and analyze C. albicans deletion mutants. This protocol uses plasmids that allow simple ligation of synthetic duplex 23mer guide oligodeoxynucleotides for high copy gRNA expression in C. albicans strains that express codon-optimized Cas9. This protocol allows isolation and characterization of deletion strains within nine days. [摘要]  白色念珠菌是最普遍和最重要的人类真菌病原体。 CRISPR作为基因编辑手段的出现极大地促进了 C中的遗传分析。白色假丝酵母。 在这里,我们描述一个详细的分步过程来构建和分析 C。 白色念珠菌缺失突变体。 该协议使用质粒,允许合成的双链体23mer引导寡聚脱氧核苷酸在高拷贝gRNA表达的简单连接。 表达密码子优化的Cas9的白色念珠菌菌株。 该协议允许在9天内分离和鉴定缺失菌株。

【背景】℃。白色念珠菌是一种难以处理遗传的有机体。由于它通常作为不容易进行有性生殖的二倍体存在,所以纯合隐性突变需要对每个基因座进行连续修饰。克隆间规则间隔短回文重复(CRISPR)突变的发展和应用。白色念珠菌促进遗传操作,因为它允许两个等位基因同时突变(Vyas et al。,2015; Min et al。,2016; Ng and Dean,2017 )。 CRISPR基因编辑涉及将RNA引导的核酸酶募集至邻近NGG原型间隔子邻接基序(PAM)的互补靶位点(Jinek等人,2012; Cong等人, 2013年;马里等人,2013年)。 CRISPR相关(Cas)核酸酶通过与结合Cas9的激活CRISPR RNA(tracrRNA)相关的指导RNA之间的互补碱基配对以高特异性进行靶向(Gasiunas等人, ...

Metal-tagging Transmission Electron Microscopy for Localisation of Tombusvirus Replication Compartments in Yeast
Author:
Date:
2018-04-20
[Abstract]  Positive-stranded (+) RNA viruses are intracellular pathogens in humans, animals and plants. To build viral replicase complexes (VRCs) viruses manipulate lipid flows and reorganize subcellular membranes. Redesigned membranes concentrate viral and host factors and create an environment that facilitates the formation of VRCs within replication organelles. Therefore, efficient virus replication depends on the assembly of specialized membranes where viral macromolecular complexes are turned on and hold a variety of functions. Detailed characterization of viral replication platforms in cells requires sophisticated imaging approaches. Here we present a protocol to visualize the three-dimensional organization of the tombusvirus replicase complex in yeast with MEtal-Tagging Transmission Electron ... [摘要]  正链(+)RNA病毒是人,动物和植物中的细胞内病原体。构建病毒复制酶复合物(VRC)病毒操纵脂质流动和重组亚细胞膜。重新设计的膜集中了病毒和宿主因子,并创造了促进复制细胞器内VRC形成的环境。因此,有效的病毒复制取决于病毒大分子复合物开启并具有各种功能的特殊膜的组装。细胞中病毒复制平台的详细特征需要复杂的成像方法。在这里我们提出一个协议,用肉眼标记透射电子显微镜(METTEM)可视化酵母中的tombusvirus复制酶复合物的三维组织。该协议使我们能够用METTEM和电子断层扫描成像三维病毒复制酶分子的细胞内分布。我们的研究显示病毒复制酶分子如何在特化细胞膜内构建复制复合物。

【背景】正链RNA病毒的复制取决于细胞膜的重塑。细胞内膜作为VRC装配的结构支架,提供调节病毒复制酶活性和保护病毒RNA免受宿主抗病毒防御的必需脂质和辅因子(Miller和Krijnse-Locker,2008; den Boon <等,2010; nagy和pogany,2011;="" nagy,2016)。电子显微镜观察到具有活性vrc的复制细胞器的结构。="" vrc以单个膜囊或'小球',管状球形立方体膜,双膜囊泡(dmv)或平面寡聚体阵列装配(de="" castro等人,2013)。通常在rna病毒感染的细胞中观察到小球。它们通过在各种细胞器中内陷而形成,并具有对胞质溶胶的狭窄开口(den="" boon="" et=""> ...

Measurement of ROS in Caenorhabditis elegans Using a Reduced Form of Fluorescein
Author:
Date:
2018-04-05
[Abstract]  Oxidative stress is implicated in the pathogenesis of various neurodegenerative diseases, including Alzheimer’s disease. Oxidative stress is a result of a disruption of the equilibrium between antioxidants and oxidants, in favor of oxidants. Since mitochondria are major sites of production and reduction of reactive oxygen species (ROS), measurement of ROS levels can help us determine if mitochondrial functional integrity has been compromised. In this protocol, we describe a method to measure the level of ROS in the nematode Caenorhabditis elegans, using chloromethyl-2’,7’-dichlorodihydrofluorescein diacetate (CM-H2DCFDA). [摘要]  氧化应激涉及各种神经退行性疾病的发病机制,包括阿尔茨海默病。 氧化应激是抗氧化剂和氧化剂之间平衡中断的结果,有利于氧化剂。 由于线粒体是主要的产生和活性氧(ROS)减少的部位,ROS水平的测量可帮助我们确定线粒体功能完整性是否受到损害。 在该协议中,我们描述了使用氯甲基-2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯(CM-H 2),测量线虫秀丽隐杆线虫中ROS的水平的方法,DCFDA)。

【背景】ROS的生命周期与线粒体密切相关。超氧化物是由于线粒体中电子传递链的复合物I和复合物III不可避免地发生电子泄漏而产生的。这种超氧化物然后在线粒体基质和线粒体膜间隙中被过氧化氢歧化。通过这些过程产生的超氧化物和过氧化氢被认为是ROS,其中线粒体负责90%的内源性ROS(Balaban等人,2005)。因此,测量ROS水平将提供对线粒体健康状况的了解。在这里,我们提供了一个协议来确定线虫中的ROS水平。使用CM-H 2 DCFDA(一种还原形式的荧光素的渗透细胞氯甲基衍生物)的线虫。一旦进入细胞内,CM-H 2 DCFDA被细胞内酯酶切割,并且由ROS产生的氧化产生的非荧光H 2 DCF被转化为高度荧光的2 ',7'-二氯荧光素(DCF)。活体C中H 2 DCFDA的荧光强度的成像和测量。 elegans ...

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