| Mating Based Split-ubiquitin Assay for Detection of Protein Interactions
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Author:
Date:
2017-05-05
[Abstract] The mating based split-ubiquitin (mbSUS) assay is an alternative method to the classical yeast two-hybrid system with a number of advantages. The mbSUS assay relies on the ubiquitin-degradation pathway as a sensor for protein-protein interactions, and it is suitable for the determination of interactions between full-length proteins that are cytosolic or membrane-bound. Here we describe the mbSUS assay protocol which has been used for detecting the interaction between K+ channel and SNARE proteins (Grefen et al., 2010 and 2015; Zhang et al., 2015 and 2016)
[摘要] 基于交配的分ubiquitin（mbSUS）测定是具有许多优点的经典酵母双杂交系统的替代方法。 mbSUS测定依赖于泛素降解途径作为蛋白质 - 蛋白质相互作用的传感器，并且它适用于测定细胞溶质或膜结合的全长蛋白质之间的相互作用。在这里，我们描述了已经用于检测K + 通道和SNARE蛋白之间的相互作用的mbSUS测定方案（Grefen等人，2010和2015; Zhang 等等，2015和2016）
背景 图1是mbSUS测定的概况。泛素部分被分成两半，N末端半突变（NubG）以避免重组。泛素部分（Cub）的C末端一半与转录报告基因复合物PLV（Protein A-LexA-VP16）连接。两种蛋白质（X和Y）分别与NubG和CubPLV融合产生蛋白质 - 蛋白质相互作用分析系统。转化后，酵母菌株THY.AP5含有NubG-X融合蛋白，而酵母菌株THY.AP4含有Y-CubPLV融合蛋白。在交配后，在二倍体酵母中，如果蛋白质X和Y彼此相互作用，则将重新组装功能性泛素，这导致PLV的切割。释放的转录蛋白复合物PLV可以开启报告基因（ADE2，HIS3），并允许酵母生长在选择性培养基上。
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| In vitro Deneddylation Assay
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Author:
Date:
2016-03-20
[Abstract] Nedd8 is a small ubiquitin-like protein (9 kDa) covalently attached to a conserved lysine residue of a cullin protein which is part of cullin-RING ligases (CRLs). CRLs are major E3 ligases important for protein ubiquitination in the ubiquitin-proteasome pathway (UPP). The activity of CRLs is regulated by cycles of neddylation (CulA-N8, ~98 kDa) and deneddylation (CulA ~89 kDa). The COP9 signalosome (CSN) and Deneddylase A (DenA) are capable of cleaving the isopeptide bond between Nedd8 and CullinA. In contrast to the single protein DenA, CSN is an eight subunit multiprotein complex. Protein crude extracts of different Aspergillus nidulans csn deletion strains were mixed with recombinant CSN subunits expressed and purified from Escherichia coli (E. coli). Western ...
[摘要] Nedd8是共价连接到作为cullin-RING连接酶（CRL）的一部分的cullin蛋白的保守赖氨酸残基的小的遍在蛋白样蛋白（9kDa）。 CRL是对泛素 - 蛋白酶体途径（UPP）中的蛋白质泛素化重要的主要E3连接酶。 CRL的活性通过脱甲基化（CulA-N8，〜98kDa）和脱甲基化（CulA〜89kDa）的循环调节。 COP9信号体（CSN）和丁二酸酶A（DenA）能够切割Nedd8和CullinA之间的异肽键。与单一蛋白DenA相反，CSN是八亚基多蛋白复合物。将不同的构巢曲霉csn 缺失菌株的蛋白质粗提物与从大肠杆菌（大肠杆菌）表达和纯化的重组CSN亚基混合。使用抗CulA或抗Nedd8抗体的Western杂交实验可以显示Nedd化化合物与Denedd化CulA的比率。使用deneddylation测定，我们可以显示CsnE是在体外连接7-亚基预组装的CSN的最后一个亚基，然后CSN可以通过金属蛋白酶亚基CsnE执行cullin deneddylation。该测定法是一种快速且非昂贵的方法，其显现了用于脱蛋白的蛋白质的酶活性。它还可用于测试除去来自构巢曲霉（构巢曲霉）或其他生物体中的底物的翻译后修饰的其它藻肽的活性。
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