| Method for Multiplexing CRISPR/Cas9 in Saccharomyces cerevisiae Using Artificial Target DNA Sequences
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Author:
Date:
2017-09-20
[Abstract] Genome manipulation has become more accessible given the advent of the CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) editing technology. The Cas9 endonuclease binds a single stranded (single guide) RNA (sgRNA) fragment that recruits the complex to a corresponding genomic target sequence where it induces a double stranded break. Eukaryotic repair systems allow for the introduction of exogenous DNA, repair of existing mutations, or deletion of endogenous gene products. Targeting of Cas9 to multiple genomic positions (termed ‘multiplexing’) is achieved by the expression of multiple sgRNAs within the same nucleus. However, an ongoing concern of the CRISPR field has been the accidental targeting of Cas9 to alternative (‘off-target’) DNA locations within a genome. We ...
[摘要] 鉴于CRISPR（集群定期间隔短回归重复）编辑技术的出现，基因组操纵变得更加易于使用。 Cas9核酸内切酶将募集复合物的单链（单向导）RNA（sgRNA）片段结合到相应的基因组靶序列，引发双链断裂。真核修复系统允许引入外源DNA，修复现有突变或内源基因产物的缺失。通过在同一核内表达多个sgRNA来实现Cas9对多个基因组位置的定位（称为“多重”）。然而，CRISPR领域的持续关注是将Cas9意外地定位到基因组内的替代（“脱靶”）DNA位置。我们将安装的人造Cas9靶序列的使用（称为人造基因座上的Cas9复制）描述为允许（i）与单个sgRNA复用的酵母基因组中的用途; （ii）减少/消除可能的脱靶效应，以及（iii）精确控制预定目标序列的放置。
【背景】CRISPR（集群定期间隔回归重复）机制已经在原核生物中演变为具有很高精度编辑任何基因组的能力的原始适应性免疫系统（Jinek等，2012; Sorek等，2013）。这种生物技术需要使用来自化脓性链球菌（或othologous物种）的内切核酸酶（Cas9），单个RNA'引导'序列和外源供体DNA（如果需要）。仅在短短几年内，CRISPR / ...
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| Primary Culture System for Germ Cells from Caenorhabditis elegans Tumorous Germline Mutants
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Author:
Date:
2017-08-05
[Abstract] The Caenorhabditis elegans germ line is an important model system for the study of germ stem cells. Wild-type C. elegans germ cells are syncytial and therefore cannot be isolated in in vitro cultures. In contrast, the germ cells from tumorous mutants can be fully cellularized and isolated intact from the mutant animals. Here we describe a detailed protocol for the isolation of germ cells from tumorous mutants that allows the germ cells to be maintained for extended periods in an in vitro primary culture. This protocol has been adapted from Chaudhari et al., 2016.
[摘要] 秀丽隐杆线虫种系是胚芽干细胞研究的重要模型系统。 野生型C。 线虫生殖细胞是合胞体，因此不能在体外培养中分离。 相比之下，来自肿瘤突变体的生殖细胞可以完全被细胞化并从突变动物中完整分离。 在这里，我们描述了从肿瘤突变体中分离生殖细胞的详细方案，其允许生殖细胞在体外原代培养中长时间维持。 该协议已从2016年Chaudhari等人改编。
【背景】秀丽生殖细胞在位于两个性腺臂的远端区域的两个成体干细胞龛中产生（Hansen和Schedl，2013; Kimble和Seidel，2013）。在野生型雌雄同体中，有丝分裂生殖细胞仅限于性腺臂的远端，干细胞生态位。野生型生殖细胞是合胞体，并且包含延伸通过性腺臂中心区域的共同细胞质的开口。 ℃。线虫肿瘤种系突变体在整个性腺中增加了生殖细胞的有丝分裂增殖。我们发现肿瘤种系突变体通常具有完整的细胞生殖细胞，其含有完整的质膜（Chaudhari等人，2016）。这种细胞化允许生殖细胞的分离及其在培养中的维持。该方案描述了分离和维持培养物中肿瘤突变体的生殖细胞的方法学和组织培养基。虽然已经描述了用于C的主要培养物的培养基。 elegans 胚胎和幼虫细胞（Strange等人，2007; Zhang和Kuhn，2013），生殖细胞在这种培养基中不能存活（Chaudhari等人。 ...
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| Microvesicle Isolation from Rat Brain Extract Treated Human Mesenchymal Stem Cells
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Author:
Date:
2017-07-05
[Abstract] Microvesicle (MVs) are submicron-sized membranous vesicles that are either actively released from cells via secretory compartments or shed from cell surface membranes. MVs are generated by many cell types and serve as vehicles that transfer biological information (e.g., protein, mRNA, and miRNA) to distant cells, thereby affecting their gene expression, proliferation, differentiation, and function. Although their physiological functions are not clearly defined, recent studies have shown their therapeutic potential for tissue repair and regeneration. While MVs can be isolated readily from mesenchymal stem cells (MSCs) and other cell types from various sources, the yield of MVs under conventional culture condition in vitro is one of the limiting factors for both the in ...
[摘要] 微囊泡（MV）是亚微米尺寸的膜泡囊，其通过分泌室从细胞中积极释放或从细胞表面膜脱落。 MV由许多细胞类型产生并且用作将生物信息（例如，蛋白质，mRNA和miRNA）转移到远端细胞的载体，从而影响其基因表达，增殖，分化和功能。 虽然他们的生理功能没有明确定义，但最近的研究已经显示出其组织修复和再生的治疗潜力。 虽然MV可以从间充质干细胞（MSC）和来自各种来源的其他细胞类型容易地分离，但在体外常规培养条件下MV的产量是限制因素之一， 功能研究以及体外分析分析。 在这里，我们提供了一个通过大鼠脑提取物预处理MSC增加微泡产量的方案。
【背景】通过直接重编程或利用间充质干细胞进行细胞替代治疗来产生神经干细胞或神经细胞是神经变性疾病的潜在选择（Adib等人，2015）。最近的研究已经证明，来自MSC的微泡代表了增强组织再生，例如神经元再生，免疫调节，脑损伤中的血管发生的其他细胞替代方法的新颖且安全的替代方案（Kim等人，2013） ; Porro等，，2015; Lee等人，2016）。对受损组织外源信号如何影响微泡数量和组成的了解甚少。 MSCs的功能分泌物的含量和数量可以根据微环境的显着变化（Qu等人，2007）。例如，已知缺血性脑提取物或缺氧诱导合成有益于组织再生过程的许多细胞因子和生长因子（Chen等，2007; Shin et ...
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