| Isolation of Microvascular Endothelial Cells
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Author:
Date:
2018-06-20
[Abstract] The vascular endothelium is essential to normal vascular homeostasis. Its dysfunction participates in various cardiovascular disorders. Murine endothelial cell culture is an important tool for cardiovascular disease research. This protocol demonstrates a quick, efficient method for the isolation of microvascular endothelial cells from murine tissues without any special equipment. To isolate endothelial cells, the lung or heart were mechanically minced and enzymatically digested with collagenase and trypsin. The single cell suspension obtained was then incubated with an anti-CD31, anti-CD105 antibody and with biotinylated isolectin B-4. The endothelial cells were harvested using magnetic bead separation with rat anti-mouse Ig- and streptavidin-conjugated microbeads. Endothelial cells were ...
[摘要] 血管内皮是正常血管稳态所必需的。其功能障碍参与各种心血管疾病。小鼠内皮细胞培养是心血管疾病研究的重要工具。该协议演示了一种快速，有效的方法从小鼠组织中分离微血管内皮细胞而无需任何特殊设备。为了分离内皮细胞，将肺或心脏机械切碎并用胶原酶和胰蛋白酶进行酶促消化。然后将获得的单细胞悬浮液与抗CD31，抗CD105抗体和生物素化的异凝集素B-4温育。使用大鼠抗小鼠Ig-和链霉亲和素缀合的微珠，使用磁珠分离收获内皮细胞。扩张内皮细胞并收集用于随后的分析。这些培养物的形态和表型特征在培养10代以上保持稳定。在任何阶段没有过度生长的非内皮来源的污染细胞。
【背景】微血管内皮细胞通过调节白细胞再循环和作为T淋巴细胞的抗原呈递细胞而在免疫应答的发展中起中心作用。内皮的良好状态对血管稳态很重要。功能失调的内皮参与各种心血管疾病，包括动脉粥样硬化，血管炎和缺血/再灌注损伤（Cid et al。，2004; Wang等人，2007）。因此，体外培养的内皮细胞培养物是研究血管生理学和疾病病理学的重要工具。然而，分离原代鼠类内皮细胞被认为是特别困难的，因为大多数描述的方案涉及用消化酶灌注器官或大血管和耗时的纯化过程（Gumkowski等人，1987） 。
该协议的目的是提供一种简单的方法，不需要使用任何特殊设备即可从肺/心脏中分离和扩展内皮细胞。使用这种方法，我们以前补充了体内研究，证明了CD31信号传导在内皮细胞细胞保护中的重要性（Cheung等人，2015年）。 ...
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| Assessing the Efficacy of Small Molecule Inhibitors in a Mouse Model of Persistent Norovirus Infection
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Author:
Date:
2018-05-05
[Abstract] Human norovirus is the most common cause of acute gastroenteritis worldwide, resulting in estimated mortality of ~210,000 each year, of whom most are children under the age of five. However, norovirus can infect people of all age groups. There is a risk of prolonged infection in children, the elderly and patients who are immunocompromised. To study the inhibition of persistent norovirus replication by small molecule antivirals in vivo, we used a murine norovirus CR6 strain (MNV.CR6). We demonstrated earlier that efficient small molecules can reduce viral shedding in the stool of infected mice. Here we present how to generate the MNV.CR6 virus stock, infect type I and II interferon receptor knockout AG129 mice via oral gavage, administer antivirals to mice, and quantify viral ...
[摘要] 人类诺瓦克病毒是全球急性胃肠炎最常见的原因，估计每年约有210,000人死亡，其中大部分是5岁以下的儿童。 然而，诺如病毒可以感染所有年龄组的人。 儿童，老年人和免疫功能低下的患者有长期感染的风险。 为研究体内小分子抗病毒剂对持续诺如病毒复制的抑制作用，我们使用鼠诺沃克病毒CR6株（MNV.CR6）。 我们之前表明，高效小分子可以减少感染小鼠粪便中的病毒脱落。 在这里，我们介绍如何产生MNV.CR6病毒，通过口服灌胃感染I型和II型干扰素受体敲除AG129小鼠，给小鼠施用抗病毒药物，并量化这些小鼠粪便中的病毒基因组拷贝。
【背景】人诺瓦克病毒是胃肠炎的重要原因。尽管大多数诺罗病毒感染是急性和自限性的，但是在具有免疫缺陷状态的患者中，尤其是在实体器官和造血干细胞移植受体，接受化疗的患者和患有AIDS的患者中，感染可能变成慢性的（Westhoff等人， / em>，2009; Green，2014; Angarone 等。，2016）。在幼儿和老年人中也观察到延长的诺如病毒感染，导致疾病持续时间增加，排便增加和病毒脱落长达47天（Murata等人，2007; ...
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| Coupling Exonuclease Digestion with Selective Chemical Labeling for Base-resolution Mapping of 5-Hydroxymethylcytosine in Genomic DNA
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Author:
Date:
2018-03-05
[Abstract] This protocol is designed to obtain base-resolution information on the level of 5-hydroxymethylcytosine (5hmC) in CpGs without the need for bisulfite modification. It relies on (i) the capture of hydroxymethylated sequences by a procedure known as ‘selective chemical labeling’ (see Szulwach et al., 2012) and (ii) the digestion of the captured DNA by exonucleases. After Illumina sequencing of the digested DNA fragments, an ad hoc bioinformatic pipeline extracts the information for further downstream analysis.
[摘要] 该协议旨在获得CpGs中5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）水平的碱基分辨率信息，而无需亚硫酸氢盐修饰。 它依赖于（i）通过称为“选择性化学标记”（参见Szulwach等人，2012）的方法捕获羟甲基化序列和（ii）通过外切核酸酶消化捕获的DNA。 在消化的DNA片段的Illumina测序之后，特设的生物信息学管道提取信息用于进一步的下游分析。
【背景】基因组DNA中胞嘧啶的甲基化可以被蛋白质读取，并且主要被翻译成基因沉默。基因组中的大多数CpG二核苷酸是甲基化的，包括位于基因调控区如增强子的那些。然而，当需要时，这些CpG可以通过Ten Eleven Translocation（TET）酶将甲基氧化并且通过碱基切除修复系统用未甲基化的胞嘧啶置换来去甲基化。 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）是5-甲基胞嘧啶的第一个氧化衍生物，并且在基因组中绘制该修饰的碱基提供了关于正在进行活性去甲基化的区域的信息。尽管选择性化学标记（SCL）可以非常特异地检测5hmC，但该技术的分辨率受DNA片段大小的限制，特别是当捕获的DNA中存在多个CpG时。为了提高分辨率，我们引入了使用外切核酸酶的消化步骤，所述核酸外切酶将DNA分子修剪成靠近羟甲基化的胞嘧啶（Sérandour et。，2016）。然后对测序读数进行适当的生物信息学处理，然后将羟甲基化评分赋予捕获的CpG。
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