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MOPS Buffer grade

MOPS缓冲级

Company: AppliChem
Catalog#: A1076
Bio-protocol()
Company-protocol()
Other protocol()

Preparation of Cell-free Synthesized Proteins Selectively Double Labeled for Single-molecule FRET Studies
Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract]  Single-molecule FRET (smFRET) is a powerful tool to investigate molecular structures and conformational changes of biological molecules. The technique requires protein samples that are site-specifically equipped with a pair of donor and acceptor fluorophores. Here, we present a detailed protocol for preparing double-labeled proteins for smFRET studies. The protocol describes two cell-free approaches to achieve a selective label scheme that allows the highest possible accuracy in inter‐dye distance determination. [摘要]  单分子FRET(smFRET)是研究生物分子的分子结构和构象变化的有力工具。 该技术需要蛋白质样品,该样品是特定位点配有一对供体和受体荧光团的。 在这里,我们提供了一个制备smFRET研究的双标记蛋白的详细方案。 该协议描述了两种无细胞方法来实现选择性标记方案,其允许在染料间距离确定中具有最高可能的准确性。

【背景】单分子FRET(smFRET)是结构生物学中最重要的工具之一,特别是用于分析蛋白质的结构和功能构象变化(Michalet等人,2006; Roy等人。,2008; Sustarsic和Kapanidis,2015)。然而,smFRET的广泛应用在许多情况下受限于合适的蛋白质样品的精细生产。这些蛋白质需要配备两个荧光团,位点特异性连接在蛋白质结构内的不同位置。

经典的基于细胞的蛋白质生产需要一系列耗时的步骤,可以通过使用无细胞蛋白质合成(CFPS)系统来克服,允许更快且直接地生产和选择适当的双标记蛋白质。此外,CFPS的另一个优点是由于几类蛋白质如蛋白酶或膜蛋白对活细胞或其他原因有毒,难以在细胞中表达,可以在CFPS系统中成功合成。最后,CFPS是专注于光谱技术如smFRET的实验室的理想工具,因为细胞培养不是必需的,并且不必考虑重组生物的安全规定。

尽管smFRET所需的样本量本质上很低,但迄今为止,在smFRET研究中,CFPS尚未被标准地用于生产样本。这主要是由于与基于细胞的系统相比蛋白质产量低得多,并且缺乏适当的无细胞方法,其允许适当量的双标记蛋白质的方便合成。然而,正如我们的小组所表明的那样,得益于更高效的正交标记方案(Sadoine ...

Generation of IgG-Fc Glycovariants Using Recombinant Glycosidases and Glycosyltransferases
Author:
Date:
2016-08-05
[Abstract]  The immunoglobulin G (IgG) fragment crystallizable (Fc) domain contains a single, highly conserved asparagine 297 (N297) glycosylation site in the CH2 domain, which is buried within the hydrophobic core of each of the two heavy chains. The biantennary core glycan structure, composed of 2 N-acetylglucosamine (GlcNAc) and 3 mannose residues, can be further decorated with fucose, bisecting GlcNAc and terminal GlcNAc, galactose, and sialic acid. Presence or absence of distinct residues can alter IgG effector functions such as antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) or complement-dependent cytotoxicity (CDC). Here, we provide a protocol for the generation of IgG-Fc de-galactosylated, galactosylated, de-sialylated and sialylated IgG antibodies using recombinant glycosidases and ... [摘要]  免疫球蛋白G(IgG)片段可结晶(Fc)结构域在CH2结构域中包含单个,高度保守的天冬酰胺297(N297)糖基化位点,其掩埋在两条重链的每一条的疏水核内。由2个N-乙酰葡萄糖胺(GlcNAc)和3个甘露糖残基组成的双触角核心聚糖结构可以进一步用岩藻糖,二等分GlcNAc和末端GlcNAc,半乳糖和唾液酸装饰。不同残基的存在或不存在可以改变IgG效应子功能,例如抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)或补体依赖性细胞毒性(CDC)。在这里,我们提供使用重组糖苷酶和糖基转移酶产生IgG-Fc去半乳糖基化,半乳糖基化,去唾液酸化和唾液酸化IgG抗体的方案。

[背景] 糖基转移酶用于抗体聚糖修饰的用途允许将糖底物连接到预先存在的聚糖残基上。免疫球蛋白G在其每个CH2结构域中携带单个高度保守的N-糖基化位点(Arnold等人,2007)(图1),允许用糖基转移酶进行位点特异性聚糖修饰。如果抗体的Fab结构域含有Asn-X-Ser/Thr(X≠Pro)序列(Mellquist等人,1998),则抗体可携带额外的N-聚糖。因此,仔细选择缺少Fab糖基化的单克隆抗体对于Fc特异性聚糖修饰是重要的。本文所述的方案是基于以下出版物开发的(Kingston,2003; Kaneko等人,2006; Anthony等人,2008; Barb等人。,2009; Quast ...

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